国际科技合作与交流专项项目(2013DFA32020)
- 作品数：10 被引量：37H指数：4
- 相关作者：彭明廖文彬曾长英杨义伶王斌更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学贵州省亚热带作物研究所更多>>
- 发文基金：国际科技合作与交流专项项目国家高技术研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 木薯MADS-box基因克隆及其响应乙烯信号的表达模式分析被引量：1
- 2013年
- 利用电子克隆技术从木薯基因组DNA中获得1个MADS-box基因,对其理化性质进行分析,并对该蛋白响应激素信号进行研究。结果表明:该基因含有全长为687 bp的ORF,编码229个氨基酸。通过对该蛋白进行ProtScale程序预测表明,该蛋白可能为亲水性蛋白;理化性质分析表明,该蛋白相对分子量为26.103 7 ku,等电点为6.87;跨膜结构域预测表明,该蛋白为非分泌型蛋白;亚细胞定位分析该蛋白可能定位于细胞核;磷酸化位点分析表明该蛋白能被丝氨酸激酶所磷酸化。运用定量PCR对该基因响应乙烯信号的表达模式进行分析,结果表明,该基因能够响应乙烯信号,并在外施乙烯12 h时具有最高的表达量。本研究为进一步研究该基因响应乙烯信号影响木薯叶片的生长发育提供研究基础。
- 廖文彬王淦彭明
- 关键词：木薯MADS-BOX基因电子克隆生物信息学
- 植物离区发育及调控信号的多样性研究进展被引量：1
- 2014年
- 植物器官脱落发生的特定区域叫做离区。植物离区发育及其研究主要集中在番茄、水稻、拟南芥等模式作用与重要的经济作物上。本文主要从植物离区脱落发生的多样性及其调控信号的多样性上进行综述,植物离区脱落的主要形式有:花器官脱落、叶脱落、果实脱落、种子脱落、开裂区脱落、侧根脱落等;主要的调控信号有花发育信号、乙烯与生长素信号、细胞凋亡信号、ROS信号等。旨在为今后经济作物离区相关基因研究提供理论依据和基础,并对今后离区相关研究的前景进行展望。
- 廖文彬杨义伶李雅韵孙建波彭明
- 关键词：基因多样性
- 木薯MeNRT2.1基因的克隆及表达分析被引量：4
- 2016年
- 木薯具有产量高、抗贫瘠等特点,为了了解其耐贫瘠的作用机理,提高木薯在贫瘠土壤中对氮素的利用率,以培养20 d的"华南5号"木薯组培苗为实验材料,采用同源克隆和RT-PCR技术,获得一个高亲和硝态氮转运蛋白(NRT2)基因,命名为Me NRT2.1,该基因含有1 593 bp的开放阅读框架,编码530个氨基酸。生物信息学分析结果表明,木薯Me NRT2.1与苜蓿、拟南芥、可可、杨树等物种的NRT2.1同源性高,其中与可可树Tc NRT2.1的亲缘关系最近,氨基酸相似性达到90%。实时荧光定量PCR检测结果表明,Me NRT2.1在木薯组培苗的根中表达,并且在NO_3^-浓度为0.2 mmol/L时,其相对表达量较高,NO_3^-浓度为10 mmol/L时其相对表达量较低,NO_3^-浓度为0时几乎不表达;Me NRT2.1在茎、叶中也几乎不表达,即该基因具有诱导型组织特异性表达模式。原生质体瞬时表达发现Me NRT2.1定位在细胞膜上。此研究为进一步通过NRT2基因提高木薯的抗逆性奠定了基础。
- 胡春吉邹良平彭明
- 关键词：木薯硝态氮实时荧光定量PCR亚细胞定位
- 植物中氮素利用及硝态氮转运蛋白的研究进展被引量：9
- 2016年
- 硝态氮转运蛋白在植物吸收利用氮素方面发挥主要功能,植物生长发育过程中对氮素的吸收、转运和再利用都需要硝态氮转运蛋白参与调控。目前硝态氮转运蛋白主要分为四类:NRT1(NPF)、NRT2、SLAC/SLAH、CLC。硝态氮在植物吸收、代谢和基因表达方面是一种很重要的信号调控分子,硝态氮转运蛋白可作为植物的硝态氮受体。通过论述氮素代谢过程中硝态氮转运蛋白家族基因的功能和在拟南芥等作物中的研究现状,为作物的抗逆性研究和优良品种的培育提供参考。
- 胡春吉雷宁邹良平彭明
- 关键词：氮素
- 木薯干旱胁迫响应基因MeGSTU7自然变异分析
- 2015年
- 在2个木薯品种中检测MeGSTU7基因在不同干旱胁迫阶段的表达量变化,并克隆测序了60个木薯品种的基因区DNA序列,分析基因核苷酸多态性及其自然变异,并将核苷酸多态性与干旱胁迫表型关联分析,挖掘优等位变异。结果表明,干旱胁迫条件下,2个品种的MeGSTU7的表达量均上调。MeGSTU7基因区核苷酸变异丰富,共有23个SNP位点,A/G突变为主;外显子区总计10个同义突变,12个非同义突变;外显子区在品种资源群体中有4种主要单倍型,所有的单倍型分为两大类,分子进化分析表明,MeGSTU7的外显子区的两端受到很强的正选择作用;Q+K+MLM混合线性模型关联分析结果表明,1个Indel和2个SNP与干旱胁迫下地上部鲜重耐旱系数显著关联,并筛选得到了优等位变异。
- 邓德力王斌曾长英郭鑫彭明
- 关键词：谷胱甘肽转移酶木薯自然变异单倍型
- 干旱胁迫下木薯AP_2转录因子的荧光定量PCR分析被引量：2
- 2014年
- 为研究木薯的两个AP2基因在干旱胁迫下的表达模式,对木薯品种华南5号进行干旱胁迫处理,提取各个时间点离区部位的RNA,以其反转录的cDNA为模板,应用SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测AP2转录因子基因的差异性表达。结果表明,目的基因的熔解曲线都只出现一个峰,说明引物特异性强,且各基因的扩增效率与参照基因Actin接近,试验结果可用2-ΔΔCT计算法进行分析。经分析,两个AP2家族成员在干旱胁迫下均诱导表达,其表达模式不完全相同且存在一定的相关性,这与之前做过的基因芯片杂交结果相符。
- 李雅韵廖文彬王斌杨义伶郭鑫杨子彭明
- 关键词：干旱胁迫荧光定量PCR
- 3个木薯主栽品种对氮浓度梯度的响应被引量：2
- 2015年
- 为研究木薯品种之间的耐低氮能力差异,笔者通过土培盆栽实验,对3个国内推广面积较大的主栽品种NZ199,KU50和SC8进行了由低到高的氮浓度梯度胁迫处理,结果显示,在设定的氮梯度下培养1个月后,同一品种的不同氮水平间及同一氮水平的不同品种间在叶片颜色上具有较好的区分度,氮水平显著影响木薯植株的株高,且以株高在低氮和正常氮之间的比值为氮效率系数,可区分这3个品种的耐低氮能力。进一步通过氮水平和株高拟合了氮肥效应函数,二元方程的系数显示这3个品种的耐低氮能力由高到低的顺序是NZ199>KU50>SC8。
- 曾长英王茜彭明
- 关键词：木薯浓度梯度氮利用效率
- 木薯赤霉素途径DELLA蛋白基因克隆及其对干旱胁迫的响应被引量：7
- 2012年
- 赤霉素(GA)信号转导途径是通过DELLA抑制蛋白来调控的。笔者利用拟南芥DELLA蛋白基因序列,通过电子克隆方法首次克隆了1个木薯DELLA蛋白基因,长度为1857bp,具有完整的蛋白编码框的cDNA序列,命名为MeGAI。生物信息学分析显示,该蛋白具有与拟南芥DELLA蛋白一样的保守结构域,如DELLA结构域、VHYNP结构域、POLY(S/T)结构域、核定位信号、VHVID结构域、亮氨酸结构域、GRAS结构域;该基因在干旱胁迫下的表达模式研究结果表明,该基因在干旱胁迫下是下调表达的;GA生物合成重要基因GA20-氧化酶基因在干旱胁迫下的表达模式研究结果表明,两者在干旱胁迫下的表达模式具有良好的相关性,这说明GA途径可能参与木薯抗旱机制。
- 廖文彬彭明
- 关键词：基因克隆生物信息学分析
- 木薯干旱胁迫下离区发育相关基因MeAP_(2-2)酵母单杂交文库构建及其上游调控基因的筛选被引量：4
- 2015年
- 为了研究干旱胁迫下调节木薯叶片脱落相关的重要节点基因及其分子调控网络,以‘华南5号’木薯为实验材料,通过采用酵母单杂交筛选系统,将Me AP2-2启动子中激素与胁迫相关的元件串联后整合入酵母染色体,构建诱饵菌株;采用SMART技术进行离区c DNA文库的构建,将离区c DNA与p GADT7-Rec表达载体共同转化诱饵菌株,通过同源重组在酵母细胞内筛选Me AP2-2的上游转录调节因子;利用酵母菌落PCR法获得阳性克隆中的c DNA插入片段,测序后在JGI网站进行Blast分析。结果表明,构建的c DNA文库库容为1.5×106,插入片段大小为250-3000 bp。c DNA插入片段经测序和Blast同源性分析和定量PCR分析,筛选出1个metallothionein protein,1个core histone protein,1个heavymetal-associated protein与Me AP2-2相关的调节因子。实验结果证明酵母单杂交文库构建成功,初步筛选获得了调节Me AP2-2的上游调节因子。为研究木薯干旱胁迫下离区发育的信号转导通路奠定了基础。
- 廖文彬李雅韵杨义伶王斌彭明
- 关键词：酵母单杂交SMART技术
- miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析被引量：8
- 2015年
- 通过实时定量PCR方法分析了mi R395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况,靶基因的定量引物设计在与mi RNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示mi R395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温处理和3个靶基因引物位置的表达量均不同,且mi R395abcd在C4和SC124两个品种间4种低温处理的6组两两比较中的相对表达量呈现完美的反向关系。进一步比较发现mi R395abcd与靶基因的负相关性在C4中最好,尤其是位于mi RNA与m RNA结合区上游的a引物的消长关系在AH(驯化后寒害:25~14℃驯化5 d后再降至4℃)和NAH(非驯化寒害:25℃直接降至4℃)中表现得最典型。具体而言,mi R395abcd在C4的AH和NAH处理中上调而在SC124的AH和NAH处理中下调表达,前期表型分析中AH和NAH处理下C4的低温胁迫症状小于SC124,预示着mi R395abcd的上调表达有利于木薯减轻低温伤害,其表达差异能够表征C4和SC124在耐低温性能的表型差异,且mi R395abcd对其靶基因ATRX的调控在木薯低温响应过程中起着正向保护作用。
- 曾长英周玉飞彭明
- 关键词：MI靶基因木薯差异表达分析
