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精氨酸酶Ⅰ的手性选择性被引量：1: 2011年; 运用分子对接和分子动力学模拟方法对精氨酸酶进行手性选择性研究.通过比较精氨酸酶Ⅰ与L,D型精氨酸复合物的结构,发现精氨酸酶Ⅰ与L型精氨酸结合得更紧密.进一步分析比较复合物分子动力学轨迹发现,精氨酸酶Ⅰ与L型精氨酸分子的复合物RMSD曲线的震荡较小,而且酶与L型底物的结合能大于酶与D型底物的结合能.在催化精氨酸脱胍基的反应中,精氨酸酶Ⅰ只选择L型精氨酸分子是基于酶的手性选择性,手性选择性是由酶的活性口袋形状决定的.; 李帅李兆龙胡玉琳高雪峰黄旭日; 关键词：分子动力学分子对接手性精氨酸酶

Theoretical Studies on Structures and Stabilities of C4H2＋ Isomers: 2013年; ZHAO Ying WAN Su-qin LIU Hui-ling HUANG Xu-ri SUN Chia-chung; 关键词：同分异构体 CCSD(T)过渡态势能面

Evaporation-induced Morphology Pattern of Triblock Copolymer A5B10C5 in Thin Film： a Multibody DPD Simulation Study被引量：2: 2014年; LI YangWANG DequanWANG WeiLI YanchunHUANG XuriSUN ChiachungJIN Mingxing; 关键词：三嵌段共聚物薄膜蒸发 DPD 选择性溶剂螺旋线圈

嵌段共聚物组成对薄膜形貌影响的多体耗散粒子动力学研究被引量：2: 2011年; 利用多体耗散粒子动力学(Multibody Dissipative Particle Dynamics,Multibody DPD)方法研究了在溶剂蒸发条件下,嵌段共聚物在表面自组装形成薄膜的过程,分别考虑了两嵌段共聚物和三嵌段共聚物及不同组成对薄膜形貌的影响.模拟得到了无序状薄膜和层状薄膜,并计算了这些薄膜的序参量和薄膜厚度随时间的演化.结果表明,嵌段共聚物的组成对薄膜厚度几乎没有影响,当某种组分的链段很短时,只能形成序参量较小的无序薄膜,相反,则可以得到序参量较大的层状薄膜.; 李延春刘鸿黄旭日孙家锺; 关键词：嵌段共聚物

采用分子动力学模拟方法评价人类VDAC通道蛋白晶体结构的生物活性被引量：3: 2011年; 为研究电压依赖阴离子选择性通道(VDAC)分子的调控机制,在有无电场存在情况下,对Ⅰ型人类VDAC分子(hVDAC1)分别进行了分子动力学模拟研究.结果表明,外加电场的有无与方向变化对hVDAC1分子的运动模式和离子通过过程影响不明显,hVDAC1分子仍然保持以N端α螺旋在β桶内横向运动为主的运动模式.综合模拟结果和相关的实验结果,推测hVDAC1晶体结构不是其发挥生理功能的结构状态.; 孙铁东赵熹黄旭日; 关键词：通透性分子动力学模拟

杂原子掺杂的含单空位缺陷BN纳米管的非线性光学性质被引量：5: 2013年; 采用密度泛函理论(DFT)研究了杂原子M(M=Li,Na,K,Be,Mg,Ca,C和Si)在B/N单空位缺陷处的掺杂对(6,0)BN纳米管体系非线性光学性质的影响.采用B3LYP方法共得到了14种几何构型,并采用BHandHLYP方法计算了这些结构的第一超极化率β0值.研究结果表明,单纯的B或N缺陷几乎不影响BN纳米管体系的非线性光学性质;与B缺陷处掺杂的体系相比,杂原子在N缺陷处的掺杂更有利于提高BN纳米管体系的第一超极化率β0值;对于同周期掺杂原子,还原性越强的原子掺杂对BN纳米管体系的第一超极化率β0值的改善越明显,表现为β0(Ⅰ族)>β0(Ⅱ族)>β0(Ⅳ族);对比同主族掺杂原子,第三周期元素Na和Mg的掺杂能更有效地提高体系的第一超极化率β0值,原因主要在于原子半径和还原性等因素共同决定其对BN纳米管体系第一超极化率β0值的改善程度.本文研究结果为有效提高BN纳米管体系的非线性光学性质提供了一种新思路,为基于BN纳米管的非线性光学材料设计提供了有价值的理论信息.; 石芝铭陈巍万素琴李辉黄旭日; 关键词：密度泛函理论 BN纳米管非线性光学空位缺陷掺杂

Lithium Salt of NH_2-substituted Graphene Nanoribbon with Twofold Donor-acceptor Framework: Large Nonlinear Optical Property: 2011年; Based on graphene, a new class of second-order nonlinear optical(NLO) material, the lithium salt of NH2-substituted graphene nanoribbon with the twofold donor(D)/acceptor(A) mode, was reported. Eight stable 2Li-2NH2-GNR lithium salts, especially cis lithium salts, display considerably large β0 values. The combination of NH2-substituting and cis Li-doping makes β0 greatly increased from 0(GNR) to 1.2×105―2.9×105 a.u.(cis-2Li- 2NH2-GNRs). Our largest β0 value(2.9×105 a.u.) for cis-2Li-1,3-2NH2-AGNR is comparable to the record value of 1.7×105 a.u. for a long donor-acceptor polyene.; SUN Chia-chung; 关键词：非线性光学性质纳米带二阶非线性光学独联体

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国家自然科学基金(21073075)