国家自然科学基金(31070543) 作品数:12 被引量:87 H指数:7 相关作者: 李淑娴 戴晓港 尹佟明 阎毛毛 冒燕 更多>> 相关机构: 南京林业大学 湖北省林业科学研究院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 江苏省高校自然科学研究项目 江苏省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
松属编码区微卫星特征和相应基因功能分析(英文) 被引量:4 2014年 从GenBank下载453 892条松属EST序列,序列组装后得到20 886条contig。用Sputnik软件从这些contig中查找了2 678个微卫星,其中3碱基重复微卫星占的比例最高,为59.2%,而其他重复长度的微卫星都相对较低,比例分别为:2碱基重复微卫星占12.0%,4碱基重复微卫星占13.3%,5碱基重复微卫星占15.5%。3碱基重复微卫星变化引起的基因读码框改变最小,松属树种基因区3碱基重复微卫星的富集显示了强烈的密码子选择效应。此次研究还对查找到的微卫星进行了引物设计和扩增分析。实验结果显示,设计的微卫星引物在云南松中的扩增成功率是72.9%。从扩增成功的引物中进一步选取了155对引物,对14个松属树种和1个黄杉属树种进行了引物通用性实验分析,结果显示155对引物在14个松属树种间的通用性在71.0%以上,而在黄杉属树种中的通用性只有25.2%。对松属树种中含有微卫星的基因进行了功能分类研究,结果显示基因在是否保留微卫星序列方面有显著分化,微卫星参与了如细胞成分分类的共质体组成、病毒颗粒及病毒颗粒组成、生物节律调控,以及生长素转运蛋白等生物学过程。 孔凡明 王小龙 陈赢男 李淑娴 徐进 尹佟明关键词:表达序列标签 微卫星 松属 林木新品种特异性检测研究进展 2011年 在综述国内外相关研究进展的基础上,介绍不同分子标记在植物新品种特异性检测效率方面的差异,并提出比较适用于林木新品种特异性检测的标记技术。 张红 戴晓港 阎毛毛 李淑娴关键词:特异性检测 减压烘干法测定种子含水量的研究进展 被引量:1 2012年 "减压烘干法"是指在减压的条件下将样品干燥的方法。在减压条件下,可降低干燥温度和缩短干燥时间,故此含水量测定方法适用于熔点低,受热不稳定及水分难以驱除的样品。本文对国内外减压烘干法测定植物含水量的研究进行述评,以期为今后开展相关研究提供理论指导。 顾洪彪 李淑娴关键词:含水量 杞柳AFLP反应体系的建立与引物筛选 2012年 以杞柳F1群体为试验材料,采用改良的CTAB法提取基因组DNA,经过酶切、连接、预扩增和选择性扩增,建立杞柳AFLP的反应体系,筛选EcoRI和MseI各16条选择性扩增引物组成256对引物组合。结果表明:320 ng基因组DNA采用5U EcoRI和MseI双酶切6 h,20℃连接12 h,连接产物稀释10倍进行预扩增,预扩增产物稀释15倍进行选择性扩增,选择性扩增产物采用ABI-3130检测,可获得条带清晰的指纹图;从256对引物组合中共筛选出98对多态性较高的引物组合。 戴晓港 渠纪腾 冯凯 张新叶 李淑娴关键词:杞柳 AFLP 引物筛选 Effects of tallowtree seed coat on seed germination 被引量:7 2012年 We measured physiological parameters including water uptake in-vitro embryo germination ratio, and seed coat structure observed by scanning electron microscopy (SEM) to explore the influence of seed coat on the germination of seeds of tallow tree (Sapium sebiferum (Linn) Roxb.). Tallow tree seeds had good water permeability. We found that germination of cabbage seeds was inhibited when cabbage seeds were soaked in extracted solutions from tallow tree seed coat. Seed coat structure at the side of the radicle appeared to be a barrier to seed germination. We tested methods to break tallow tree seed dormancy. Dormancy of tallow tree seeds was overcome by soaking the seeds in 500 mg·L^-1 or 1000 mg·L^-1 GA3, followed by 100 days of cold stratification. LI Shu-xian GU Hong-biao MAO Yan Yin Tong-ming GAO Han-dong松树、杨树及桉树表达基因序列微卫星比对分析 被引量:30 2011年 微卫星是生物基因组中变异频率最快的序列,结构基因中微卫星重复数的变化会引起基因的框移突变,导致基因表达完全不同或截短的蛋白。因此在进化过程中,基因区微卫星会受到强烈选择的影响。为研究基因区微卫星在不同树种中的变化情况,在本研究中,利用SPUTNIK程序分析了NCBI数据库中松树(Pinus spp.)、杨树(Populus spp.)及桉树(Eucalyptus spp.)的表达序列标签(express sequence tag,EST)序列各3万条。结果显示,桉树和杨树EST序列含有微卫星的比例比较接近,分别为18.7%和15.3%,而在松树中则发生了较大分化,只有8.2%。研究发现,三碱基重复单元是这3个树种编码序列中微卫星的主要重复类型。除三碱基重复微卫星外,桉树和杨树EST序列中其它类型微卫星的丰度随着重复单元长度的增加而减少,而在松树中则呈相反现象。同时值得注意的是松树EST序列中变异频率快的微卫星(>20bp)数量明显比桉树及杨树少。研究还发现,3个树种中微卫星获得或丢失重复单元的速率都随着重复单元的增加而降低。本研究首次报道了不同树种基因区微卫星比较研究,发现了一些松树与杨树、桉树相比较EST序列中所含微卫星在丰度及变异频率方面存在的异同。基因所含微卫星序列对基因的功能有重要影响,本研究的结果将为了解不同树种中基因区微卫星的特征提供重要参数,同时也将为利用所研究树种的EST序列开发多态性高的微卫星标记提供有益的生物信息学参考。 阎毛毛 戴晓港 李淑娴 尹佟明关键词:微卫星 表达序列标签 基因组进化 4个美洲黑杨无性系花粉的贮藏与萌发特性 被引量:4 2012年 花粉萌发以及花粉管的伸长是植物能够结实的基础,是植物杂交育种成败的关键。本研究以美洲黑杨4个无性系花粉为试验材料,研究其在不同贮藏条件下花粉生活力的变化情况。结果表明:因切枝水培温度过高(30℃),S 3412和S 3265无性系新鲜花粉的生活力已经为0,而S 3114和S 3804无性系所在的水培温度为20℃,新鲜花粉的萌发率较高,分别为48.02%、31.18%。常温贮藏过程中,S 3114和S 3804无性系花粉生活力下降极快,2 d后花粉全部丧失生活力,因此杨树花粉不宜在常温下贮藏;在冷藏(4)和冷冻(-20℃)条件下,花粉生活力下降较常温贮藏时缓慢,尤以-20℃贮藏条件下生活力要高些。两种低温条件下,S 3114花粉生活力均可保持10 d,S 3804可保持4 d。 张红 冒燕 李淑娴关键词:花粉 生活力 美洲黑杨 无性系 贮藏 白蜡种子发芽能力检测方法 被引量:7 2012年 采用离体胚法和四唑染色法分别测定了白蜡(Fraxinus chinensis Roxb.)种子的生活力,并采用5种不同的处理方法测定了该种子的发芽率。结果表明:四唑染色法测定种子的生活力为66.0%,离体胚法测定的生活力为70.5%。发芽率测定中,清水浸种21 d或用200 mg.L-1赤霉素浸种60 h后白蜡种子的发芽率较高,分别为60.5%和59.5%。采用相同质量浓度的赤霉素分别浸种36、48 h后,发芽率分别为49.25%和53.5%,远低于前2个处理的发芽率结果。同批种子采用浸种1 d、再去除果翅的方法测得的发芽率仅为22%。从种子发芽能力各测定法历时天数来看,四唑染色法所需时间最短,约为8 d;清水浸种需要时间最长,为34 d;而离体胚法和赤霉素浸种60 h的处理分别需要15.0、17.5 d。可见,某些单位采用清水浸种1 d即进行发芽试验的方法不能准确测定种子的发芽率,赤霉素处理是白蜡种子发芽率测定的较好方法。 李淑娴 冒燕 姜荧荧关键词:白蜡 生活力 发芽率 马尾松、黄山松及其杂种域球果形态和种子性状变异 被引量:8 2012年 以采自安徽黄山风景区不同海拔的松树球果、种子为研究材料,测定了球果长、球果宽、球果长宽比、种子饱满度、发芽率和千粒质量6项指标,并分析了这些指标随海拔的变化情况。结果表明:随着海拔的升高,球果长、球果宽、长宽比减小;杂种域个体种子的饱满度、发芽率、千粒质量指标均值小于黄山松和马尾松,杂种域的这种变化可能与马尾松和黄山松两个种存在种间生殖障碍有关。对3个种群球果和种子变异的F检验表明,这些指标的变异主要来自植株间,植株的多型现象明显。 渠纪腾 阎毛毛 戴晓港 李淑娴关键词:马尾松 黄山松 球果 海拔 环境条件和播后覆土对水杉种子出苗率的影响 被引量:8 2012年 以2009年秋天采自湖北利川小河的水杉种子为研究对象,测定了水杉种子的千粒重、饱满度和发芽率,并研究了遮荫对水杉种子出苗率的影响,同时对水杉田间人工育苗和不同立地上的自然出苗率进行了比对。通过上述实验,对水杉天然更新能力差的原因从种苗学角度上进行了分析。结果表明:水杉种子空粒率很高,约为85%,种子的绝对发芽率大于68%。由于原产地水杉结实量很大,所以水杉种子仍具有较强的繁殖能力,繁殖能力不是导致水杉天然更新能力差的主要原因。同时,还发现光照条件对水杉种子发芽率也无明显影响,而整地、覆土等对水杉种子出苗率和出苗速度影响显著。通过适当的人工育苗措施,水杉种子有较高的成苗数。研究发现,水杉天然更新能力差的主要原因是在出苗环节上。通过分析,我们提出生态保护和采用实生苗造林是解除水杉濒危状况的重要举措。本研究从种苗学角度,为了解水杉的濒危机制提供了实验依据。 李淑娴 姚亚莉 戴晓港 尹佟明 高捍东关键词:水杉 千粒重 发芽率 自然更新