四川省教育厅资助科研项目(08Zb051)
- 作品数：6 被引量：10H指数：2
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 一种经济、简便和准确鉴定重组质粒的方法被引量：2
- 2010年
- 目的:提高重组质粒的筛选效率,探讨一种经济、快速并准确的重组质粒鉴定方法。方法:取200μl菌液于Eppendorf管中高速离心1min,倒出上清,沉淀中加入20μl裂解缓冲液以裂解细胞并释放出内部质粒,10000r/min离心10min后取5～10μl上清液进行琼脂糖凝胶电泳,并比较其迁移位置来以判断重组质粒。结果:该方法鉴定结果和PCR鉴定结果完全一致。结论:该方法具有成本低廉、简便快速的特点,在对大量样品进行鉴定时具明显优势,适合在常规实验室推广。
- 范晶梁梓伏秦超廖金花黄明远
- 关键词：重组质粒琼脂糖凝胶电泳
- 番茄LeNHX2基因的生物信息学分析
- 2009年
- 应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX2蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析,结果表明此蛋白为疏水性不稳定蛋白,包含一个氨氯吡嗪咪结合位点FFFLFLLPPI区域,相对分子量为58.6kD,等电点为5.50,可能存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,同源性分析发现番茄LeNHX2和其它植物的Na+/H+反转运蛋白同源性较低,但LeNHX2具有一个Na+/H+交换结构域和氨氯吡嗪咪结合位点,由此可推断LeNHX2是一个耐盐相关基因,在提高植物的耐盐能力方面可能有重要作用。
- 范晶
- 关键词：番茄生物信息学
- 生物信息学对番茄LeNHX1基因的研究被引量：1
- 2009年
- 应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX1蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析。结果表明此蛋白为疏水性稳定蛋白,包含一个保守的氨氯吡嗪咪结合位点LFFIYVLPPI区域,相对分子量为59.0kD,等电点为6.60,存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,功能分类和蛋白质同源性分析表明番茄LeNHX1属于液泡膜Na+/H+反向转运蛋白。
- 范晶代娟胡建平梁梓黄明远
- 关键词：生物信息学番茄
- 番茄LeNHX1基因植物过量表达载体的构建及表达分析
- 2010年
- 从番茄幼苗中提取RNA,根据NCBI中番茄LeNHX1基因序列设计引物,通过RT-PCR获得了番茄LeNHX1基因的cDNA序列,包含一个1 605 bp的开放阅读框,编码534个氨基酸。将cDNA序列连接到植物过量表达载体PBI121上,对所获得的重组质粒进行双酶切鉴定,结果表明,植物过量表达载体PBI121-LeNHX1已构建成功。半定量RT-PCR结果表明LeNHX1基因在根、茎和叶中均表达,盐、低温和脱落酸的诱导能提高LeNHX1基因的表达量,推测番茄LeNHX1基因在逆境应答中可能起着重要作用。
- 范晶雷常安黄明远刘超梁梓陈丽萍王永建
- 关键词：番茄
- 番茄LeNHX3基因的生物信息学分析被引量：6
- 2009年
- 应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行了分析,结果表明,番茄LeNHX3蛋白为疏水性稳定蛋白,包含一个高度保守的具有氨氯吡嗪咪结合位点的LFFIYLLPPI结构功能域,相对分子量为59.4kD,等电点为8.54,可能存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲;蛋白质同源性分析后,发现番茄LeNHX3蛋白和紫高杯花、矮牵牛花2种植物的Na+/H+反转运蛋白高度同源,序列相似性为90%。
- 范晶胥成浩张西玉刘超黄明远
- 关键词：番茄生物信息学
- 番茄LeNHX3基因的克隆与植物过量表达载体的构建被引量：1
- 2010年
- 从番茄幼苗中提取RNA,根据TIGR基因索引数据库中番茄LeNHX3基因序列设计引物,通过RT-PCR获得了番茄LeNHX3基因的cDNA序列,包含一个1 614 bp的开放阅读框,编码537个氨基酸。将cDNA序列连接到植物过量表达载体PBI121上,对所获得的重组质粒进行双酶切鉴定,结果表明植物过量表达载体PBI121-LeNHX3已构建成功。
- 范晶
- 关键词：番茄
