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云南省教育厅自然科学研究基金(5Y0171B): 作品数：10 被引量：114H指数：6; 相关作者：刘雅婷李永忠郑元仙李正跃徐小刚更多>>; 相关机构：云南农业大学云南省植物病理重点实验室云南省烟草科学研究所更多>>; 发文基金：云南省教育厅自然科学研究基金云南省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

番茄斑萎病毒属ssRNA-M序列比对分析被引量：4: 2009年; 番茄斑萎病毒属(Tospovirus)是布尼亚病毒科唯一的植物病毒属,在热带、亚热带以及温带地区引起许多作物和花卉严重病害的发生.该研究利用DNAstar、DNAman等软件对其RNA-M编码G1G2蛋白和NSm非结构蛋白的核酸和蛋白质序列进行分析,发现Tospovirus属病毒的G1G2蛋白和NSm非结构蛋白序列的长度和GC含量在不同病毒种间变异不大,同时得出序列比对图和一致性(Identity)的值、同源性(Homolog tree)的值和系统进化树(Phylogenetic tree)的值,并发现根据NSm蛋白质序列划分的2个相似性组与前人划分的血清组非常接近.; 刘雅婷李鑫李永忠李正跃李成云朱有勇; 关键词：番茄斑萎病毒属非结构蛋白

生物入侵风险分析的研究进展被引量：41: 2010年; 随着全球经济一体化的加快,外来物种入侵对中国生态环境带来非常严重的危害和巨大的经济损失。生态位模型(ecologicalniche models,ENMs)为外来入侵生物的风险分析提供了重要的定量化分析工具,已经广泛应用于入侵生物适生区的预测,但如何评价不同模型之间的预测效果成了当代研究的热点问题。介绍了4种生态位模型对其应用原理和分析方法进行比较。在这4种模型中:MAXENT和GARP是利用物种的已知分布数据和环境数据产生以生态位为基础的物种生态需求,然后研究生物多样性和物种的潜在分布;CLIMEX是通过物种在已知地理分布区域的气候参数来预测物种的潜在地理分布,CLIMEX运行结果的EI值是一个相对值,反映了物种在各地分布的相对丰度,并能以图表的形式表现出来;GIS即可以单独构建对目标物种的适生区预测,也可以与其他模型相结合,主要用到了他的两个功能:插值和叠加。; 孙文涛刘雅婷; 关键词：外来入侵物种 CLIMEX GARP MAXENT

昆明蜘蛛兰和喜林芋上发现番茄斑萎病毒属病毒被引量：4: 2009年; 刘雅婷郑元仙李永忠徐小刚李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒喜林芋蜘蛛园林花卉症状表现经济损失

番茄斑萎病毒在烟草植株上症状学特征被引量：6: 2009年; 通过2006年间在美国北卡罗来那州烟草主要生产区的田间调查,系统的描述了番茄斑萎病毒侵染烤烟后,在烤烟叶片上产生的叶片畸形、镶脉、叶脉坏死、坏死斑、同心环纹、叶面皱缩,且整株出现矮化异常生长;将番茄斑萎病毒采用人工摩擦接种到本生烟上,植株被系统侵染,并产生褪绿斑坏死斑、同心环纹、皱缩等症状,植株一般4～5周内死亡。通过比较两种寄主,发现番茄斑萎病毒侵染两种寄主均出现系统症状,症状相似,但也有不同。; 刘雅婷郑元仙李永忠徐小刚孙文涛李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒症状学烟草

布尼亚病毒科全基因组序列比对分析被引量：8: 2008年; 布尼亚科病毒(Bunyaviridae)是一类医学和农业上的重要病毒。本文从NCBI数据库下载具有完整基因组序列的布尼亚科病毒的5个属20种病毒的序列,用生物学软件DNAman,DNAstar进行比对分析,发现布尼亚科病毒属中的植物病毒在核酸序列及蛋白结构上与动物病毒有很大差异:(1)只有植物病毒的M基因组能编码NSm运动蛋白;(2)植物病毒和动物病毒在核酸序列和蛋白质序列长度均有差异,表明该科病毒是进化速度较快的病毒;(3)植物病毒核酸序列的GC含量低于动物病毒;(4)通过SMART网络软件进行蛋白质拓扑结构分析发现植物病毒和动物病毒在糖蛋白GnGc的结构上存在显著差异;(5)植物病毒糖蛋白结构较为复杂,有较多的紊乱区域,除INSV外,其他病毒都具有N端信号肽。这将对以后分子生物学检测中引物的设计及病毒的鉴定等方面的研究起到积极的作用。; 刘雅婷张文超李正跃李成云朱有勇李永忠; 关键词：番茄斑萎病毒属 SMART

云南省建水县番茄上Tospovirus属病毒的初步鉴定被引量：4: 2009年; 2005—2006年对云南省主要蔬菜种植区昆明、红河和楚雄等3个地区进行调查,获得9份疑似番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒的样本。通过该属病毒引物(Tospovirus Group Primer)进行RT-PCR扩增,其中1份来自红河州建水县番茄上的样品获得约500bp核酸片段,通过NCBIBLAST网络数据库比对,确定为Tospovirus属的病毒;应用DNAMAN软件与已经公布的Tospovirus属病毒LRNA序列比对分析,从得到的相似性树状图可以看出,该样品与血清组Ⅳ的Tospovirus属病毒聚为一簇。; 刘雅婷郑元仙李永忠李正跃; 关键词：番茄番茄斑萎病毒属

实时荧光定量PCR在植物病害中的应用被引量：21: 2009年; 实时荧光定量PCR技术作为一项新兴技术,越来越受到人们的重视。它以快速、准确定量、便捷等优点广泛应用于科学研究各个领域,近年来,实时荧光定量PCR技术在植物病害研究上不断深入,大大提高了植物病害的检测效率和监测防治水平。结合了最近几年来应用于检测和鉴定植物病原病害的实时荧光定量PCR过程中引物与探针的设计、反应过程、结果评价情况,综合论述了实时荧光定量PCR技术在由真菌、细菌、病毒、线虫引发的植物病害的检测与应用。; 徐小刚刘雅婷; 关键词：实时荧光定量PCR CT值植物病害引物设计灵敏度

云南省蝴蝶兰上凤仙花坏死斑病毒的鉴定被引量：11: 2010年; 2008年对云南省主要花卉基地进行调查,获得症状表现为环斑、坏死,疑似番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒的蝴蝶兰样品。应用生物测定,结合现代电镜技术、免疫试纸条检测技术初步确定为番茄斑萎病毒属的凤仙花坏死斑病毒(Impaliens necrotic spot virus,INSV),通过设计的4对引物进行RT-PCR扩增和测序,获得核壳体蛋白(Nucleocapsid protein)基因核酸长度为886nts,RNAM编码的非结构蛋白(Nonstructure protein,NSm)基因核酸长度为681nts,依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)基因核酸长度为1048nts,测序结果在NCBIBLAST网络数据库中比对,同时应用生物信息软件DNAman比对,其与INSV的同源性都达90%以上,都证明分离到的病原物为凤仙花坏死斑病毒(INSV)。; 郑元仙李永忠刘雅婷徐小刚叶茂朱秋燕; 关键词：凤仙花坏死斑病毒病毒病

云南烟草上出现番茄斑萎病毒(Tospovirus)属病毒被引量：6: 2008年; 2004-2007年间对云南省烤烟种植区进行调查，在云南省楚雄和文山2个地区，获得3份疑似Tospovirus属病毒的样本。通过Tospovirus组引物（Tospovirus Group Primer）进行RT-PCR扩增、克隆和测序，获得500nts核酸片段，通过NCBI BLAST网络数据库比对，确定这3份样品为Tospovirus属的病毒；通过DNAman软件比对分析所得到的核酸序列和已经公布的Tospovirus属病毒RNA L同位点序列，从得到的系统进化图可以看出，云南3个样品明显分为2簇，即YN-1和YN-2，分别与血清组I和Ⅵ的Tospovirus属病毒聚为一簇。; 刘雅婷卢秀萍郑元仙李永忠李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒属

TSWV抗性破坏株系进化机制研究初报: 斑萎病毒抗性破坏株系是TSWV病毒与抗性寄主长期协同进化形成的,它能系统侵染具有抗性基因(Sw-5或Tsw)植物寄主,使寄主丧失抗性.本研究选取采自美国不同地区番茄、辣椒和烟草田间的10个TSWV株系,通过摩擦接种7种不...; 刘雅婷郑元仙李永忠徐小刚孙文涛李正跃; 关键词：番茄斑萎病毒

云南省教育厅自然科学研究基金(5Y0171B)

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