国家自然科学基金(30270212)
- 作品数:4 被引量:21H指数:3
- 相关作者:魏辅文杨光周开亚严洁王加连更多>>
- 相关机构:中国科学院南京师范大学更多>>
- 发文基金:江苏省“青蓝工程”基金国家自然科学基金国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 白鱀豚MHC基因类DQB1座位第二外元的序列变异分析被引量:11
- 2003年
- 测定了 4 5个克隆的白豚 (Lipotesvexillifer)MHCⅡ类基因DQB座位第二外元 172bp的核苷酸序列 ,共获得 15种序列 ,发现了 2 2个变异位点。核苷酸的非同义替换明显多于同义替换 ,并造成了 15个氨基酸的改变。氨基酸的替换趋于集中在假定的与抗原的选择性识别相关的位点附近。白豚DQB基因的核苷酸和氨基酸序列与文献报道的白鲸 (Delphinapterusleucas)和一角鲸 (Monodonmonoceros)DQB1序列具有较高的同源性。氨基酸序列不具备人及其它一些灵长类动物DQB2基因所共有的基序 (Motif) ,而与牛DQB1基因的基序相近 ,说明本研究得到的白豚MHC序列应属于类DQB1基因。同一个体出现了多种序列的情况 ,提示白豚的DQB基因可能存在着座位重复。白豚的类DQB1座位的序列中存在多种基序的不同组合 ,推测是由于基因转换造成的.
- 严洁杨光周开亚魏辅文
- 关键词:MHC基因序列变异分析基因重复基因转换
- 白鱀豚BDNF基因的扩增和序列分析被引量:1
- 2006年
- 利用聚合酶链式反应,首次从白鱀豚基因组DNA中扩增和克隆到脑源神经营养因子的编码区。在该段序列中含有一个长为747bp的开放阅读框,无内含子,编码一个由248个氨基酸组成的蛋白质,预计分子量为27953.7道尔顿。其中包括由18个氨基酸残基组成的信号肽区,111个氨基酸残基组成的前肽区及119个氨基酸残基组成的成熟区。序列分析表明,白鱀豚脑源神经营养因子基因编码区的核苷酸序列与其它哺乳动物相似性超过90%,而与猪牛相似性相对较高(分别为95%和94.7%)。氨基酸序列比较发现,白鱀豚BDNF前体蛋白的氨基酸序列与其它哺乳动物具有94.5%~99.5%的相似性,显示了极高的保守性。通过邻接法进行的系统发生分析中,鲸目和食肉目的物种分别聚为单系;与其它哺乳动物相比,鲸类与有蹄类的牛和猪的亲缘关系相对较近,这与鲸类和有蹄类之间具有相对较近的亲缘关系相符。
- 郭丽孙鹏邹振芳杨光魏辅文
- 关键词:BDNFPCR
- 黄海伪虎鲸mtDNA控制区序列的测定和初步分析被引量:5
- 2005年
- 测定了黄海7头伪虎鲸mtDNA控制区5’端533bp的序列,共发现54个变异位点,定义了4种单元型。最大似然法和邻接法的系统树均把单元型聚为2分支。两支之间没有共享单元型且无姊妹关系。分支间的核苷酸序列差异显著地超过了其它海豚类种间的序列差异水平,提示传统意义上的伪虎鲸可能包括了具有显著遗传差别的不同物种,迫切需要开展进一步的研究。
- 张婷杨光杨光周开亚
- 关键词:伪虎鲸MTDNA控制区物种分化
- PCR扩增Sry基因进行鲸类动物性别的鉴定被引量:8
- 2005年
- 哺乳动物Y染色体短臂上的Sry基因决定雄性发育方向。本研究参照哺乳动物Sry基因保守区序列设计引物 ,以非性别特异性的线粒体DNA细胞色素b基因作为阳性对照 ,用PCR扩增江豚、长喙真海豚等鲸类动物的Sry基因片断并对其进行凝胶电泳分析来鉴定鲸类动物的性别。通过此方法对 87个已知性别鲸类动物标本的检验 ,结果完全正确 ,并进一步应用此方法成功地完成了另外 33个未知性别鲸类标本的性别鉴定。由此建立了一套简单、快速。
- 王加连杨光周开亚魏辅文严洁
- 关键词:SRY基因性别鉴定性发育PCR扩增鲸类动物哺乳动物