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艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2008ZXl0001-005)
作品数:
2
被引量:5
H指数:1
相关作者:
陈绍椿
施美琴
韩燕
尹跃平
向志
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相关机构:
中国医学科学院北京协和医学院
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发文基金:
艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项
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相关领域:
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2013
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广西梧州和贺州不同场所暗娼泌尿生殖道沙眼衣原体感染及其基因型别分布
被引量:5
2013年
目的探讨广西梧州和贺州暗娼人群(FSW)沙眼衣原体的流行情况及基因型别的分布。方法2009年7月至2010年9月间,在广西梧州和贺州的娱乐场所共招募810例符合条件的FSW。根据其不同场所分为低档场所、中档场所和高档场所。用罗氏Amplicor沙眼衣原体核酸检测试剂对所有收集的宫颈拭子标本进行检测;用QiagenDNA提取试剂对沙眼衣原体阳性标本的进行DNA提取,经巢式PCR方法扩增ompA基因的VS2区,扩增后的产物利用测序仪进行双向测序后分析基因型别。卡方检验分析沙眼衣原体感染率及其基因型别在来源于不同场所和不同地区的FSW间的差异。结果经核酸检测161例沙眼衣原体阳性,沙眼衣原体感染率20.0%(161/805)。经卡方分析显示:高档场所和中档场所的Fsw沙眼衣原体感染率低于低档场所,分别为r=3.97,P〈0.05,r=5.95,P〈0.05。基因型E在低档场所FSW人群中分布较中档场所FSW人群中多,r=5.02,P〈0.05,而基因型K在低档场所FSW人群中分布较中档场所FSW人群中少,Fisher精确法,t=0.048,P=0.048。结论低档场所的FSW沙眼衣原体的感染率较高,主要流行的基因型为E,而以症状为基础的筛查策略会漏检许多感染沙眼衣原体基因型E的患者,因此需要加大在低档Fsw人群中沙眼衣原体的筛查的力度。
韩燕
尹跃平
施美琴
陈绍椿
向志
李红敏
关键词:
衣原体
沙眼
基因
卖淫
尿液标本淋球菌多抗原序列分型研究
2013年
目的探讨江苏常州、扬州,广西梧州、贺州,海南三亚、琼海,广东江门、茂名淋球菌多抗原序列分型(NG—MAST)的型别分布。方法88份淋球菌核酸检测阳性的男性性病门诊就诊者(MSP)的尿液标本,用Qiagen试剂盒提取DNA,并进行2次PCR扩增porB、出加基因片段,扩增成功的标本测序后登陆NG—MAST网站进行序列比对,获取菌株基因型别信息。结果对88份阳性标本提取DNA进行单次PCR,扩增porB、tbpB基因的效率分别为13.6%和14.8%,共有12份标本比对成功,得到菌株基因型别,分型效率为13.6%(12/88);进行2次PCR扩增后,porB、tbpB基因的PCR扩增效率分别为71.6%和72.7%,分别增长了58.0%和57.9%,共有62份标本比对成功得到菌株基因型别,分型效率为70.5%(62/88),分型效率提高了56.9%。62份标本共分出45个基因型,其中40个型为已知型别,5个为新型别。所有型别中,STl866型丰度最高,有6份标本为此型别,STl972、ST3356各有4份标本,都集中于江苏项目点。ST532有3份,集中于广东项目点。ST2221有2份,集中于广西项目点,其余各基因型均只有1份标本,散在分布于各省。5个新型别为:porB基因型为892、tbpn基因型98%相似于46型的标本,且丰度较高,仅发现于江苏项目点;porB基因型为903、tbpB基因型99%相似于958型;porB基因型为130、tbpB基因型96%相似于504型;porB基因型为2790、a,pB基因型99%相似于32型;porB基因型为1053、tbpB基因型99%相似于856型。结论尿液标本可以用于NG—MAST分型研究,2次PCR扩增可以提高尿液标本的分型效率,不同地区淋球菌NG—MAST型别表现为多样性。
陈绍椿
尹跃平
施美琴
戴秀芹
韩燕
王宝玺
陈祥生
关键词:
奈瑟球菌
淋病
基因型
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