国家科技重大专项(2008ZX10003-010-02) 作品数:17 被引量:103 H指数:6 相关作者: 万康林 赵秀芹 董海燕 刘志广 夏强 更多>> 相关机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 南华大学 温州医学院 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 四川省自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
结核分枝杆菌分子分型技术研究进展 被引量:5 2010年 吕冰 高守一 万康林关键词:结核分枝杆菌感染 分子分型技术 分子流行病学 全基因组序列 H37RV MGIT 960和比例法对结核分枝杆菌药物敏感性试验的对比研究 被引量:10 2011年 目的评价BACTEC MGIT960检测8种抗结核药物耐药性的效果。方法用MGIT960对结核杆分枝杆菌临床分离菌株进行抗结核药物异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、卷曲霉素、卡那霉素、氧氟沙星和乙硫异烟胺的药敏检测,并将结果与L-J比例法结果进行比较分析。结果用MGIT960法与L-J比例法对118株结核分枝杆菌临床分离株进行异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、卷曲霉素、卡那霉素、氧氟沙星、乙硫异烟胺的耐药性检测,两种方法的符合率分别为97.5%(115/118)、92.4%(109/118)、96.6%(114/118)、84.7%(100/118)、94.9%(112/118)、94.1%(111/118)、97.5%(115/118)、85.6%(101/118)。MGIT960完成一线/二线药物药敏试验的时间平均为8.9和8.3天,L-J法则分别为26.7天和26.1天,差异有统计学意义(P<0.01)。结论 MGIT960所得的药敏结果与传统比例法有较高的一致性,但检测时间较短,有利于耐药结核病人的早期诊断和治疗。 赵丽丽 夏强 刘志广 赵秀芹 万康林关键词:BACTEC MGIT 内蒙古自治区结核分枝杆菌Spoligotyping分型及北京家族分析 被引量:9 2013年 目的了解内蒙古自治区结核分枝杆菌临床分离株的基因型构成,及该地区北京家族菌株的分布特征。方法从内蒙古自治区结核病防治研究所收集2011年全年临床分离的372株结核分枝杆菌菌株及其372例来源患者的背景资料,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法和BioNumerics 5.0软件进行基因分型分析,将372株临床菌株Spoligotyping分型结果与SpolDB 4.0数据库进行比对。另外,采用NTF及LSP对北京家族菌株进行分析。来源患者中汉族和蒙古族分别为282例及84例,其他为回族4例,维吾尔族和满族各1例,例数过少,因此仅分析主要民族与北京家族的易感性。以SPSS 13.0软件进行统计学分析,χ2检验分析不同民族与北京家族易感性。结果372株临床菌株共分为48种基因型,其中24种基因型为新的型别。85.48%(318/372)为北京家族,同时存在T家族(仅次于北京家族的主要流行基因型)占4.84%(18/372)、H家族(Haarlem)0.81%(3/372)、MANU家族(2004年最先于印度Delhi发现)0.27%(1/372)和LAM家族(Latin American and Mediter-ranean,拉丁美洲和地中海家族)0.27%(1/372)。汉族北京家族菌株占87.94%(248/282),非北京家族菌株占12.06%(34/282),蒙古族北京家族菌株79.76%(67/84),非北京家族菌株20.24%(17/84),差异无统计学意义(χ2=3.612,P=0.057)。结论内蒙古自治区结核分枝杆菌临床分离株基因具有多态性,且北京基因型为该地区主要流行株,而北京家族菌株与民族易感性间无关联。 余琴 苏云开 吕冰 马岩 连璐璐 杨晓敏 董海燕 刘耀 赵秀芹 吴移谋 万康林关键词:细菌分型技术 分子分型 汉族 结核分枝杆菌分子进化研究进展 被引量:1 2012年 分子生物学技术的不断成熟和生物信息学技术的广泛应用使生物的分子进化研究取得了迅猛进展。结核分枝杆菌的分子进化研究为结核分枝杆菌的溯源、致病机理研究、耐药性研究及毒力基因相关研究奠定了坚实的理论基础,同时也为结核病的预防控制提供重要依据。特对近年来国内外用于结核分枝杆菌分子进化研究进行综述。 白云 万康林关键词:结核分枝杆菌 分子进化 生物信息学技术 分子生物学技术 致病机理 毒力基因 安徽省420株结核分枝杆菌对一线和二线抗结核药物药敏结果分析 被引量:19 2014年 目的研究并分析安徽地区420例结核分枝杆菌对一线、二线抗结核药物菌耐药情况,为结核病临床治疗和结核病控制提供科学依据。方法采用绝对浓度法对420例结核分枝杆菌临床分离株进行一线、二线抗结核药物敏感试验。结果对一线抗结核药物总耐药率和耐多药率分别是29.05%和14.52%;其中初治耐药率和耐多药率分别是15.93%、6.79%,复治耐药率和耐多药率分别是52.86%、30.0%;RIF、INH、SM、EMB耐药率分别是22.14%、20.0%、17.38%和0.95%。抗二线结核药物总耐药率为22.62%,其中左氧氟沙星和丙硫乙烟胺的耐药率较高,分别为13.33%(56/420)和12.86%(54/420),年龄段41~60岁耐药率均显著高于其他年龄段(P〈0.05);男性和女性病例组间均无统计学显著性差异(P〉0.05)。结论安徽地区结核菌耐药情况仍然十分严重,应加强抗结核药物的耐药性监测,同时根据药敏试验结果选择科学有效的化疗方案。 徐东芳 王庆 李孳 李东方关键词:结核分枝杆菌 抗结核药 药敏试验 耐多药结核 中国首例脓毒分枝杆菌感染肺病报告 被引量:1 2012年 目的分析脓毒分枝杆菌感染肺病的临床和细菌学特征,探讨其鉴别诊断方法。方法分析脓毒分枝杆菌感染肺病患者的临床表现极其相关实验室检查结果。对其临床分离株采用L-J,TCH/PNB鉴别培养基和多位点PCR初步鉴别,rpoB/hsp65基因PCR-测序鉴定出菌种。结果该患者痰涂片和培养检测为阳性。L-J,TCH/PNB鉴别培养基和多位点PCR鉴别为非结核分枝杆菌。rpoB/hsp65基因PCR-测序,经BLAST比对,与脓毒分枝杆菌(ATCC 700731)同源性均为99%。药物敏感性检测证实本病例分离到的菌株对大多数药物(包括四种一线抗结核药物)耐药,而对阿米卡星、环丙沙星、氧氟沙星、左氧氟沙星、卡那霉素和新诺明等药物敏感。结论在中国首次鉴定、确诊脓毒分枝杆菌感染肺病。 赵秀芹 邓建平 连璐璐 董海燕 张敬蕊 李桂莲 肖体权 李群 万康林关键词:非结核分枝杆菌肺病 非结核分枝杆菌 四川省结核分枝杆菌VNTR分型研究 被引量:3 2012年 目的评价不同串联重复序列(VNTR)位点在四川省结核分枝杆菌中的基因多态性,以及不同VNTR位点组合在四川省结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法采用多位点数目可变串联重复序列分析技术(ML-VA)对102株四川省结核分枝杆菌菌株的15个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用Hunter-Gaston指数,聚类分析采用BioNumerics软件。结果 15个VNTR位点的基因多态性存在较大的差异,位点Mtub21(HGI 0.772)和MIRU26(HGI 0.764)的多态性较高,ETR-C(HGI 0.168)和MIRU23(HGI 0.077)的多态性较差。ETR-B和ETR-C两个位点在对四川省北京基因型结核分枝杆菌进行分型时则不具有多态性。对不同的VNTR位点组合进行比较,随着VNTR位点的增加,VNTR分型方法的分辨能力也有所提高。10个VNTR位点组合的分辨指数与15位点组合的分辨指数相差不大。同一VNTR位点在不同地区北京基因型菌株中的分辨力也存在较大的差异。结论不同VNTR位点在四川省结核分枝杆菌中具有不同的分辨力,并且同一VNTR位点在不同地区的北京家族菌株中的分辨力也不同。10个VNTR位点组合的基因分型方案可用于四川省结核分枝杆菌基因分型的一线方法。本研究的数据结果对挑选适合中国结核分枝杆菌基因分型的VNTR位点组合法具有重要的作用。 董海燕 杨筠 赵秀芹 李定越 陈建 刘志广 龙波 万康林 万康林关键词:结核分枝杆菌 串联重复序列 基因分型 TaqMan-MGB荧光定量PCR快速检测痰结核分枝杆菌异烟肼耐药效果的评价 被引量:3 2012年 目的评价通过检测结核分枝杆菌katG基因突变以诊断异烟肼耐药并检测结核分枝杆菌的TaqMan-MGB荧光定量PCR方法。方法收集临床诊断为肺结核病的患者痰样本,用已建立的荧光PCR方法进行检测,与常规痰涂片抗酸染色、分枝杆菌培养和传统比例法药敏试验比较,评价检测结核分枝杆菌敏感性和特异性及异烟肼耐药的特异性和敏感性。统计学分析采用χ2检验,P值<0.05为差异有统计学意义。结果荧光定量PCR共检测186份痰液样本,敏感性为84.47%,特异性为100.00%。在确诊病人的痰液中阳性检出率84.47%,明显高于痰涂片40.99%(χ2=46.44,P<0.01),痰培养40.37%(χ2=47.89,P<0.01),且差异有统计学意义。其中荧光PCR在菌阳痰液中检出率94.44%,涂阴培阴的痰液中检出率75.28%。与常规药敏试验结果比较,培养阳性的61份痰样本的药敏符合率96.72%(59/61),敏感性33.33%(1/3),特异性100.00%(58/58)。结论 TaqMan-MGB荧光定量PCR的方法能特异、灵敏、快速诊断痰液中的结核分枝杆菌及其异烟肼耐药性。 潘爱珍 赵秀芹 付军 冯岚 冯小武 刘志广 王晓萌 龙永燕 柳正卫 刘云 刘玲燕 万康林关键词:结核分枝杆菌 耐药 异烟肼 耐多药结核分枝杆菌对喹诺酮类药物的耐药性与gyr基因突变的初步研究 被引量:5 2011年 目的分析耐多药结核分枝杆菌(Multiple drug-resistant tuberculosis,MDR-TB)临床分离株的gyr基因突变特点,探讨MDR-TB对喹诺酮类药物耐药产生与gyr基因突变的关系。方法采用比例法对耐多药结核临床分离菌株进行氧氟沙星的药物敏感性检测,应用DNA直接测序法检测MDR-TB的gyr基因突变情况。结果 125株MDR-TB临床分离株中,50株对喹诺酮类耐药,耐药率为40%。50株耐药菌株中,40株gyr基因发生突变:其中39株gyrA基因突变,突变率为78%,突变位点包括90,91和94位氨基酸;5株gyrB基因突变,其中4株合并gyrA基因突变,gyrB基因突变位点为500,506,534和539位氨基酸。结论 MDR-TB中的喹诺酮类药物耐药态势比较严峻,其对喹诺酮类药物耐药机制主要与gyrA基因突变有关。 赵丽丽 夏强 赵秀芹 刘志广 万康林关键词:喹诺酮 GYRA基因 耐多药结核分枝杆菌 结核分枝杆菌对二线药物耐药性及机制研究进展 被引量:2 2011年 结核病耐药性的产生和传播已成为全球公共卫生工作的焦点。世界卫生组织(WHO)最新统计显示,全球有39万~51万例耐多药结核病(multi-drug-resistant tuberculosis,MDR-TB),其中50%分布在印度和中国。 夏强 万康林关键词:结核分枝杆菌 药物耐药