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山东省农业良种产业化开发项目(2007LZ006-03)

作品数:1 被引量:6H指数:1
相关作者:陈相艳王彩洁李伟戴海英徐冉更多>>
相关机构:山东省农业科学院更多>>
发文基金:山东省农业良种产业化开发项目山东省农业科学院青年科研基金山东省自然科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇植物
  • 1篇抗病
  • 1篇抗病基因
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇大豆

机构

  • 1篇山东省农业科...

作者

  • 1篇张礼凤
  • 1篇阚天君
  • 1篇徐冉
  • 1篇戴海英
  • 1篇李伟
  • 1篇王彩洁
  • 1篇陈相艳

传媒

  • 1篇中国油料作物...

年份

  • 1篇2009
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
利用已知植物R基因对大豆基因组抗病候选基因的预测被引量:6
2009年
用已知的52个抗病基因的全长蛋白质序列在GenBank中对大豆(Glycine maxL.)ESTs进行tb lastn检索,得到的ESTs具备Score≥100和E-value≤10-10作为侯选的抗病基因同源ESTs(R-gene-likeESTs),利用Phrap软件进行聚类拼接,聚类后的un igene在GenBank数据库中通过B lastx来证实其可能的抗病功能。通过该方法,得到403条与抗病基因同源的ESTs,其中有33个推导编码产物含有NBS-LRR或TIR-NBS-LRR结构域;102条推导的编码产物含有LRR或PK/LRR结构域;254条推导的编码产物含有PK结构域;其它结构域有14条。证明了应用全长序列进行数据库检索的方法是一种快速高效的基因预测方法,得到的RGA数量多类型丰富,为R基因的克隆提供了一种新思路。
张礼凤李伟陈相艳徐冉王彩洁戴海英阚天君
关键词:抗病基因大豆基因组
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