海洋公益性行业科研专项(201005032)
- 作品数：6 被引量：34H指数：5
- 相关作者：邵宗泽董纯明李安章刘金禄白秀花更多>>
- 相关机构：国家海洋局第三海洋研究所厦门大学南方医科大学更多>>
- 发文基金：海洋公益性行业科研专项国家自然科学基金国家海洋局青年海洋科学基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程生物学农业科学更多>>
- 海洋生境枯草芽孢杆菌LHB02抗菌蛋白的分离纯化及部分特性分析被引量：6
- 2011年
- LHB02是一株分离自海滩污泥的海洋生境枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），其发酵产物对海水养殖常见致病菌弧菌有很强拮抗能力．采用硫酸铵沉淀、Sephadex G-50凝胶层析等方法，进一步对LHB02发酵产物分离纯化，获得了分子质量为47ku单一条带的糖蛋白．经抗菌活性分析及稳定性测试发现，纯化后的抗菌蛋白对哈维氏弧菌（Vibrioharveyi）、溶藻弧菌（Vibrio alginolyticus）和鳗弧菌（Vibrio anguillarum）有很强的抑制作用，对热稳定及酸的耐受性也比较强（pH3．0～8．O），但对部分蛋白酶敏感．LHB02所产抗菌蛋白的强抑菌作用和高稳定性，预示着该菌可作为一种生防细菌开发，用于大黄鱼养殖中弧菌病的防治．
- 徐长安毛勇
- 关键词：枯草芽孢杆菌抗菌蛋白分离纯化
- 柴油食烷菌B-5及其卤代烷烃脱卤酶DadA对卤代化合物的降解被引量：1
- 2014年
- 【目的】柴油食烷菌(Alcanivorax dieselolei)B-5是重要的石油降解菌。为研究其对卤代化合物的降解范围和降解机制,【方法】以不同的卤代化合物作为唯一碳源,观察菌株B-5在其中的生长情况;通过多重序列比对、系统发育分析和三维结构同源建模,分析该菌株基因组内一个假定的卤代烷烃脱卤酶(Haloalkane dehalogenase,HLD)DadA;利用大肠杆菌异源表达、纯化DadA,并测定了其对46个卤代底物的酶活。【结果】菌株B-5能够利用C3-C18链长范围的多种卤代化合物为唯一碳源生长;在系统进化树中,DadA相对独立于其他HLD-II亚家族成员,但具有典型的HLD-II亚家族的催化五联体残基;DadA确实具有脱卤活性,但该酶特异性高,底物范围明显小于其他已鉴定的HLDs,仅对1,2,3-三溴丙烷、1,2-二溴-3-氯丙烷和2,3-二氯-1-丙烯有脱卤酶活。【结论】因为DadA对很多B-5菌株可以利用做碳源的卤代底物没有脱卤酶活,所以推测B-5菌中可能还有其他脱卤酶参与了卤代烷烃的降解。菌株B-5及其卤代烷烃脱卤酶DadA在卤代烷烃污染物的生物降解方面具有应用潜力。
- 李安章邵宗泽
- 关键词：生物降解石油降解菌卤代化合物
- 北极表层海水中氯代十六烷降解菌的多样性被引量：8
- 2012年
- 【目的】为了研究北极地区表层海水中氯代十六烷(C16H33Cl)降解菌的多样性,并获得新的卤代烃降解菌资源。【方法】以C16H33Cl为唯一碳源和能源在4℃和25℃下对表层海水样品进行富集,通过平板分离鉴定可培养菌株,并验证其降解能力;同时利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析降解菌群结构。【结果】从12个北极表层海水样品中富集分离得到112株可培养菌株。经过降解实验验证,发现19株菌株能够降解氯代十六烷,其中食烷菌(Alcanivorax)、红球菌(Rhodococcus)表现出很好的乳化和降解现象,海杆菌(Marinobacter)也有较好的降解效果。DGGE分析显示,富集驯化的降解菌群中主要优势菌为Alcanivorax,Parvibaculum和Thioclava属的菌株。【结论】北极海水中卤代烃降解菌主要是α-proteobacteria,γ-proteobacteria,Actinobacteria和Bacteroidetes。文章首次报道了北极海水卤代烷烃降解菌多样性,研究结果对于认识北极环境中的降解菌资源与生物多样性有参考价值。
- 王建宁董纯明赖其良林龙山邵宗泽
- 关键词：生物降解多样性
- 白令海和楚科齐海表层沉积物中多环芳烃降解微生物多样性
- 为了研究白令海(海盆及陆架)至楚科齐海陆架表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌的多样性,并获得新的PAHs降解菌资源。在GC-MS分析沉积物中PAHs种类和含量的基础上,以萘、菲和芘的混合物为唯一碳源和能源对表层沉积物...
- 张荣秋董纯明盛华芳白秀花矫立萍刘金禄汪卫国周宏伟邵宗泽
- 关键词：表层沉积物多环芳烃生物多样性
- 文献传递
- 微生物卤代烷烃脱卤酶研究进展被引量：5
- 2015年
- 卤代烷烃脱卤酶是降解卤代脂肪族化合物的关键酶类,在各种地理环境中的不同微生物中广泛存在,在生物降解和工业生产等方面具有重要的应用价值。目前已经生化鉴定了20个卤代烷烃脱卤酶。近些年来对这些酶的酶学特征、蛋白质结构和系统进化进行了详细的研究。同时,为满足应用实践的需求还对卤代烷烃脱卤酶进行了蛋白质工程改造研究。本文将对卤代烷烃脱卤酶研究的一些新的进展进行综述。
- 李安章邵宗泽
- 关键词：生物降解卤代化合物HLD
- 一株深海热液环境来源的PAHs降解菌TVG9-Ⅶ的系统发育与降解基因被引量：7
- 2011年
- 【目的】对一株深海热液环境来源的多环芳烃(PAHs)降解菌进行系统发育分析并对其降解特性和降解机制进行研究。【方法】对16S rRNA基因进行扩增和测序,进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析;利用GC-MS测定其对PAHs的降解率;通过构建基因组Fosmid文库,克隆PAHs降解基因簇;并利用RT-PCR和qPCR研究关键降解酶基因在不同PAHs诱导下的表达情况。【结果】从西南太平洋劳盆地热液沉积物中分离到一株PAHs降解菌株TVG9-Ⅶ,系统发育分析结果表明,该菌株属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium),与该属的Novosphingobium indicum H25T系统发育关系最为密切,它们的16S rRNA基因序列相似性高达99.7%。该菌株在21 d内对菲、荧蒽和芘的降解率分别为95.2%,57.3%和69.6%。从Fosmid文库中筛选得到一个负责PAHs降解的上游基因簇,包含了PAHs起始降解双加氧酶大小亚基(pheA1a/b)基因和一个脱氢酶基因;RT-PCR和qPCR实验表明,双加氧酶大亚基基因pheA1a在菲的诱导下上调表达4.2倍,而在萘及高环荧蒽和芘的诱导下无上调。【结论】菌株TVG9-Ⅶ是Novosphingobium属深海热液来源的PAHs降解菌,具有良好的降解特性,特别是对高环PAHs的降解效果较好。
- 董纯明陈亮廖悦婷邵宗泽
- 关键词：深海热液区多环芳烃双加氧酶
- 白令海和楚科奇海表层沉积物中多环芳烃降解微生物多样性被引量：8
- 2014年
- 为了研究白令海（海盆及陆架）至楚科奇海陆架表层沉积物中多环芳烃（PAHs）降解菌的多样性，并获得新的PAHs降解菌资源。在GC—MS分析沉积物中PAHs种类和含量的基础上，以萘、菲和芘的混合物为唯一碳源和能源对表层沉积物样品进行富集，通过平板分离鉴定可培养菌株，并验证其降解能力；同时利用变性梯度凝胶电泳（DGGE）和Illumina高通量测序技术分析降解菌群结构。GC—MS测定结果表明，14个表层沉积物中PAHs总干质量介于32．99～276．97ng／g。富集菌群中共分离获得51株可培养细菌，平板纯培养、PCR—DGGE及Illumina测序结果均表明，菌群中优势的降解菌是7Lproteobacteria的Marinobacter，Pseudoalteromonas，Pseudomonas和Actinobacteria门的Dietzia菌。此外，Illumina测序结果还表明14个降解菌群在菌群结构组成上，可分为海盆区和陆架区两种类群；同时检测到一些低丰度的海洋专属PAHs降解菌，如Cyclo—clasticus，Alteromonas和Neptunomonas等。本文结果将加深对白令海及楚科奇海表层沉积物中PAHS降解菌资源与生物多样性的认识。
- 张荣秋董纯明盛华芳白秀花矫立萍刘金禄汪卫国周宏伟邵宗泽
- 关键词：表层沉积物多环芳烃
- 白令海和楚科齐海表层沉积物中多环芳烃降解微生物多样性
- 为了研究白令海(海盆及陆架)至楚科齐海陆架表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌的多样性,并获得新的PAHs降解菌资源。在GC-MS分析沉积物中PAHs种类和含量的基础上,以萘、菲和芘的混合物为唯一碳源和能源对表层沉积物...
- 张荣秋董纯明盛华芳白秀花矫立萍刘金禄汪卫国周宏伟邵宗泽
- 关键词：表层沉积物多环芳烃生物多样性
