国家自然科学基金(30800803)
- 作品数：14 被引量：69H指数：6
- 相关作者：刘彦群王欢秦利夏润玺李喜升更多>>
- 相关机构：沈阳农业大学辽宁省蚕业科学研究所西南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 昆虫肠道微生物多样性研究进展被引量：18
- 2016年
- 昆虫肠道内存在种类繁多、数量庞大的微生物,这些肠道微生物种群结构的多样性与昆虫种类、龄期、消化道形态、食物的喂养条件、生存环境等息息相关。近几年,随着大规模测序技术、组学技术的发展,应用分子生物学技术快速、定性、定量研究昆虫肠道微生物种群的多样性已成为热点。介绍了昆虫肠道微生物的分类和检测方法,综述了昆虫肠道微生物多样性的研究进展,以期为昆虫与其肠道微生物的协同进化和害虫防治等研究提供基本方法和数据,为今后昆虫肠道微生物的研究提供理论参考。
- 鲁迎新刘彦群李群夏润玺王欢
- 关键词：昆虫肠道微生物多样性
- 绢丝昆虫樟蚕线粒体全基因组克隆及序列分析被引量：2
- 2010年
- 采用Long-PCR方法,克隆并测定了樟蚕(Eriogyna pyretorum)线粒体基因组全序列。樟蚕线粒体基因组全序列为15,327bp,基因组碱基组成为39.17%A,11.55%C,7.63%G,41.65%T,共有13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个AT富含区(A+T-rich区)。樟蚕线粒体基因组结构与鳞翅目其他昆虫相同。除cox1和cox2基因外,其他蛋白编码基因含有典型的ATN起始密码子;13个蛋白质编码基因中,有11个使用TAA作为终止密码子。预测了22个tRNA基因的二级结构,发现除trnS1(AGN)缺少DHU臂外,其他的tRNA具有典型的三叶草结构。
- 洪桂云姜绍通于淼杨英刘彦群魏兆军
- 关键词：绢丝昆虫樟蚕蚕蛾总科线粒体基因组
- 珍稀绢丝昆虫柳蚕的DNA条形编码与系统进化初步分析被引量：10
- 2009年
- 利用DNA测序技术获得柳蚕(Actias selene)线粒体细胞色素酶C亚基Ⅰ基因(COI)5′端574 bp的片段,作为用于柳蚕种质资源分子鉴定的DNA条形编码(GenBank:FJ358505)。测定的柳蚕COI基因序列与其它大蚕蛾科绢丝昆虫的COI序列一样,均表现出偏好于碱基T的倾向(AT skew=-0.179)。在所分析的蚕类昆虫中,柳蚕与合目大蚕蛾的遗传距离最小(0.120),而与蓖麻蚕之间的遗传距离最大(0.138)。构建的NJ和UPGMA分子树中,大蚕蛾科的柳蚕属、柞蚕属、蓖麻蚕属、大乌桕蚕属、栗蚕属均各自形成一个支系,并且明显形成两个分支:大蚕蛾族(saturni-ini),包括柳蚕、柞蚕和栗蚕;眉纹大蚕蛾族(attacini),包括蓖麻蚕和大乌桕蚕。这一结果与传统分类一致。
- 濮佳明武松霍锡敏王欢夏润玺李喜升王振东罗朝斌刘彦群
- 关键词：柳蚕系统进化
- 昆虫病原线虫共生菌对玉米弯孢菌的抑菌活性及其抗逆性
- 2011年
- 利用从国内采集土样中收集到的23个品系昆虫病原线虫和5个本室保存的线虫品系分离共生菌,通过对共生菌菌株发酵液和初提物抑菌活性的测定,得到1株对玉米弯孢菌具有良好抑菌活性的共生菌菌株SY5,抑菌圈平均直径分别为50.00mm和33.34mm,并对抑菌活性强的菌株发酵液的抗逆性进行了初步探索,结果表明,共生菌菌株SY5在50℃下处理60 min和100℃高温下10 min,其抑菌活性依旧很高;18W紫外线照射120 min对共生菌SY5的抑菌活性的影响不明显;常温保存150d,抑菌活性下降。
- 王欢刘彦群董辉钱海涛李天来丛斌郑婧谢迪高眃晞
- 关键词：昆虫病原线虫共生菌玉米弯孢菌抑菌活性
- 柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序被引量：6
- 2009年
- 采用RNA转录5′末端转换（SMART）技术构建了柞蚕（Antheraea pernyi）蛹的全长cDNA文库。所构建cDNA文库的容量为5×10^5个独立克隆,插入片段长800-2500 bp,且90%的插入片段大于1 kb。随机挑取288个克隆进行表达序列标签（EST）测序,有效序列为250条,根据EST测序结果计算文库重组率达95%。经序列拼接得到175个unigenes,通过序列比对发现其中97个unigenes与GenBank中的已知基因高度同源,且有88条全长序列,基因的完整性比率达90%。在随机EST测序中获得了具有5′端和3′端非编码区的延伸因子-1α基因（Gen-Bank登录号：FJ788508）,该基因cDNA全长1743 bp,有一个1392 bp的开放阅读框,编码含463个氨基酸残基的蛋白,蛋白的理论分子质量为50.4 kD,等电点8.96。EST测序分析表明,柞蚕蛹cDNA文库符合构建基因文库的质量要求,该文库的构建将有助于柞蚕功能基因的克隆和研究。
- 夏润玺李玉萍王欢李喜升刘彦群秦利姜德富鲁成
- 关键词：柞蚕CDNA文库表达序列标签
- 樗蚕和蓖麻蚕的DNA条形编码与系统进化分析被引量：6
- 2009年
- 樗蚕（Philosamia cynthia cynthia）与蓖麻蚕（Philosamia cynthia ricini）均是鳞翅目大蚕蛾科吐丝营茧的昆虫,二者的血缘关系很近,成虫的外形也极其相似。为了获得用于樗蚕与蓖麻蚕分子鉴定的DNA条形编码,测定了二者的线粒体细胞色素酶C亚基I基因（COI）574 bp的DNA片段序列（GenBank登录号：FJ788507,FJ772004）,对序列特征及与同科其它绢丝昆虫同源序列的系统进化关系进行了分析。在大蚕蛾科绢丝昆虫中,樗蚕与蓖麻蚕COI序列表现出最强的碱基T偏好性（ATskew=-0.194）,二者的COI序列之间具有明显差异,共鉴定出25个变异位点,表明所测定COI序列可以作为各自的DNA条形编码。樗蚕与蓖麻蚕之间基于Kimura-2-Parameter的遗传距离为0.041,而与同科其它绢丝昆虫之间的遗传距离则在0.076~0.159之间,二者与惜古比天蚕（Hyalophora ce-cropia）之间的亲缘关系较近。
- 武松李玉萍夏润玺王欢石生林李喜升王振东刘彦群
- 关键词：樗蚕蓖麻蚕COI基因系统进化
- 昆虫病原线虫对柞蚕蛹羽化率的影响
- 2011年
- 利用10个品系的昆虫病原线虫对柞蚕蛹羽化率的影响进行了试验。结果表明,10个品系的昆虫病原线虫中,6个品系线虫对柞蚕羽化无影响,4个品系线虫对柞蚕羽化有影响。进一步明确昆虫病原线虫对柞蚕的安全性后,有望应用于蚕区农作物及柞树害虫的防治。
- 时磊张雪涂海王欢刘彦群秦利丛斌
- 关键词：昆虫病原线虫柞蚕羽化率
- 柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析被引量：2
- 2009年
- 腺苷酸转移酶(adenine nucleotide translocase,ANT)是线粒体内膜上的转运蛋白家族成员。从柞蚕(An-theraea pernyi)蛹全长cDNA文库中获得了柞蚕腺苷酸转移酶基因(ApANT)的cDNA序列(GenBank登录号FJ788509)。对该基因进行生物信息学分析表明:ApANTcDNA全长1 282 bp,含有1个903 bp的开放阅读框(ORF)序列,编码300个氨基酸;ApANT与烟草天蛾(Manduca sexta)等鳞翅目昆虫的ANT基因在核苷酸和氨基酸序列水平分别具有80%和90%以上的同源性,说明ANT蛋白在这些昆虫中是高度保守的;与其它已知鳞翅目昆虫的ANT蛋白一样,ApANT蛋白含有3个线粒体穿膜结构域,并且这3个保守结构域之间也显示出较高的相似性。
- 李玉萍王欢武松夏润玺刘彦群秦利李喜升姜德富
- 关键词：柞蚕生物信息学分析CDNA序列氨基酸序列蛋白结构
- 不同地理种群银杏大蚕蛾COI基因序列变异与遗传分化被引量：16
- 2009年
- 银杏大蚕蛾Caligula japonica是亚洲东部的特有种，既是一种重要的林业害虫，也是一种珍贵的野生蚕类资源。为了揭示银杏大蚕蛾地理种群间的内在联系，测定了我同分布的12个地理种群的线粒体细胞色素氧化酶C亚基I（COI）基因部分序列（GenBank登录号：FJ358506-FJ358517），对地理种群间的序列变异和遗传分化进行了分析。结果表明：银杏大蚕蛾地理种群间的COI序列同源性高达99％～100％，显示出比较小的遗传差异。序列对准后从供试COI序列中仅鉴定出9个变异位点和6个单元型，其中3种是共享单元型。系统发育分析结果表明种群间已经按地理位置形成了一定的地理格局，AMOVA分析显示北方组和南方组之间已经具有明显的遗传分化（FST=0．478，P〈0．001）。综合分析，我们认为北方组和南方组之间的遗传分化町能与差异巨大的生态条件有关。研究结果为银杏大蚕蛾的种群遗传学和生态学研究提供了一个基本的分子生物学线索。
- 杨宝山候庆君王欢李喜升姜德富刘彦群秦利
- 关键词：银杏大蚕蛾地理种群COI基因遗传分化
- 柞蚕核型多角体病毒和家蚕核型多角体病毒的同义密码子使用模式分析被引量：5
- 2011年
- 基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染。通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNPV同义密码子使用模式差异。ApNPV和BmNPV的密码子偏好性均较弱,但二者的ENc值和GC含量差异显著;除碱基组成外,还存在其它因素影响密码子使用模式,但各影响因素的贡献率均较低,在基于密码子使用频率的对应分析中BmNPV的第1、第2向量轴贡献率均低于ApNPV;ApNPV的基因表达水平与GC含量、GC3s含量以及ENc值极显著相关(r分别为0.418、0.735、-0.628,P=0.000),而BmNPV的基因表达水平只与GC3s含量呈弱相关(r=0.214,P=0.010)。分析结果显示,ApNPV和BmNPV的密码子偏好性虽均较弱,但同义密码使用模式及其影响因素存在差异。
- 李京生杨瑞生贾萍石生林刘彦群潘敏慧秦利
- 关键词：柞蚕核型多角体病毒家蚕核型多角体病毒同义密码子密码子偏好性
