湖南省自然科学基金(13JJ4116)
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 相关作者：王晓飞陈建华栾明宝许英孙志民更多>>
- 相关机构：中国农业科学院麻类研究所更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 苎麻RSAP-PCR反应体系的正交优化被引量：1
- 2013年
- 限制性位点扩增多态性(restriction site amplified polymorphism,RSAP)是一种新型的分子标记技术,为了明确该标记技术在苎麻上利用的可行性。对限制性位点扩增多态性(RSAP)-PCR反应体系利用正交试验进行优化。结果表明:25μL体系中,其最优条件为TaqDNA聚合酶1U,dNTPs 0.3mmol/L,引物0.25μmol/L,DNA 10ng。
- 邹自征陈建华栾明宝郭劲霞陈明雄王晓飞许英孙志民
- 关键词：苎麻正交设计
- 苎麻Genomic-SSR与EST-SSR分子标记遗传差异性分析被引量：4
- 2015年
- 为了明确苎麻不同SSR的遗传差异性,利用Genomic-SSR与EST-SSR两种SSR标记对19个苎麻核心种质的遗传多样性进行分析。根据统计结果,Genomic-SSR平均检测到的观测等位基因数为3.4643、有效等位基因数为2.1982、Shannon多样性指数为0.8864、观测杂合度为0.5254、期望杂合度为0.5172;EST-SSR平均检测到的观测等位基因数为2.3333、有效等位基因数为1.9438、Shannon多样性指数为0.7120、观测杂合度为0.5128、期望杂合度为0.4778。Genomic-SSR和EST-SSR两种引物的有效等位基因数(Ne)和观测杂合度(Ho)差异不显著,Genomic-SSR的Shannon指数显著高于EST-SSR。研究结果表明,在标记多态性及基因型鉴别等方面,Genomic-SSR与EST-SSR均具有显著的遗传差异性,但是两种标记都能有效的鉴别不同基因型个体。Genomic-SSR可优先用于分子身份证、高密度遗传连锁图谱的构建和遗传多样性分析;EST-SSR用来研究苎麻近缘种间的遗传多样性、进化分析、连锁图谱和比较基因组学更有优越性。
- 刘晨晨栾明宝陈建华王晓飞许英孙志民
- 关键词：苎麻分子标记GENOMIC-SSREST-SSR
