国家科技基础性工作专项(2007FY110400-3-4)
- 作品数：2 被引量：46H指数：2
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- 相关机构：东北林业大学更多>>
- 发文基金：国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 胡桃楸ISSR-PCR反应体系的建立及优化被引量：29
- 2010年
- 在研究胡桃楸遗传多样性的过程中,为了获得清晰、重复性好的ISSR扩增结果,采用改良的CTAB法提取胡桃楸基因组DNA,利用正交设计与单因子试验相结合的方法对影响胡桃楸ISSR-PCR反应体系的5个主要因素(Taq酶、Mg^(2+)、dNTP、引物、模板DNA)在4个水平上进行优化设计。通过综合比较分析,筛选出各反应因素的最佳水平,建立胡桃楸ISSR-PCR最佳反应体系:20μL的反应体系中,Taq酶1.0 U,Mg^(2+)2.0 mmol/L,dNTP 0.2 mmol/L,模板DNA 50～250 ng,引物0.4μmol/L。在此基础上筛选出13条多态性好、扩增稳定的ISSR引物,并确立了最佳退火温度和循环次数。这一优化系统的建立为今后利用ISSR技术进行胡桃楸遗传多样性、亲缘关系以及物种保护等的研究奠定了基础。
- 王东娜牟长城冯富娟
- 关键词：胡桃楸正交设计单因素试验
- 胡桃楸天然种群遗传多样性的ISSR分析被引量：17
- 2011年
- 为了了解胡桃楸资源的遗传多样性状况,采用ISSR分子标记技术,对胡桃楸集中分布区内6个种群共180个样本的遗传多样性进行研究。从50条引物中筛选出14条用于扩增,共检测到140个位点,其中多态位点120个,多态位点百分率为85.71%。在物种水平上胡桃楸的Shannon信息指数为0.4521,Nei指数为0.3024,表明物种水平的遗传多样性较高;在种群水平上遗传多样性随纬度从南到北呈现单峰型变化规律,老爷岭种群的遗传多样性最高,三合种群的最低。AMOVA分析结果表明,胡桃楸的遗传变异大多数存在于种群内,占总遗传变异的81.83%,18.17%的变异存在于种群间。基于Nei＇s遗传多样性分析得出的种群间遗传分化系数为0.1618,各居群间的Nei＇s遗传距离在0.0470~0.1225之间。UPGMA聚类分析的结果与自然地理分布规律基本相一致,地理上较近的种群,在遗传上聚在一起。鉴于胡桃楸的遗传多样性现状和种群遗传结构,胡桃楸濒危的主要原因不在其遗传变异方面,主要来自于人为干扰和其生境的破坏与退化。
- 王东娜牟长城高卓冯富娟
- 关键词：胡桃楸ISSR
