公共文化服务平台

江苏省卫生厅重大科研项目(H200707): 作品数：10 被引量：41H指数：5; 相关作者：潘世扬陈丹穆原赵文君谢而付更多>>; 相关机构：江苏省人民医院南京医科大学南京市第二医院更多>>; 发文基金：江苏省卫生厅重大科研项目江苏省科技厅社会发展基金江苏省实验诊断学重点实验室基金更多>>; 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>

DNA甲基化标志物在分子诊断与治疗中的价值被引量：3: 2009年; DNA甲基化是指基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳原子上共价结合一个甲基基团,其主要参与基因的表达调控。DNA甲基化异常与肿瘤等疾病密切相关。抑癌基因启动子区甲基化是肿瘤发生发展的重要事件。DNA甲基化,不仅可作为肿瘤分子诊断的标志物,同时也可作为分子治疗的靶标。; 潘世扬; 关键词：DNA甲基化抑癌基因分子

肺癌患者血浆中APC基因启动子甲基化定量检测研究被引量：13: 2009年; 背景与目的:APC基因编码的蛋白参与信号转导途径,大量研究证实APC启动子区的高甲基化在肿瘤的发生发展中起重要作用。本研究建立血浆APC基因实时荧光定量甲基化特异性基因扩增(methylation-specificPCR,MSP)检测方法,并对临床肺癌患者血浆进行检测,以确定该方法在肺癌诊断中的应用价值。方法:将APC基因启动子甲基化阳性肺癌细胞株NCI-H460细胞用有限稀释法获取单个集落形成的细胞,以经典的酚-氯仿法提取细胞DNA,并用MSP对APC基因甲基化进行验证,紫外分光光度计定量并以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200μL健康人血浆中,得到模拟肺癌患者血浆,利用磁珠核酸提取方法从模拟肺癌及肺癌患者、肺部良性疾病患者和健康对照者血浆中提取DNA,对血浆DNA模板进行亚硫酸氢盐化学修饰;以模拟血浆样品作为标准品,采用外标准曲线法对各种血浆样品中APC甲基化进行定量分析。结果:所建立的实时荧光定量MSP检测方法的线性范围为1.5×102～1.5×105拷贝/mL,用该方法检测甲基化肿瘤细胞的DNA其最低检测限为1.5×102拷贝/mL。78例肺癌患者有40例组织中检测出APC基因甲基化阳性,其中的19例(47.5%)肺癌患者血浆中APC基因启动子甲基化阳性,APC甲基化浓度为1.67×102～6.78×103拷贝/mL,中位浓度为1.60×103拷贝/mL。38例组织阴性的肺癌患者、31例肺部良性疾病患者和23例健康者的血浆APC基因启动子甲基化均为阴性。结论:实时荧光定量MSP检测血浆APC基因甲基化在肺癌诊断方面具有潜在应用价值。; 潘世扬谢而付束永前高丽张丽霞陈丹陈进步赵文君穆原张寄南; 关键词：肺肿瘤血浆DNA APC基因 DNA甲基化

群体病例管理数据库的开发研究--含样品管理的新型医学病例信息管理系统被引量：1: 2010年; 针对当前病例临床信息与样品管理存在交叉需求的空缺,开发一种将临床信息与样品管理相结合的医学病例信息管理系统。以MS SQL Server 2000建立数据库,以Visual C++6.0开发基于Client/Server模式的客户端应用程序,以实现对病例资料及相关样品信息的录入、浏览、查询选择、分级统计、样品管理及自动生成病例信息综合文档等功能,从而达到按科研所需对群体病例资料及其样品的管理。该系统有助于提高临床科研工作的效率、质量及管理水平,为医学病例及样品信息的综合动态管理提供了新的技术平台。; 潘世扬穆原王虹王彤黄珮珺马建锋蒋理张杰顾兵衣鲁江; 关键词：生物样品信息管理系统

血浆中APC基因甲基化检测在早期肺癌诊断中的应用被引量：4: 2008年; 目的研究血浆DNA中APC基因启动子甲基化与肺部实体瘤良、恶性的关系,确定血浆中APC基因甲基化检测对早期肺癌诊断的意义。方法以92例CT检查发现肺部实体瘤(直径≤2 cm),并在CT引导下行肺部穿刺患者和23例健康人作为研究对象,收集血浆样本,利用磁珠法提取DNA,行亚硫酸氢盐化学修饰后,采用针对APC基因启动子区的甲基化引物和探针,以荧光定量MSP法(TaqM an探针)检测APC基因的甲基化。结果92例肺部实体瘤患者经病理诊断,有58例确诊为肺癌、31例为肺部良性疾病、3例未明确诊断。58例肺癌患者中有11例(19%)测出APC基因启动子区甲基化阳性,31例肺部良性疾病、3例未明确诊断和23例健康对照组均为阴性。结论检测血浆DNA中APC基因启动子甲基化有助于早期肺癌的诊断。; 谢而付潘世扬高丽俞同福陈丹张丽霞陈进步穆原赵文君张寄南; 关键词：血浆DNA 早期肺癌甲基化 APC基因

食管癌患者血浆循环DNA定量检测及临床特征分析被引量：12: 2009年; 目的检测食管癌患者血浆循环DNA的含量并探讨其与临床病理特征之间的关系。方法采集44例食管癌患者及100例健康对照的外周血，用磁珠法提取DNA、双重实时荧光定量PCR检测血浆DNA含量，并用放免法检测血清CEA水平。结果食管癌患者血浆DNA含量（中位数：54．0ng／ml，四分位数区间：38．0—68．1ng／ml）显著高于健康对照（中位数：18．5ng／ml．四分位区间：15．5～24．9．g／ml），P〈0．001。Ⅱa期、Ⅱb期和Ⅲ～Ⅳ期患者血浆DNA含量分别37．0（27．2—46．2）ng／ml、53．0（41．4。63．7）ng／ml和66．3（55．9～81．8）ng／ml。Ⅲ～Ⅳ期明显高于Ⅱa～Ⅱb期（P=0．003）。Ⅱa和Ⅱb期组的血浆DNA含量显著高于健康对照组（P〈0．001）。高、中分化组和低分化组的血浆DNA含量分别为32．3（24．2～55．1）ng／ml、52．9（42．5—69．6）ng／ml和65．0（57．7～88．6）ng／ml，低分化组显著高于高、中分化组（P：0．010）。以32．3ng／mL作为临界值，血浆DNA诊断敏感性为91．2％，特异性为90．O％，ROC曲线下面积为0．959（95％Cl0．915～1．000），优于血清CEA。结论检测血浆DNA对食管癌的筛查、早期诊断、判断肿瘤侵袭与转移具有重要价值。; 赵文君潘世扬马建锋张炳峰王芳徐建谢而付黄蕾夏文颖; 关键词：血浆DNA 食管癌双重PCR CEA

定量检测血浆DNA水平评估非小细胞肺癌患者术后复发的价值被引量：4: 2009年; 目的探讨定量检测非小细胞肺癌（NSCLC）患者手术前后的血浆DNA水平对术后复发的预测能力。方法采集做肺癌根治术的40名NSCLC患者术前2～14d（中住天数：6d）及术后5～16d（中位天数：8d）的静脉血，采用含内参照双重荧光定量PCR技术，进行血浆DNA定量检测。结果血浆DNA含量在100名健康对照者为18．5（15．5～24．9）ng／ml，在NSCLC患者术前为66．5（49．4—76．4）ng／ml，术后为56．9（43．1～89．6）ng／ml，均显著高于健康对照组（P〈0．001）。29例未复发患者，术后血浆DNA水平显著降低（P〈0．001），11例复发患者手术前后DNA水平无显著差异（P=0．131）。血浆DNA定量对NSCLC患者术后复发的诊断效能，在术前AUC：0．448，术后AUC：0．868，术后显著优于术前（P=0．002）。以术后血浆DNA≥73．3ng／ml作为临界值，预测复发的敏感性：81．8％，特异性：82．8％，阳性预测值：64．3％，阴性预测值192．3％。结论术后1—2周测定血浆DNA可对NSCLC患者术后复发进行评估，远早于常用的检查技术，具有重要的临床应用价值。; 穆原潘世扬张石江束永前陈亮张杰颜承靖陈丹张丽霞王宏蒋叶顾兵; 关键词：非小细胞肺癌手术复发血浆DNA

熔解曲线法用于肺癌APC基因甲基化模式的研究被引量：2: 2012年; 目的以熔解曲线法测定4株肺癌细胞株和肺癌病人APC基因启动子区的甲基化模式。方法以脐血淋巴细胞DNA及其转甲基后的DNA经化学修饰、克隆测序的质粒，作为完全非甲基化和完全甲基化标准品。设计通用引物，采用加入荧光染料SYBRGreen1的荧光定量PCR法扩增包含21个CpG位点的APC基因启动子区的目的序列，以熔解曲线法通过与完全非甲基化和完全甲基化标准品的Tm值比较，确定四株肺癌细胞株（NCI-H446，NCI-H460，SPCA1，NCI—H520）在该区段的甲基化模式，并通过克隆测序验证。同时测定两例肺癌患者癌组织中APC基因启动子区甲基化模式。结果四株肺癌细胞株中，NCI-H446，SPCA1和NCI—H520的Tm值与完全非甲基化标准品的Tm值相同，而NCI—H460的Tm值有两个，分别与完全非甲基化和完全甲基化标准品的Tm值吻合，并经克隆测序验证。两例肺癌患者癌组织的Tm值位于完全非甲基化和完全甲基化标准品的Tm值之间。结论小细胞肺癌细胞株NCI—H446，肺腺癌细胞株SPCA1和肺鳞癌细胞株NCI—H520的APC基因启动子区为完全未甲基化型，而大细胞肺癌细胞株NCI—H460APC基因启动子区甲基化模式为等位基因杂合型。两例肺癌患者癌组织中的APC基因启动子均为部分甲基化型。熔解曲线法是简单、经济和实用的甲基化模式检测方法。; 高丽潘世扬陈丹张丽霞谢而付徐建黄佩珺; 关键词：熔解曲线肺癌甲基化

实时荧光定量检测人血浆中RASSF1A基因启动子甲基化被引量：5: 2008年; 目的建立检测人血浆DNA中RASSF1A基因甲基化的方法。方法以肺癌细胞株NCI-H460作为RASSF1A基因启动子区甲基化阳性样本,传统酚/氯仿法提取细胞DNA,经紫外分光光度计定量后以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200μl健康人血浆中,制备得到模拟肺癌患者血浆。用磁珠法从模拟血浆样本和15例早期肺癌患者血浆中提取总DNA。对血浆DNA模板进行亚硫酸氢盐化学修饰,并以TaqMan技术的实时荧光定量甲基化特异性PCR(MSP)进行检测。以模拟血浆样品作为标准品,用外标准曲线法对肺癌患者血浆中的甲基化RASSF1A进行定量。结果实时荧光定量MSP对模拟肺癌患者血浆的检测最低限为150拷贝(甲基化的肿瘤DNA)/ml(血浆)。15例肺癌患者5例RASSF1A甲基化阳性(33.3%)。5例肺癌患者血浆中甲基化的RASSF1A基因的浓度分别为2.56×103,8.20×104,1.45×104,3.31×104和4.24×104拷贝/ml。结论实时荧光定量MSP法检测肺癌患者血浆DNA中RASSF1A基因甲基化,灵敏度高,特异性强。; 高丽潘世扬束永前谢而付陈进步赵文君穆原张丽霞陈丹黄珮珺张寄南; 关键词：RASSF1A 甲基化实时荧光定量甲基化特异性聚合酶链反应血浆DNA

血浆DNA定量检测在晚期肺癌患者个体化治疗中的应用被引量：6: 2010年; 目的通过监测晚期肺癌患者化疗过程中血浆DNA水平的变化,探讨其在疗效预测以及个体化治疗中的应用。方法采集35名晚期肺癌患者化疗前、后静脉血,用磁珠法提取血浆循环DNA和内参照质粒DNA,双重荧光定量PCR技术进行DNA定量检测,以100名体检健康者为对照。结果晚期肺癌患者化疗前血浆DNA平均含量为66.4（33.1-105.0）ng/ml,显著高于健康对照组血浆DNA平均含量22.4（16.2-30.0）ng/ml（P〈0.01）。一线药物化疗后,部分缓解组肺癌患者血浆DNA值较化疗前显著下降（P〈0.01）,且与病情稳定组、病情进展组患者血浆DNA值有显著差异（P均〈0.05）,而与健康对照组已无差异。生存曲线分析显示,化疗后血浆DNA〈50 ng/ml的患者生存率高于血浆DNA≥50 ng/ml的患者（P〈0.01）。结论血浆DNA的变化可敏感地反映晚期肺癌患者化疗疗效,在肿瘤个体化治疗中发挥重要作用。; 夏文颖丁清清潘世扬束永前徐婷陆雅春耿雁陈丹黄珮珺黄蕾徐建; 关键词：晚期肺癌化疗个体化治疗血浆DNA

血浆DNA定量用于重症肝炎患者肝细胞损伤评估被引量：9: 2009年; 目的定量重症肝炎患者血浆DNA的水平,与ALT比较,评估鉴别重症肝炎的临床应用价值。方法收集30例重症肝炎患者外周血标本6ml,以急性肝炎(20例)、慢性乙肝(90例)、肝硬化(45例)和健康体检者(100例)作为对照。用磁珠法提取血浆DNA,双重实时荧光定量PCR测定血浆DNA。结果乙型肝炎患者的血浆DNA水平(中位数)显著高于健康对照(104.2ng/mlvs.23.4ng/ml,P=0.0000)。血浆DNA水平在重症肝炎患者和急性肝炎、慢性乙肝及肝硬化患者之间都具有显著性差异(P=0.0018、0.0000和0.0000)。乙型肝炎患者的血清ALT水平(中位数)显著高于健康对照(107.5U/Lvs.24.1U/L,P=0.0000)。重症肝炎患者的血清ALT水平与急性肝炎之间有显著差异(P=0.0024),但与慢性乙肝和肝硬化之间没有差异(P=0.0600和1.0000)。ROC曲线分析显示,在鉴别重症肝炎和肝硬化以及慢性乙肝时,血浆DNA的鉴别能力显著优于血清ALT(AUC,0.95vs.0.51,P=0.0000;0.86vs.0.34,P=0.0000)。结论用双重荧光定量PCR检测血浆DNA水平,可以作为一个用于准确鉴别重症肝炎有价值的生物学标志。; 陈进步潘世扬周镇先王芳徐建徐建陈丹黄珮珺蒋理顾兵; 关键词：血浆DNA 重症肝炎 ALT 肝细胞

江苏省卫生厅重大科研项目(H200707)

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

江苏省卫生厅重大科研项目(H200707)

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈