江西省科技支撑计划项目(20122BBF60064)
- 作品数：5 被引量：16H指数：2
- 相关作者：戴亮芳罗向东温秀芳谢建坤张帆涛更多>>
- 相关机构：江西师范大学江西省农业科学院更多>>
- 发文基金：江西省科技支撑计划项目江西省教育厅科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 东乡野生稻及其渐渗系应答低磷胁迫的基因差异表达分析
- 2015年
- 以东乡野生稻耐低磷渐渗系IL171及其双亲（栽培稻‘协青早B’和东乡野生稻）为试材,采用cDNA-AFLP技术分析其幼苗期应答低磷胁迫的差异表达谱特征,并采用实时荧光定量PCR分析验证差异表达基因的表达特性,为探究东乡野生稻耐低磷胁迫的分子机制、发掘耐低磷相关的基因奠定基础。结果显示：（1）基于17对扩增效果较好的cDNA-AFLP引物分析发现,不同胁迫时间的参试材料与其对照组（正常磷水平）相比,具有很多（20～159个）上调或下调表达的差异片段。（2）与‘协青早B’相比,IL171中特异性上调的差异带有36条,下调表达61条,而东乡野生稻中分别有79条和136条;IL171与东乡野生稻共有的上调差异带为13条,下调差异带有15条。（3）回收纯化其中60条特异性差异表达条带,最终克隆测序获得50个差异表达基因片段TDFs;通过Blast比对和功能分析,可将TDFs分为8类,包括能量与代谢、基因表达调控、信号转导和转录因子等。（4）实时荧光定量PCR验证其中6个TDFs发现,各差异片段的荧光定量PCR表达模式与cDNA-AFLP结果一致,表明该实验的cDNAAFLP差异表达结果可靠,东乡野生稻的部分耐低磷相关基因已成功导入到渐渗系中,是发掘利用东乡野生稻耐低磷相关基因、探究其耐低磷分子机制的重要资源。
- 罗向东赵俊戴亮芳温秀芳刘李珠张帆涛谢建坤
- 关键词：东乡野生稻低磷胁迫CDNA-AFLP实时荧光定量PCR
- 东乡野生稻基因渐渗系中逆转座子逆转录酶序列的克隆及表达分析被引量：6
- 2013年
- 以东乡野生稻(Oryza rufipogon)耐冷渐渗系IL5335、IL5243及其双亲为试材,克隆到75条存在高度异质性的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列,经聚类分析将这些逆转录酶序列分为7个家族;家族6和7含有65条逆转录酶序列,序列间的相似性为44.9%–99.3%;家族1–5仅含10条逆转录酶序列,其中8条来源于耐冷渐渗系,它们与亲本的序列相似性为29.2%–52.8%,分析发现这些序列曾发生缺失或插入突变。实时荧光定量PCR检测结果显示,IL5335和IL5243中的houba、osr15及osr17逆转录酶的表达量均远高于受体亲本(表达量增加1.50–5.07倍),表明渐渗杂交诱发改变了IL5335和IL5243中逆转录酶序列的结构及其表达活性。该结果为今后水稻表观遗传学研究及外源优异基因利用奠定了基础。
- 陈雅玲罗向东张帆涛戴亮芳胡标林谢建坤
- 关键词：东乡野生稻表达活性渐渗系逆转座子
- 东乡野生稻渐渗系中外源DNA的遗传与序列变化被引量：1
- 2014年
- 本研究以东乡野生稻耐冷渐渗系IL5243和IL5335及其双亲为试验材料,利用139对SSR引物和35对AFLP引物分析东乡野生稻DNA在两耐冷渐渗系中的遗传与DNA序列变化特征,探讨基因组结构和序列变化对外源基因渐渗的作用及影响。SSR和AFLP的分析结果表明,BC1F10的耐冷渐渗系对双亲基因组的继承趋于稳定、纯合,绝大多数条带（85.15%~90.77%）与受体亲本协青早B一致,4.33%~7.17%的东乡野生稻外源DNA条带已成功导入渐渗系中。DNA测序及BLAST序列比对结果表明,被导入的外源DNA序列具有抗逆、抗病或其他生物学功能,但两耐冷渐渗系在遗传继承双亲遗传物质的同时,还呈现一些基于基因组DNA序列变化的非孟德尔式变异,包括亲本序列丢失和新序列出现以及碱基的颠换或转换,这些序列变异不仅可发生在非编码区的重复序列中,也可发生在功能基因序列中。研究结果表明东乡野生稻DNA渐渗诱发受体基因组产生广泛的变异,对拓宽栽培种遗传变异具有重要意义。
- 戴亮芳唐甸深赵俊邓小娟罗向东温秀芳谢建坤
- 关键词：东乡野生稻渐渗系
- 东乡野生稻耐冷渐渗系DNA甲基化水平和模式变化研究被引量：1
- 2015年
- 根据水稻全基因组和特定位点的CpG岛序列设计引物,采用McrBC酶酶切DNA,以东乡野生稻耐冷渐渗系（IL5335和IL5423）及其双亲为试材,研究其基因组和特定位点的DNA甲基化水平和模式变化特征,探讨甲基化变异对野生优异基因渐渗的影响。结果显示：（1）在覆盖全基因组的83个CpG岛中,IL5335和IL5423的基因组甲基化频率分别为46.6%和53.8%,低于受体亲本协青早B的62.6%;大部分（75.9%-80.7%）受体亲本的甲基化模式在两耐冷渐渗中能稳定遗传,另外一些位点发生了甲基化模式的改变,主要表现为脱甲基化（13.3%-18.1%）和过甲基化（4.4%-6.0%）。（2）在耐冷QTLs区间,两耐冷渐渗系的甲基化水平为13.3%-26.7%,远低于受体亲本的61.4%;它们在该区域的甲基化模式变异主要为脱甲基化（33.3%-40.0%）,高于全基因组的平均变异率。（3）分析逆转座子Houba和Osr14区域的51个CpG岛发现,耐冷渐渗系在该区域具有较高频率的甲基化修饰和较低的甲基化模式变异。研究表明,种间杂交渐渗诱发了受体亲本广泛的甲基化水平和模式变异,为野生优异基因的有效利用提供了新的机遇和挑战。
- 温秀芳戴亮芳赵俊罗向东邓晓娟张帆涛谢建坤
- 关键词：东乡野生稻DNA甲基化
- 不同花色杜鹃花色素成分与稳定性分析研究被引量：10
- 2013年
- [目的]全面分析不同花色杜鹃花的色素成分与稳定性。[方法]以4种不同花色的杜鹃花花瓣(浅红、紫色、白色和粉红色)为试材,对其花色素提取液进行紫外-可见光光谱扫描检测、特征显色反应和稳定性分析。[结果]试验表明,杜鹃不同花色色素不含叶绿素和类胡萝卜素;粉色、浅红色和紫色杜鹃花色素主要由花色素苷和类黄酮化合物组成;白色杜鹃花色素则含非红色的类黄酮化合物以及其他化合物,其花色素不具备邻二酚羟基或邻三酚羟基结构,揭示了杜鹃花色呈现差异的内在本质。紫外-可见光光谱扫描的结果表明,不同花色素溶液中的花色素种类与含量不同。稳定性研究表明,食品添加剂、低价金属离子对色素色泽无不良影响,但碱性环境、氧化还原剂以及Fe3+、Al3+均对其稳定性影响较大,探明了有利于杜鹃花色素稳定的环境条件。[结论]研究可为杜鹃花色素的分离鉴定奠定基础,同时也为天然杜鹃花色素的科学利用提供理论依据。
- 戴亮芳温秀芳罗向东
- 关键词：杜鹃花花色素花色素苷类黄酮稳定性
