国家自然科学基金(30400567)
- 作品数:4 被引量:11H指数:2
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- N-肉豆蔻酰基转移酶家族的进化踪迹分析研究被引量:2
- 2007年
- 为了阐明抗真菌药物作用新靶点———N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT)活性位点中的关键功能残基分布,指导设计特异性抑制剂,开展了NMT家族的蛋白多元序列联配研究,并构建了蛋白系统进化树。在此基础上,采用进化踪迹分析技术识别得到了NMT活性位点中肉豆蔻酰CoA结合位点、催化反应中心和抑制剂结合位点的重要功能残基。通过对白色念珠菌NMT活性位点中药物结合位点的研究发现,Trp126,Asn175和Thr211是NMT家族的高度保守残基,而且不与已有的抑制剂发生直接的相互作用,因此将是发现新型NMT抑制剂的重要药物结合位点。亚家族特异性残基Pro338,Leu350,Ile352和Ala353可作为已有抑制剂结构优化的重要位点,据此设计的新化合物将有望进一步提高对真菌NMT的选择性。进化踪迹分析结果为进一步阐明NMT结构-功能关系和新型NMT抑制剂类抗真菌药物的设计提供重要信息。
- 盛春泉朱杰张万年徐辉缪震元姚建忠张珉
- N-肉豆蔻酰基转移酶——抗真菌药物作用新靶点被引量:2
- 2005年
- 朱杰盛春泉张万年
- 关键词:抗真菌
- 白色念珠菌N-肉豆蔻酰基转移酶中药物结合位点的MCSS分析被引量:1
- 2008年
- 采用多拷贝同时搜寻方法(MCSS)分析得到了CaNMT活性位点的疏水区域、氢键结合位点和负电性区域.MCSS计算结果显示,CaNMT活性位点有两个疏水性比较强的区域:一个由Tyr107,Tyr109,Val108,Phe117,Phe123,Ala127,Phe176和Leu337等残基组成;另一个由Phe115,Phe240和Phe339组成.CaNMT活性位点发现有两个氢键作用区域,其中Tyr119,His227,Asn392和Leu451是与已有抑制剂的氢键结合位点,Tyr107,Asn175,Thr211和Asp412是新发现的氢键结合位点,而且在NMT家族中高度稳定,它们对设计新结构类型的CaNMT抑制剂具有重要作用.Leu451是负电性兼氢键作用位点,是抑制剂设计时所必需考虑的位点.
- 盛春泉朱杰张万年徐辉宋云龙张珉姚建忠缪震元
- 关键词:抗真菌药物设计
- 苯并呋喃类N-肉豆蔻酰基转移酶抑制剂的三维定量构效关系研究被引量:7
- 2006年
- 采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA),系统地研究了40个苯并呋喃类N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT)抑制剂的三维定量构效关系.在CoMFA研究中,考察了网格点步长对模型统计结果的影响.在CoMSIA研究中,研究了各种分子场组合、网格点步长和衰减因子对模型统计结果的影响,发现立体场、静电场、疏水场和氢键受体场的组合可得到最佳模型.所建立的CoMFA和CoMSIA模型的交叉相关系数q2值分别为0.759和0.730,均具有较强的预测能力.利用CoMFA和CoMSIA模型的三维等值线图直观地解释了化合物的构效关系,阐明了化合物结构中苯并呋喃环上各位置取代基对抑酶活性的影响,为进一步结构优化提供了重要依据.
- 朱杰盛春泉张珉宋云龙陈军余建鑫姚建忠缪震元张万年
- 关键词:苯并呋喃抗真菌三维定量构效关系