浙江省自然科学基金(LY13C150003)
- 作品数：8 被引量：22H指数：3
- 相关作者：蒋明管铭潘小翠王岚刘青娥更多>>
- 相关机构：台州学院丽水学院浙江省农业科学院更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金浙江省公益性技术应用研究计划项目台州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 青花菜种质资源遗传多样性的ISSR分析被引量：8
- 2014年
- 利用ISSR分子标记技术,对来自国内外的33个青花菜(Brassica oleracea var.italica)材料进行遗传多样性研究。从100条通用ISSR引物中筛选出15条用于PCR扩增,共得到可重复的211条清晰谱带,其中多态性谱带180条,多态性条带比率(PPB)为85.31%,平均Nei's基因多样性指数与Shannon's信息指数为0.332 7和0.487 7;材料间遗传距离范围为0.09～0.45,平均0.28;聚类分析表明,33份青花菜种质可分为4组,没有明显的地域分布规律。结果表明,ISSR标记可用于青花菜种质的分子鉴定;青花菜供试材料具有一定的遗传多样性。
- 王岚朱熠鹏蒋明楼潇潇赵罗鹏朱柯柯管铭
- 关键词：青花菜种质资源
- 青花菜抗病防卫基因BoSGT1的克隆、序列分析与诱导表达被引量：4
- 2015年
- SGT1参与了细胞周期、逆境反应、蛋白质泛素化和信号转导等过程,在植物抗病反应中起着重要作用.以青花菜（Brassica oleracea var.italica）为材料,克隆到SGT1基因,命名为BoSGT1,其基因组DNA和编码区全长分别为2 007和1 068bp,具有9个内含子;BoSGT1编码了355个氨基酸,编码蛋白含3个TPR、1个CS和1个SGS结构域.BoSGT1与14个SGT1的序列相似性为60%-87%,其中与拟南芥SGT1b的相似性最高;SGT1间的遗传距离为0.003-0.486,BoSGT1与血红老鹳草SGT1、拟南芥SGT1a及SGT1b聚为一组,与其他物种SGT1的关系相对较远,在进化树上处于不同分支.BoSGT1的表达受霜霉菌（Hyaloperonospora parasitica）和核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum）的诱导,在霜霉菌侵染下,6,12和24h的表达量增加;在核盘菌诱导下,6,12,24和36h的表达量增加,暗示BoSGT1的表达与霜霉病及菌核病的抗病反应有关.BoSGT1的克隆和表达分析为进一步研究其功能奠定了基础。
- 蒋明张志仙潘小翠管铭
- 关键词：青花菜抗病基因克隆基因表达
- 大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析被引量：5
- 2013年
- WRKY转录因子是一类重的调控分子，在高等植物中以基因家族的形式存在。试验以大白菜基因组数据为材料，利用生物信息学手段对WRKY转录因子进行了全基因组鉴定与分析。结果表明，大白菜至少有134个WRKY转录因子，蛋白序列长度为143～1082；基因组DNA全长880—9099bp，具1～15个内含子。染色体定位结果表明，10条染色体上均有WRKY转录因子基因的分布，A3染色体上最多（26），A10染色体分布最少（4）。大白菜WRKY转录因子可分为3大类，I类、Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为27，83和24，它们处于进化树的不同分支。除保守的WRKYGQK和常见变异序列WRKYGKK外，新发现WRKDGQK，WRKNGQK和WMKYGQK等3种WRKY结构域类型。
- 蒋明苗立祥张豫超管铭潘小翠
- 关键词：大白菜WRKY转录因子全基因组
- 结球白菜转录因子基因BrCCCH的克隆与分析
- 2014年
- CCCH型锌指蛋白是1种转录因子,在植物生长、发育和逆境反应中起着重要的调控作用。本研究以结球白菜叶片为材料,利用PCR技术克隆到1个CCCH基因。结果表明,BrCCCH的基因组全长为2 302 bp,具6个内含子,编码450个氨基酸,BrCCCH编码蛋白有5个保守的C-X8-C-X5-C-X3-H基序;序列比对结果表明,BrCCCH与13种植物CCCH基因的相似性为45%～97%,与同属植物芜菁的相似性最大,与禾本科的乌拉尔图小麦的相似性最小;从进化树上看,不同科的植物各自聚为1组,支持率达100%。BrCCCH基因的克隆为后续开展其表达分析和基因功能鉴定奠定了基础。
- 王岚金建峰蒋明赵罗鹏田星楼潇潇
- 关键词：结球白菜基因克隆转录因子
- 青花菜转录因子基因BoWRKY2的克隆与表达分析被引量：2
- 2015年
- 以青花菜为材料,克隆到1个WRKY转录因子基因Bo WRKY2,在序列分析的基础上,利用反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测其在核盘菌和霜霉菌侵染下的表达模式.结果表明:Bo WRKY2的基因组全长为1 507 bp,具有2个内含子,编码区全长为987 bp;Bo WRKY2编码328个氨基酸,具有1个WRKYGQK残基和C-X5-C-X23-H-X1-H锌指结构,WRKY结构域与甘蓝型油菜的最为相似,仅存在1个氨基酸残基的差异.进化分析结果表明,Bo WRKY2与同为十字花科的甘蓝型油菜、拟南芥、深山南芥、荠菜和盐芥聚为一组,支持率达97%.RT-PCR结果表明,Bo WRKY2的表达受霜霉菌和核盘菌的诱导,二者的表达模式相似,在6 h和12 h时表达量增加,但在24 h后下降,暗示Bo WRKY2与2种病菌的早期抗性反应相关.
- 蒋明陈贝贝管铭李金枝黄笑梅顾云吉
- 关键词：青花菜WRKY转录因子克隆基因表达抗病
- 青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
- 2016年
- 根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849个氨基酸;编码蛋白具CC(卷曲螺旋)、NBS和LRR结构域;进化分析结果表明,BoCNL1与不结球白菜的关系最近,在进化树上处于同一分支,与醉蝶花的关系最远;RT-PCR结果表明,BoCNL1在根、花茎、叶、花蕾、开放的花和嫩角果中均有表达,但表达量低。
- 黄笑梅金建峰张雪朱思眉朱柯柯赵罗鹏蒋明
- 关键词：青花菜抗病基因基因克隆
- 青花菜锌指蛋白基因BoCCCH1的克隆和表达分析被引量：3
- 2016年
- CCCH锌指蛋白广泛存在于真核生物中,在植物的生长、发育和逆境胁迫响应中起着重要作用。为获知青花菜CCCH转录因子基因的序列特征和表达特性,从青花菜叶片中克隆到1个CCCH基因,命名为Bo CCCH1,同时,利用RT-PCR方法研究了其在不同器官及霜霉菌侵染叶片中的表达模式。序列分析结果表明,Bo CCCH1的基因组全长为1 568 bp,包含1个长度为599 bp的内含子,2个长度分别为627 bp、342 bp的外显子,编码322个氨基酸,蛋白质的分子量与等电点分别为35 296.42 Da和8.47;Bo CCCH1有2个锌指结构,类型均为C-X8-C-X5-C-X3-H。系统发育分析结果表明,Bo CCCH1与其它植物的21条同源序列在进化树上分为6组,来自十字花科的CCCH与Bo CCCH1处于同一分支。基因表达结果表明,Bo CCCH1在叶、花茎、嫩角果、花蕾和花中表达,其中花茎和嫩角果的表达量最高,但在根中未检测到表达;在霜霉菌侵染下,叶片Bo CCCH1的表达量升高,到24 h和36 h时达到最大,推测Bo CCCH1与霜霉病抗性相关。本研究为进一步探明Bo CCCH1在霜霉病抗性反应中的功能奠定了基础。
- 蒋明刘青娥管铭张雪陈雅左诗璇
- 关键词：霜霉病基因表达青花菜
- 青花菜C3H型锌指蛋白基因BoCCCH2的克隆与表达被引量：1
- 2016年
- 以青花菜为材料,在克隆C3H型锌指蛋白基因BoCCCH2的基础上,研究该基因在不同器官及霜霉菌和灰葡萄孢菌侵染叶片中的表达模式。测序结果表明,BoCCCH2没有内含子,编码区全长为1 740bp,编码579个氨基酸,推导的蛋白质具2个ANK结构域和2种CCCH锌指结构,锌指结构的类型分别为C—X8—C—X5—C—X3—H和C—X5—C—X4—C—X3—H.反转录聚合酶链反应表明:BoCCCH2在根、叶、花茎、嫩角果、花蕾和花中均有表达,其中在根中的表达量最高;经霜霉菌和灰葡萄孢菌侵染后,该基因表达量均有不同程度的增加,其中在霜霉菌侵染下,表达量在24h后开始增加,72h时下降,而在灰葡萄孢菌侵染下,6h时的表达量最大,12h时开始缓慢下降。聚类结果表明,BoCCCH2与其他十字花科植物的同源序列聚为一类,支持率达100%,而与豆科、大戟科和蔷薇科等植物的序列处于不同分支。对BoCCCH2基因的克隆和表达分析为该基因功能研究奠定了基础。
- 蒋明刘青娥章燕如祝琦龚秀俞可可周秀倩
- 关键词：青花菜霜霉菌灰葡萄孢菌
