国家自然科学基金(30872161) 作品数:5 被引量:8 H指数:2 相关作者: 陈立 许文波 秦明辉 何树森 陈娜 更多>> 相关机构: 中国疾病预防控制中心 四川省疾病预防控制中心 北京市红十字血液中心 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 陕西省卫生厅科学研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
四川省2007~2008年急性弛缓性麻痹病例病原谱特征分析 被引量:2 2010年 目的描述四川省2007~2008年急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例监测中,分离到的部分非脊髓灰质炎肠道病毒(Nonpolio Enterovirus,NPEV)的型别特征,探讨AFP病例可能的病原谱。方法对四川省2007~2008年AFP病例中分离到的14株NPEV进行基因测序定型。结果测序结果经比较分析,确定肠道病毒(Enterovirus,EV)A组的柯萨奇病毒A组4、5、10型(Coxsackievirus Group A Type4、5、10,CVA4、CVA5、CVA10)和EV71型(Type71,EV71)各1株;EVB组的埃柯病毒(Enteric Cytopathogenic Human Orphan Virus,ECHO;引起细胞病变的人肠道孤儿病毒)6型(ECHO6)和30型(ECHO30)各3株,ECHO251株,CVA91株,CVB3和CVB5各1株。结论四川省2007~2008年AFP病例的病原谱可能包括多型别的NPEV。 陈立 陈娜 秦明辉 张淑琼 何树森 许文波关键词:非脊髓灰质炎肠道病毒 病原谱 四川省2009年手足口病病原--肠道病毒71型的分子特征 被引量:2 2010年 目的研究引起四川省2009年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)的肠道病毒71型(Enterovirus Type71,EV71)的基因特征。方法对四川省2009年HFMD病例中分离到的13株EV71,进行VP1编码区逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)扩增和核苷酸序列测定,构建遗传进化树进行基因型别分析。结果 13株分离株VP1编码区全长均为891个核苷酸,编码297个氨基酸,序列比较证实为EV71。进化分析表明,四川省EV71分离株属于C4a亚型。结论四川省2009年HFMD的病原为EV71,和中国大陆其他地区2004年以来的EV71分离株同属C4a亚型,在遗传进化上非常相近。 陈娜 陈立 童文彬 秦明辉 张淑琼 何树森 许文波关键词:手足口病 肠道病毒71型 进化分析 西藏自治区1999-2000年儿童柯萨奇病毒A组9型分子流行病学分析 被引量:2 2011年 目的研究西藏自治区1999--2000年≤5岁儿童柯萨奇病毒A组9型(CoxsackievirusA9,CVA9)VP1区编码基因特征及其分子流行病学特点。方法选取1999--2002年从西藏自治区〈15岁急性弛缓性麻痹(acuteflaccidparalysis,AFP)病例和≤5岁到儿童医院就诊儿童及部分健康儿童的659份粪便标本中分离的10株CVA9病毒,进行核糖核酸(RNA)提取,VP1编码区逆转录-聚合酶链反应(RT—PCR),PCR产物的核苷酸序列测定和分析。结果共分离出10株CVA9病毒,其中3株是从1999年标本中分离到的;另7株是从2000年标本分离到的,其他年份未分离到CVA9。10株CVA9病毒VP1区基因全长都是906bp,翻译的氨基酸全长为302aa。所测10株CVA9病毒序列之间同源性为79.0%~99.9%。所测序列与CVA9原型株-Griggs株相比,同源性为75.7%-78.7%。所构建的CVA9病毒遗传进化树将已知的CVA9病毒划分为2个组,西藏自治区分离的CVA9病毒分属于1,2组。结论西藏自治区1999、2000年儿童中流行的CVA9为2个不同组,1999年流行的病毒属于2组,2000年流行的病毒属于1组,西藏自治区1999、2000年CVA9流行为不同组。2001—2002年未发现CVA9的持续流行。 张欣欣 陈立 王慧玲 姜孟楠 朱晖 许文波 孔晓慧关键词:柯萨奇病毒感染 基因 西藏自治区儿童埃柯病毒29型分子流行病学分析 2015年 目的 研究西藏自治区1999-2000年≤5岁儿童埃柯病毒29型(Echovirus 29,ECHO29) VP1区编码基因特征及其分子流行病学特点.方法 选取1999-2002年从西藏自治区急性弛缓行麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例和≤5岁到儿童医院就诊儿童及部分健康儿童的659份粪便标本中分离的7株ECHO29病毒,进行核糖核酸(RNA)提取,VP1编码区逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),PCR产物的核苷酸序列测定和分析.结果 共分离出7株ECHO29病毒,其中5株是从1999年标本中分离到的;另2株是从2000年标本分离到的,其他年份未分离到ECHO29.7株ECHO29病毒VP1区基因全长都是876 bp,翻译的氨基酸全长为292 aa.所测7株ECHO29病毒序列之间同源性为75.41% ~ 99.3%.所测序列与ECHO29原型株JV-10相比,核苷酸同源性为77.1% ~81.23%,氨基酸同源性为71.26% ~ 79.69%.所构建的ECHO29病毒遗传进化树将已知的ECHO29病毒划分为4个基因型,西藏自治区的7株ECHO29病毒序列分别属于Genotype A和C.结论 首次报告的西藏自治区1999、2000年儿童中流行的ECHO29病毒为2个不同基因型,1999年流行的病毒属于Genotype C,2000年流行的病毒属于Genotype A,西藏自治区1999、2000年ECHO29病毒流行为不同基因型.2001-2002年未发现ECHO29病毒的持续流行。 张欣欣 朱晖 祝双利 陈立 杜忠东关键词:肠道病毒属 基因 基因型 脊髓灰质炎 陕西省健康儿童肠道病毒的分离与定型 被引量:2 2013年 目的对陕西省健康儿童肠道病毒(Enterovirus,EV)感染情况进行分析,为EV所引起疾病的预防与控制提供参考。方法按世界卫生组织《脊髓灰质炎实验室操作手册》规程进行病毒分离,用逆转录-聚合酶链反应扩增分离到的病毒VP1编码区基因片段,并进行核苷酸序列测定和分析,以鉴定EV的型别。结果对健康儿童159份粪便标本进行病毒分离,其中34份病毒分离阳性,阳性率21.38%。在阳性标本中,埃柯病毒(Enteric Cytopathogenic Human Orphan Virus,ECHO;引起细胞病变的人肠道孤儿病毒)7型(ECHO7)11份,占32.35%;柯萨奇病毒(Coxsackie Virus,CV)B组5型(CVB5)5份,占14.71%;ECHO14、CVB3各3份,各占8.82%;CVA92份,占5.88%;ECHO30、ECHO13各1份,各占2.94%;另外8株病毒未能确定型别。结论陕西省健康儿童中ECHO7感染率最高,且不同地区所分离的EV型别不同,增加了对EV所引起的疾病进行预防与控制的难度。 关蓉晖 李平 刘西珍 司源 赵汉民 王发强 李鹂 陈立关键词:肠道病毒 病毒分离 逆转录-聚合酶链反应