国家自然科学基金(31070731) 作品数:13 被引量:89 H指数:4 相关作者: 刘琼 倪嘉缵 陈平 王勇 何曼文 更多>> 相关机构: 深圳大学 中国科学院 安徽省华信生物药业股份有限公司 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省自然科学基金 广东省大学生创新实验项目 更多>> 相关领域: 理学 医药卫生 生物学 更多>>
阿尔茨海默病的防治策略研究进展 被引量:46 2013年 评述了阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的多种病因学说,包括胆碱能学说、β-淀粉样级联学说、ABC学说(aging,beta-amyloid,channel)、tau蛋白过度磷酸化学说、氧化应激学说、神经细胞凋亡学说和基因突变学说等.指出AD是多因素引起的病变,其发病机制也必然有多种.由于该病与人体衰老过程密切相关,发病机理复杂,且神经细胞丢失后不具再生能力,这就决定了研究治疗AD有效药物的艰巨性.还指出AD防治工作应重视早期预报和早期干预,发展早期诊断方法包括正电子发射计算机断层扫描、磁共振成像,及血液和尿液中寻找灵敏的生物标志物等技术方法.目前有关AD防治药物包括一线治疗药物、疫苗、尚在研究阶段的药物、辅助性治疗药物、中药以及医疗保健品.前3类药物因疗效或研究结果长期未取得突破性进展,人们开始关注后3类药物对延缓AD的作用及机理.课题组重点开展后3种药物防治AD的作用和机理研究,发现硒代蛋氨酸、辅酶Q-10和中药组分淫羊藿甙对防治AD有好的疗效.综述了目前抗AD药物的研究现状和面临的挑战,提出AD的防治策略是:摒弃针对单一致病因素的治疗思路,从多因素及内在相互联系的系统生物学角度,开展AD防治机制及新药研发. 倪嘉缵 陈平 刘琼 郑易之 何晓阳 宋国丽 应明 续旭关键词:神经退行性疾病 阿尔茨海默病 病理学 医学成像 药物疗法 人脑中硒蛋白W与鞘脂激活蛋白原相互作用的筛选与验证 被引量:1 2014年 硒蛋白W(SelW)是人脑中一种重要的硒蛋白.在缺硒的条件下,SelW在脑中具有优先储备的特性,但其具体机制和在脑中的功能至今尚不清楚.本文以SelW突变体SelW′为"诱饵",采用酵母双杂交系统对人胎脑文库进行筛选,获得与SelW相互作用的蛋白,其中一种为鞘脂激活蛋白原(PSAP).采用荧光共振能量转移技术中的受体漂白和敏化发射两种方法,验证了SelW与PSAP的相互作用.构建表达载体在大肠杆菌中成功表达出SelW′,利用Pull-down技术验证了SelW′与PSAP在细胞外的直接相互作用.采用免疫共沉淀的方法验证了上述两种蛋白在昆明小鼠脑组织中的内源性相互作用.基于SelW和PSAP的已知生物功能,推测SelW可能在脑部发育和神经退行性疾病形成过程中发挥着重要作用. 陈平 刘晴 马孝杰 王诗捷 刘琼 倪嘉缵关键词:免疫共沉淀 蛋白质胰蛋白酶水解过程双位点漏切肽段的质谱鉴定 被引量:4 2013年 为说明胰蛋白酶漏切位点数目设置对蛋白质搜库结果的影响,采用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白。在细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白的胰酶水解液中分别发现了2个和4个双胰酶漏切位点肽段,确认了文献中报道的当赖氨酸和赖氨酸相邻或赖氨酸、精氨酸各自与天冬氨酸或者谷氨酸相邻时,会引起胰蛋白酶的漏切。此外,还发现组氨酸-赖氨酸-异亮氨酸/丙氨酸结构也有此现象。本研究中检测出漏切肽段并没有明显提高序列覆盖率,但显著增加了蛋白质鉴定结果的确定性。在实际样品分析中如将漏切数设置为1有可能产生肽段鉴定的假阴性。 王勇 李水明 何曼文 邹永东关键词:胰蛋白酶 雌激素样化合物对人细胞色素氧化酶2A6基因的转录调控 2014年 目的建立尼古丁代谢酶CYP2A6报告基因高容量筛选系统,分析环境和天然雌激素样化合物对CYP2A6基因转录的影响。方法构建3种CYP2A6基因转录上游-2460^+1全长、增强子-启动子串联和3倍增强子-启动子串联的荧光素酶报告基因重组体pGL3-2A6 3UP,GL3-2A6 EP和pGL3-2A63EP,分别与雌激素受体α(ERα)及海肾荧光蛋白表达载体三重共转染人肝HepG2细胞。用双荧光素酶报告基因分析技术,选择确认对雌二醇诱导应答最强的CYP2A6报告基因系统;分别用氰戊菊酯、2,2',4,4'-四溴联苯醚、4-二羟基二苯基丙烷、全氟辛酸铵、淫羊藿苷、大豆苷元和槲皮素等7种拟雌激素化合物处理转染报告基因的HepG2细胞,同时设置雌二醇10 nmo·lL-1阳性和0.1%DMSO阴性对照,48 h后测定各组细胞相对荧光强度,分析评估拟雌激素物质对CYP2A6基因转录的诱导作用。结果 3种CYP2A6报告基因重组体中pGL3-2A6 3EP对雌二醇诱导应答最强,且呈显著量效依赖关系。7种拟雌激素化合物对CYP2A6报告基因均具显著诱导作用,其中,2,2',4,4'-四溴联苯醚1.0~100.0 nmol·L-1诱导倍变值为1.45±0.13~3.30±0.13(P<0.01),诱导效应最强。表现出相似的量效诱导关系,淫羊藿苷、大豆苷元和槲皮素10μmo·lL-1时的诱导倍变值为2.41~2.83(P<0.01)。结论建立灵敏可靠、重复性强的CYP2A6报告基因高容量筛选系统,证实多种拟雌激素物质通过激活ERα诱导CYP2A6报告基因转录。提示环境拟雌激素污染物和药材食材雌激素样活性物质可诱导个体尼古丁代谢酶基因表达,从而干扰个体尼古丁代谢清除活性及其对环境化合物致癌代谢活化水平。 黄春玲 邓寒 柯雪娥 韩霜雪 何晓阳关键词:细胞色素P450 CYP2A6 谷氨酸甲基化修饰的基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱分析 被引量:1 2013年 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了枯草芽孢杆菌中的蛋白酶抑制剂和杆菌肽F两种蛋白及其翻译后修饰,发现在这两种蛋白质中共有5个肽段发生谷氨酸甲基化,其中肽段FELVVYDSEHK存在FE(Methylation)LVVYDSEHK和FELVVYDSE(Methylation)HK两种形式。结果表明,MALDI-TOF/TOF高能CID所提供的丰富断裂信息和全质量范围扫描对提高分析结果的确定性具有重要作用。此外,这5个甲基化肽段都可以检测到相对含量更高的非甲基化肽段,这为降低分析结果的假阳性提供了辅助判据。在低质量区检测到甲基化赖氨酸的亚胺相关离子m/z 98和143,说明发生了赖氨酸的甲基化;检测到m/z 116则提示发生了谷氨酸甲基化。 王勇 李水明 何曼文 冯里茹 韩庆国关键词:枯草芽孢杆菌 溶菌酶基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱分析中的不常见修饰及脱水反应 被引量:6 2013年 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)分析了溶菌酶标准蛋白,在常规搜库条件下鉴定到6个独立肽段,Mascot得分420,鉴定覆盖率为54%。此外,经人工解析发现,肽段IVSDG-DGMNAWVAWR(98→112)在样品处理过程中发生了天冬酰胺脱氨化、天冬酰胺脱氨化+甲硫氨酸氧化、天冬酰胺脱氨化+甲硫氨酸氧化+色氨酸氧化等修饰,在激光解吸电离过程中发生脱水反应,脱水位点是脱氨后形成的第103位天冬氨酸。此外,还发现了部分肽段的丙酰胺化修饰。本研究表明,选择一级质谱中的极低丰度离子进行串联质谱分析和利用人工解析方法分析数据库未匹配数据,有可能发现一些特殊的蛋白质修饰,可增加数据利用度和分析结果的确定性。 王勇 李水明 何曼文关键词:溶菌酶 硒化聚甘露糖醛酸的合成及抗阿尔茨海默症细胞氧化与凋亡 被引量:10 2013年 以聚甘露糖醛酸为原料,采用先磺化、再硒化的方法合成了硒化聚甘露糖醛酸,产率为54%,产物硒含量为437.25μg/g.在2.5μmol/L硒浓度下,硒化聚甘露糖醛酸促细胞生长能力达到最适范围,能保护细胞免受过氧化氢损伤,显著提高阿尔茨海默症(AD)模型细胞N2a-APP695-sw中的超氧化物歧化酶和谷胱甘肽过氧化物酶的活性,降低细胞内活性氧自由基,增加线粒体膜电位,抑制细胞色素C的释放,在促进Bcl-2表达的同时抑制Bax的表达,从而具有抑制AD细胞凋亡的功能.硒化聚甘露糖醛酸也能抑制AD病理相关蛋白BACE1和APP的表达.结果表明,硒化聚甘露糖醛酸在抗AD方面具有潜在的应用前景. 朱志杰 刘琼 陈平 续旭 倪嘉缵 杨思林 宋云基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白 被引量:2 2013年 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因,同时还发现,虽然赖氨酸结尾肽段在MALDI源中信号强度普遍很低,但对它们进行串联质谱分析也可获得较好的谱图质量,部分数据可用于从头测序。考虑以上因素后,硒结合蛋白鉴定覆盖率由35%增至51%。 王勇 李水明 何曼文关键词:蛋白质鉴定 Bioinformatic prediction of selenoprotein genes in the dolphin genome 被引量:1 2012年 Selenium (Se), an essential trace element in vivo, is present mainly as selenocystein (Sec) in various selenoproteins. The Sec residue is translated from an in-frame TGA codon, which traditionally functions as a stop codon. Prediction of selenoprotein genes is difficult due to the lack of an effective method for distinguishing the dual function of the TGA codon in the open reading frame of a selenoprotein gene. In this article a eukaryotic bioinformatic prediction system that we have developed was used to predict selenoprotein genes from the genome of the common bottlenose dolphin, Tursiops truncatus. Sixteen selenoprotein genes were predicted, including selenoprotein P and glutathione peroxidase. In particular, a type II iodothyronine deiodinase was found to have two Sec residues, while the type I iodothyronine deiodinase gene has two alternative splice forms. These results provide important information for the investigation of the relationship between a variety of selenoproteins and the evolution of the marine-living dolphin. CHEN Hua JIANG Liang NI JiaZuan LIU Qiong ZHANG JiHong关键词:硒蛋白P 宽吻海豚 终止密码子 海豚基因组中硒蛋白基因的生物信息学预测 被引量:1 2012年 硒蛋白中的硒以硒代半胱氨酸(Sec)的形式存在.Sec由传统的终止密码子TGA编码.由于在可读框中难以区分TGA密码子在硒蛋白中的功能,硒蛋白基因的预测非常困难.利用本实验室建立的真核生物硒蛋白基因预测系统,从海豚基因组中识别了包括含2个Sec的2型碘甲腺氨酸脱碘酶(DI2)、具有可变剪切编码区的1型碘甲腺氨酸脱碘酶(DI1)及谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)、硒蛋白P(SelP)等16个硒蛋白,从基因信息的角度探索了海豚中硒蛋白与其特殊生存环境及进化阶段的关系等问题. 陈华 姜亮 倪嘉缵 刘琼 张继红关键词:硒蛋白 海豚 基因组 基因识别