国家自然科学基金(31060048)
- 作品数:3 被引量:9H指数:2
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- 濒危植物鄂尔多斯半日花(Helianthemum ordosicum)遗传多样性和遗传结构的ISSR分析
- 采用ISSR(Inter-simple sequence repeat)分子标记对内蒙古西鄂尔多斯国家自然保护区内半日花(Helianthemum ordosicum)自然居群的遗传多样性和遗传结构进行了分析。用20条筛...
- 魏磊乌兰巴特尔包会嘎史树德
- 关键词:半日花ISSR标记西鄂尔多斯
- 文献传递
- 濒危植物半日花的遗传多样性和谱系地理结构研究被引量:2
- 2017年
- 半日花是半日花科的一种半灌木或灌木,间断分布于我国内蒙古和新疆地区,由于种群数量稀少,现已被列为国家二级保护植物,开展半日花种群遗传多样性和谱系地理结构的研究对于半日花的科学保护具有重要意义。本文基于叶绿体DNA片段trnc-ycf6序列分析和AMOVA发现,半日花种群的遗传变异主要存在于居群间(93%),且居群间遗传分化很高(Gst=0.71,Fst=0.93,Nst=0.92);9个单倍型中4种为内蒙古特有,5种单倍型为新疆特有,有着显著的谱系地理学结构(Nst>Gst)且居群间基因流较低(Nm=0.1),表明半日花种群存在地理隔离,这也是该物种现有单倍型分布格局形成的原因。单倍型最大简约树和网络状树分析,西鄂尔多斯高原可能是半日花冰期"避难所"。
- 韩宝翠魏磊杨新英梁晓慧乌兰巴特尔史树德
- 关键词:半日花谱系地理学
- 富含多糖的强旱生植物半日花基因组DNA提取方法被引量:3
- 2014年
- 半日花(Helianthemum soongoricum)属强旱生植物,其组织富含多糖和多酚等次生代谢物质,采用常规CTAB和SDS等方法提取的半日花基因组DNA由于含有多糖等杂质,无法进行PCR扩增和限制性酶切等试验,为此,在CTAB法的基础上进行了改进。第1步通过向植物组织CTAB提取液中添加高盐和乙醇来沉淀部分多糖,第2步将获得的DNA粗提液,经过CTAB分离溶液沉淀、NaCl溶解、乙醇沉淀等方法,可有效去除半日花组织中的残余多糖等杂质,提取DNA的质量和纯度经凝胶电泳条带清晰、无降解、无多糖等杂质。PCR扩增和限制性内切酶的结果表明,通过改进的方法所获得的DNA,可以进行PCR扩增试验,扩增条带清晰,基因组DNA能被限制性内切酶完全酶切,该方法为后续半日花分子生物学研究奠定了重要基础。
- 白沙如拉庞磊史树德魏磊
- 关键词:半日花多糖
- 基于ISSR标记的珍稀濒危植物内蒙古半日花(Helianthemum ordosicum)遗传多样性和遗传结构研究被引量:5
- 2014年
- 采用ISSR(Inter-simple sequence repeat)分子标记对内蒙古半日花(Helianthemum ordosicum)自然居群的遗传多样性和遗传结构进行了分析。20个多态性引物在4个居群(412个体)中共检测到246条带(211条具多态性),多态位点比率为86.3%。在居群水平上,Nei’s基因多样性和Shannon’s信息指数分别为0.247和0.318;在物种水平上分别为0.306和0.461。基因分化系数Gst为0.432,基因流Nm值为0.658。分子方差(AMOVA)分析显示总的遗传变异中有46.67%的遗传变异存在于居群间。居群间聚类分析表明:千里沟与桌子山居群遗传距离最小,其次为与棋盘井居群,最远为与阿尔巴斯居群,Mantel检测表明半日花遗传距离与地理距离无相关性。本研究结果表明半日花居群间和居群内具有较丰富的遗传多样性,为今后有效保护半日花种质资源提供了理论依据。
- 魏磊白沙如拉厐磊乌兰巴特尔包会嘎史树德
- 关键词:半日花ISSR标记西鄂尔多斯