杭州市卫生科技计划项目(2010B078)
- 作品数：10 被引量：40H指数：5
- 相关作者：吴康乐姜如金吴晋兰马兆龙孔海深更多>>
- 相关机构：杭州市余杭区中医院杭州市余杭区第五人民医院宁波市第一医院更多>>
- 发文基金：杭州市卫生科技计划项目杭州市科技发展计划项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 多药耐药肺炎克雷伯菌β-内酰胺类耐药机制研究被引量：6
- 2012年
- 目的调查多药耐药肺炎克雷伯菌中β-内酰胺酶基因的存在情况。方法收集2010年3-5月浙江大学附属第一医院住院患者标本中分离的多药耐药肺炎克雷伯菌共15株,先做β-内酰胺酶分型,再做改良Hodge试验检测产碳青霉烯酶表型,然后采用聚合酶链反应(PCR)的方法分析40种β-内酰胺酶基因。结果 15株多药耐药肺炎克雷伯菌共检出TEM-1 12株、KPC-2 9株、KPC-2-like 2株、OXA-30 1株,检出率分别为80.00%、60.00%、13.33%、6.67%,2号株与6号株KPC基因为KPC新的变异型(KPC-2-like,GenBank登录号:HQ258934);其他基因均未检出。结论该组15株多药耐药肺炎克雷伯菌耐β-内酰胺类药物与细菌产4种β-内酰胺基因相关。
- 朱健铭刘国庆姜如金吴康乐马兆龙
- 关键词：肺炎克雷伯菌Β-内酰胺酶基因Β-内酰胺类多药耐药
- 耐药肺炎克雷伯菌JM45株氨基糖苷类药物耐药比较基因组学分析被引量：2
- 2013年
- 目的了解1株多耐药肺炎克雷伯菌JM45株对氨基糖苷类药物耐药的遗传学背景。方法采用罗氏454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序（完成图），再分析氨基糖苷类修饰酶基因、16S核糖体RNA（rRNA）甲基化酶基因检测状况，并和其他已经完成全基因组测序的革兰阴性菌作比较基因组学分析。结果最终得到肺炎克雷伯菌JM45株1条完整的基因组（染色体）序列及2条质粒序列。基因组（染色体）序列为5273812bp（GC含量65．8％），质粒1序列为317156bp（GC含量53．0％），质粒2序列为12209bp（GC含量55．3％）。在质粒1中发现了氨基糖苷类腺苷转移酶基因aadA2（KPN_5186）和16SrRNA甲基化酶基因rmtB（KPN_5243）。由全基因组洲序可见aadA2基因位于整合子中，排序为intIA-DfrA12aadA2-OFf3／qacE；rmtB基因位于转座子中，排序为tnpA-TEM-1-rmtB。结论携带aadA2和rmtB基因是JM45株耐氨基糖苷类药物的丰要原因。
- 朱健铭姜如金吴晋兰吴康乐张烽翁幸鐾孔海深张嵘
- 关键词：基因组学氨基糖苷类
- 多药耐药肺炎克雷伯菌噬菌体原/噬菌体、整合子、转座子、插入序列及质粒遗传标记分析被引量：12
- 2012年
- 目的调查多药耐药肺炎克雷伯菌(MDRKP)中噬菌体原/噬菌体、整合子、转座子、插入序列和质粒等可移动遗传元件遗传标记的存在情况。方法收集2008年8月-2010年5月6所医院共47株MDRKP,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法,分析12种噬菌体原/噬菌体、3种整合子、7种转座子插入序列和两种质粒共24种可移动遗传元件遗传标记。结果该组MDRKP共检出1种噬菌体原/噬菌体、1种整合子、6种转座子和插入序列、两种质粒遗传标记。结论携带Ⅰ类整合子(intⅠ1)、插入序列(IS26、IS903、ISEcp1、ISKpn6)、耐药质粒(trbC)是该组MDRKP耐药的一个重要原因,MDRKP同时作噬菌体原/噬菌体、整合子、转座子、插入序列和质粒等遗传标记检测为国内首次。
- 朱健铭吴晋兰姜如金吴康乐
- 关键词：肺炎克雷伯菌质粒转座子整合子可移动遗传元件
- 多药耐药肺炎克雷伯菌15种抗菌制剂外排泵基因研究
- 2012年
- 目的调查一组多药耐药肺炎克雷伯菌(MDRKP)中抗菌制剂外排泵基因的存在情况。方法收集2008年8月-2010年5月浙江省杭州市和湖州市6所医院共47株MDRKP,采用聚合酶链反应(PCR)的方法分析15种抗菌制剂外排泵基因。结果 47株MDRKP共检出emrB、mdfA、ramA、qacE△1、oqxA、tehA、smr-Kpn、sugE、tetB、emrD和tetA 11种抗菌制剂外排泵基因,阳性率分别为100.00%、100.00%、100.00%、82.98%、80.85%、29.79%、8.51%、4.26%、4.26%、2.13%、2.13%,其余4种基因未检出;可分为10种阳性检出模式,其中以emrB+mdfA+ramA+oqxA+qacE△1阳性模式为主,占53.19%。结论携带这11种抗菌制剂外排泵基因是导致本组菌呈多药耐药的一个重要原因,在肺炎克雷伯菌同时检测这15种抗菌制剂外排泵基因为国内首次报道。
- 朱健铭姜如金吴康乐马兆龙
- 关键词：肺炎克雷伯菌外排泵基因多药耐药
- 多药耐药肺炎克雷伯菌对利福平及磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药机制的研究被引量：9
- 2012年
- 目的研究多药耐药肺炎克雷伯菌对利福平及磺胺甲噁唑/甲氧苄啶的耐药机制。方法收集2008年8月-2010年5月浙江省杭州市和湖州市6所医院共47株肺炎克雷伯菌,采用聚合酶链反应(PCR)的方法分析1种利福平耐药相关基因和5种磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药相关基因。结果该组肺炎克雷伯菌共检出1种利福平耐药相关基因和3种磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药相关基因。结论携带1种利福平耐药相关基因和3种磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药相关基因是该组菌对利福平和磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药的一个重要原因。
- 朱健铭姜如金吴康乐马兆龙
- 关键词：肺炎克雷伯菌利福平多药耐药
- 多耐药肺炎克雷伯菌外排泵基因研究
- 2012年
- 目的调查一组多重耐药肺炎克雷伯菌(MDR-KPN)中外排泵基因的存在情况。方法收集2008年8月～2010年5月浙江省杭州市和湖州市6所医院共47株MDR-KPN,采用聚合酶链反应(PCR)方法分析15种抗茵药物外排泵基因。结果 47株MDR-KPN共检出emrB、mdfA、ramA、qacE△1、oqxA、tehA、smr-Kpn、sugE、tetB、emrD和tetA11种抗茵制剂外排泵基因,阳性株数(%)分别为47株(100.0%)、47株(100.0%)、47株(100.0%)、39株(83.0%)、38株(80.9%)、14株(29.8%)、4株(8.5%)、2株(4.3%)、2株(4.3%)、1株(2.1%)和1株(2.1%),其余4种基因未检出;可分为10种阳性检出模式,其中以emrB+mdfA+ramA+oqxA+qacE△1阳性模式为主,占53.2%。结论携带这11种抗菌药物外排泵基因是导致本组KPN呈多药耐药的一个重要原因。
- 朱健铭姜如金吴康乐马兆龙
- 关键词：肺炎克雷伯菌外排泵基因多重耐药
- 多重耐药肺炎克雷伯菌获得性耐药相关基因和可移动遗传元件检测与指标聚类分析被引量：5
- 2012年
- 目的探讨一组多重耐药肺炎克雷伯菌(MDR-KPN)中获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的存在状况以及二者的相关性。方法收集2008年8月至2010年5月浙江省杭州市和湖州市6所医院共47株MDR-KPN,采用聚合酶链反应(PCR)的方法分析74种获得性耐药基因和24种可移动遗传元件遗传标记,并用指标聚类分析(SPSS法)分析获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的相关性。结果 47株MDR-KPN共检出5种β-内酰胺类获得性耐药基因、6种氨基糖苷类获得性耐药基因、3种喹诺酮类获得性耐药基因、6种其他获得性耐药基因、1种整合子遗传标记、2种转座子遗传标记、4种插入序列遗传标记、2种接合性质粒遗传标记和1种噬菌体原标记;指标聚类分析(SPSS法)将上述阳性检出基因分成A、B两大簇。结论指标聚类分析提示获得性耐药相关基因和可移动遗传元件密切相关;由Ⅰ类整合子(intI1)、插入序列(IS26、ISEcp1、ISKpn6)、耐药质粒(trbC)介导的TEM-1和KPC是本组菌株的特征。在肺炎克雷伯菌中做指标聚类分析为国内首次报道。
- 朱健铭吴晋兰姜如金吴康乐
- 关键词：肺炎克雷伯菌获得性耐药基因可移动遗传元件指标聚类分析多重耐药性
- 多药耐药肺炎克雷伯菌氨基糖苷类修饰酶与16S rRNA甲基化酶基因研究被引量：5
- 2012年
- 目的研究多药耐药肺炎克雷伯菌(MDRKP)氨基糖苷类药物耐药的遗传学背景。方法收集2008年8月-2010年5月6所医院共47株肺炎克雷伯菌,采用聚合酶链反应(PCR)的方法分析15种氨基糖苷类修饰酶和6种16S rRNA甲基化酶基因。结果该组肺炎克雷伯菌共检出4种氨基糖苷类修饰酶和1种16S rRNA甲基化酶基因,可分为16种阳性检出模式,并发现两株菌携带aac(6′)-Ⅰb基因新亚型[aac(6′)-Ⅰb-hz,美国GenBank登录号:JF901756];其他16种基因未检出。结论携带氨基糖苷类修饰酶和16S rRNA甲基化酶基因,是该组肺炎克雷伯菌对氨基糖苷类药物耐药的主要原因,在多药耐药肺炎克雷伯菌中发现aac(6′)-Ⅰb新亚型[aac(6′)-Ⅰb-hz]为国内外首次报道。
- 朱健铭肖丹宇姜如金吴康乐
- 关键词：肺炎克雷伯菌氨基糖苷类修饰酶基因
- 多重耐药肺炎克雷伯菌获得性耐药相关基因和可移动遗传元件检测与指标聚类分析
- 2012年
- 目的探讨一组多重耐药肺炎克雷伯菌(MDR-KPN)中获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的存在状况以及两者的相关性。方法收集2008年8月～2010年5月浙江省杭州市和湖州市6所医院共47株MDR-KPN,采用聚合酶链反应(PCR)的方法分析74种获得性耐药基因和24种可移动遗传元件遗传标记,并用指标聚类分析(SPSS法)分析获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的相关性。结果 47株MDR-KPN共检出5种β-酰胺类获得性耐药基因、6种氨基糖苷类获得性耐药基因、3种喹诺酮类获得性耐药基因、6种其它获得性耐药基因、1种整合子遗传标记、2种转座子遗传标记、4种插入序列遗传标记、2种接合性质粒遗传标记和1种噬菌体原标记;SPSS法将上述阳性检出基因分成A、B两大簇。结论指标聚类分析提示获得性耐药相关基因和可移动遗传元件密切相关;由Ⅰ类整合子(intI1)、插入序列(IS26、ISEcp1、ISKpn6)、耐药质粒(trbC)介导的TEM-1和KPC是本组菌株的特征。
- 朱健铭吴晋兰姜如金吴康乐
- 关键词：肺炎克雷伯菌获得性耐药基因可移动遗传元件指标聚类分析多重耐药性
- 肺炎克雷伯菌单基因分子进化分析及多位点序列分型与基因组系统学研究被引量：2
- 2014年
- 目的比较7株已完成全基因组测序的肺炎克雷伯菌单基因分子进化分析及多位点序列(MLST)分型与基因组系统学研究的结果,研究其亲缘关系。方法采用Roche 454高通量测序技术对1株泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),再与NCBI已完成全基因组测序的6株肺炎克雷伯菌9种看家基因进行单个基因分子进化分析,将该9个基因序列串联作MLST分型,并将7株肺炎克雷伯菌的全基因组序列作聚类分析(为Fast Minimum Evolutin法)。结果 JM45株测得一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列;因为不同的基因进化率不同,7株肺炎克雷伯菌9种看家基因单个基因序列的分子进化图并不一致;7株肺炎克雷伯菌MLST分型可见JM45株与HS11286株相同(即为同一型),1084株与NTUH-K2044株相同,但7株肺炎克雷伯菌基因组系统学分析可见,JM45株与HS11286株并不相同(即非为同一型),JM45株与HS11286株距离最近,与342株距离最远,其他各株介于二者之间。结论采用单个基因序列的分子进化分析法及MLST分型用作菌株亲缘性关系分析法并不可靠,本研究为国内首个单个看家基因分子进化分析及MLST分型与基因组系统学研究的比较报道。
- 朱健铭姜如金吴康乐张烽翁幸鐾孔海深
- 关键词：肺炎克雷伯菌泛耐药多位点序列分型
