国家自然科学基金(31060001)
- 作品数:8 被引量:37H指数:4
- 相关作者:张利莉夏占峰张飞万传星柳成宾更多>>
- 相关机构:塔里木大学西华大学四川理工学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 链霉菌TRM44001中拒霉素分离鉴定及其对表皮葡萄球菌的抑菌作用被引量:1
- 2015年
- 【目的】从一株对表皮葡萄球菌有拮抗活性的放线菌中寻找具有奶牛乳房炎防治潜力的抗生素。【方法】对菌株TRM 44001进行16S rRNA鉴定,硅胶柱层析及制备薄层层析法分离该菌的次生代谢产物,活性追踪获得活性化合物,采用1H NMR、13C NMR谱并结合二维谱解析化合物结构,检测化合物对表皮葡萄球菌抑菌活性,采用流式细胞仪分析化合物对表皮葡萄球菌细胞膜通透性的影响。【结果】经16S rRNA序列对比分析,鉴定TRM 44001为暗红灰链霉菌(Streptomyces erythrogriseus)。从该菌的发酵液中分离到2个化合物,分别鉴定为拒霉素(resistomycin,1)和特曲霉素D(tetracenomycin D,2)。拒霉素对表皮葡萄球菌有较强抑制作用,最低抑菌浓度为2.0μg/m L;流式细胞仪分析结果表明拒霉素可以增大表皮葡萄球菌的细胞膜通透性,并呈明显的量效关系。【结论】从暗红灰链霉菌(S.erythrogriseus)发酵液中分离鉴定拒霉素,拒霉素通过增大表皮葡萄球菌细胞膜的通透性起到抑菌作用。
- 班万里万传星曾红张利莉
- 关键词:表皮葡萄球菌抑菌活性
- 拜城盐山免培养放线菌多样性研究被引量:2
- 2012年
- [目的]研究新疆拜城盐山高盐环境中的放线菌多样性,为今后的开发和利用奠定基础。[方法]应用基于16S rRNA基因序列的免培养技术和系统发育分析方法对拜城盐山样品中的放线菌多样性进行研究。采用SDS-CTAB方法提取样品中的总DNA,利用特异性引物扩增样品DNA中的放线菌16S rRNA基因,并构建放线菌16S rRNA基因克隆文库;通过比较酶切图谱,挑选克隆文库中的代表克隆,进行序列测定和BLAST比对分析。[结果]构建的放线菌克隆文库共包含216个放线菌克隆。克隆序列经过BLAST比对分析,放线菌亚纲中的克隆有171个,占总克隆数的79.2%。酸微菌亚纲45个克隆,占总克隆数的20.8%,与GenBank中已知的微球菌16S rRNA基因序列最大相似度小于92%,是酸微菌亚纲中新的类群。优势放线菌为放线菌亚纲棒杆菌亚目诺卡氏菌科(Nocardiaceae)的红球菌属(Rhodococcus),占克隆总数的51.9%。有24.5%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表着放线菌新的类群。[结论]拜城盐山存在着较为丰富的放线菌种类,并且潜藏着新类型的放线菌资源。
- 周慧杰周慧杰夏占峰张娇张瑶张利莉
- 关键词:放线菌多样性
- 塔里木盆地5个生态小区稀有放线菌分离及合成抗生素基因分布被引量:4
- 2018年
- 为调查塔里木盆地5个代表性生态小区的稀有放线菌分布,并评估它们产生抗生素类活性物质的潜力。采集塔里木盆地5个生态小区混合土样5份,采用7种培养基分离样品中的稀有放线菌。通过检测分析I型PKS、Ⅱ型PKS、NRPS、APH、HMG-CoA五种抗生素合成相关基因的分布,评估该地区稀有放线菌产生抗生素的潜力。结果表明:(1)基于分子鉴定,经合并重复,共分离得到18种稀有放线菌,属于放线菌的10个属。(2)塔里木河河岸林生态小区土样稀有放线菌分离种类最多(10种),为8个属,塔克拉玛干沙漠塔里木河东部生态小区最少(4种),为4个属。(3)18株稀有放线菌中有9株含有I型PKS基因、4株菌含有Ⅱ型PKS基因、4株菌含有APH基因、3株菌含有NRPS基因,有一株链孢囊菌同时含有I型PKS、Ⅱ型PKS、NRPS、APH 4种基因。5个生态小区稀有放线菌种类较多,并含有较为丰富的与抗生素合成相关的基因。
- 朱荣贵关统伟姜秀娟
- 关键词:塔里木盆地生态小区稀有放线菌功能基因筛选
- DNA提取方法对盐环境放线菌多样性分析的影响被引量:6
- 2013年
- 【目的】研究DNA提取方法对盐环境中放线菌的16S rDNA RFLP(Restriction Fragment LengthPolymorphism,限制性片段长度多态性)多样性分析结果的影响。【方法】采用CTAB-SDS法、玻璃珠法和反复冻融法3种方法提取焉耆盐场土壤样品DNA,利用放线菌特异性引物扩增16S rDNA并分别构建文库。采用HaeⅢ限制性内切酶对阳性克隆进行RFLP分析,选取不同的克隆进行测序、比对并构建16S rDNA序列系统发育树。【结果】3种DNA提取方法构建的16S rDNA克隆文库OTUs-(Operational Taxonomic Unit)数不同,其中CTAB-SDS法获得35个OTUs,玻璃珠法获得19个OTUs,反复冻融法获得14个OTUs。3种方法中有52%的OTUs序列与已知可培养的放线菌或未发表的克隆子序列相似性较低,可能代表着放线菌新的类群;3种方法得到的放线菌均分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)。【结论】DNA提取方法是影响评价放线菌多样性的重要因素。本研究所采用的DNA提取方法各自存在一些优缺点,因此评估盐环境中的微生物多样性时建议采用几种方法组合。而焉耆盐场这一盐环境可能存在丰富的放线菌物种多样性,并蕴藏着新的分类单元有待进一步研究。
- 张娇夏占峰贺江舟孙红专张利莉
- 关键词:DNA提取克隆文库放线菌多样性
- 响应面法优化棉花黄萎菌拮抗放线菌TRM42561菌株发酵条件研究被引量:1
- 2013年
- 应用响应面法对棉花黄萎菌拮抗放线菌TRM42561菌株的发酵条件进行优化。首先通过Plackett-Burman设计对影响抑菌活性的8因素进行筛选,获得两个关键因素:转速(X1)、玉米粉与蛋白胨(X2)。然后利用最陡爬坡试验逼近最大响应区域,并结合中心组合试验以及响应面分析法,建立了以对棉花黄萎菌抑菌圈直径为响应值的二次回归方程,即Y=-4036+31.5 X1+1014 X2-0.777 X1.X2-0.0796 X12-196 X22,该模型预测最大抑菌圈直径为33.52 mm。从中获得最佳发酵条件:玉米粉16.6 g·L-1,蛋白胨5.6 g·L-1,葡萄糖20 g·L-1,氯化钠40 g·L-1,碳酸钙1 g·L-1,转速187 r·min-1,初始pH 6.0,接种量6%,装液量80 mL/250mL,温度36℃。采用此发酵条件,供试菌抑菌圈直径达到33(±0.20)mm,与预测值基本相符。说明预测模型准确可靠,响应面分析法可用于TRM42561菌株发酵条件的优化。
- 柳成宾李艳宾张飞张利莉
- 关键词:放线菌拮抗棉花黄萎菌发酵条件优化响应面法
- 新疆盐环境棉花黄萎菌拮抗放线菌的筛选及菌株TRM42561的防效测定和鉴定被引量:15
- 2014年
- 为充分发掘新疆盐环境中生防活性放线菌,以棉花黄萎菌为靶标,从805株新疆盐环境放线菌中筛选获得14株拮抗菌,其中菌株TRM42561抑菌活性最强,其发酵液对棉花黄萎菌的抑菌圈直径达26.33 mm,且对6种常见植物病原真菌和4种细菌均有较好的抑制效果,抗菌谱广。室内抑菌活性表明,拮抗菌TRM42561发酵液对棉花黄萎菌菌丝生长抑制率为83.75%,孢子萌发抑制率为68.75%。田间试验结果表明,拮抗菌TRM42561对棉花黄萎病的田间防治效果显著,在3次施药后的第15和30 d,其防治效果分别达到33.06%和41.65%。通过菌株形态特征、培养特性、生理特性以及16S rDNA序列分析,确定拮抗菌TRM42561为娄彻氏链霉菌Streptomyces rochei。
- 柳成宾万传星贾晓宇张飞徐彪范瑛阁张利莉
- 关键词:拮抗放线菌棉花黄萎菌生物防治
- 阿克苏高盐咸水滩放线菌分离新策略及系统发育多样性被引量:5
- 2013年
- 【目的】探讨高盐咸水滩放线菌的分离新策略,为高盐地区放线菌资源的分离提供理论依据。【方法】以甘油-精氨酸培养基、海藻糖-肌酸培养基、甘油-天冬氨酸培养基、甘露醇-酸水解酪蛋白培养基、干酪素-甘露醇、甘露醇-丙氨酸培养基、壳聚糖-天冬酰胺培养基和高氏一号琼脂培养基8种培养基为基础培养基,采用营养成分十倍稀释法、据土样理化性质模拟原始生态环境、免培养分子技术检测菌株的分离培养基及培养条件指导放线菌可培养以及借鉴半咸水海洋环境放线菌分离培养基等4种策略来优化设计培养基,进行阿克苏高盐咸水滩土样放线菌的分离,并采用细菌通用引物进行16S rRNA基因扩增和序列测定,并构建系统发育树。【结果】共分离到403株,分属于放线菌的8个亚目10个科,Streptomyces、Streptomonospora、Saccharomonospora、Plantactinospora、Nocardia、Amycolatopsis、Glycomyces、Micromonospora、Nocardiopsis、Isoptericola、Nonomuraea、Thermobifida、Actinopolyspora和Actinomadura等14个属。69.96%菌株属于链霉菌亚目(Streptomycineae),9.68%菌株属于链孢囊菌亚目(Streptosporangineae),9株为潜在新种。【结论】4种分离新策略显著地提高了高盐地区放线菌的可培养性,还发现了许多新物种,为放线菌的分离提供了新思路与途径。
- 张瑶夏占峰曹鑫波李军张利莉
- 关键词:放线菌培养基
- 新疆硝尔库勒湖可培养放线菌多样性研究
- 新疆地域辽阔,地形复杂。由于较为封闭的地理位置和极为干旱的气候环境,孕育了许多盐湖,包括干盐湖。硝尔库勒湖位于新疆阿图什市境内,湖盐以氯化钠为主,盐浓度近于饱和,湖面卤水很少,正向干盐湖趋近,这为我们研究极端环境微生物资...
- 陈正军关统伟夏占峰张利莉
- 文献传递
- 新疆硝尔库勒盐湖放线菌分离方法的初步研究被引量:3
- 2012年
- 为了研究新疆硝尔库勒盐湖中的放线菌多样性,以微生物抗高渗透压的生理机制为指导,结合盐湖高盐、寡营养的特点,设计了含有在嗜盐微生物细胞中起渗透调节作用的多种碳源和氮源的分离培养基,以TP培养基、GW1培养基和F6培养基为对照,对新疆硝尔库勒湖沉积物样品进行分离。结果表明,海藻糖-肌酸培养基(B3)分离效果最好,能分离到10个属16个不同种的放线菌;海藻糖-天冬氨酸培养基(B1)和海藻糖-谷氨酸培养基(B2)分离效果次之,均能分离到5个属7个不同种的放线菌,并有2个潜在的放线菌新物种被发现(菌株编号为41376、41293)。这说明以渗透调节物作为碳源和氮源是高盐环境放线菌分离比较理想的选择,为以后高盐环境微生物的分离培养提供了理论指导。
- 陈正军关统伟张利莉
- 关键词:放线菌