国家自然科学基金(31000537)
- 作品数:4 被引量:18H指数:3
- 相关作者:陈新王惠君卢诚王文泉王海燕更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院琼州学院海南大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 中药艾总DNA的提取及ISSR-PCR反应体系的优化被引量:6
- 2015年
- 为探索艾的遗传多样性,采用正交试验方法 L16(45)与单因素分析法相结合对其PCR反应的5个主要因素(Mg2+、引物、模板DNA、dNTPs以及Taq酶)在4个水平上分别进行优化。结果表明:得到最佳的反应体系(20μL)为模板DNA 60ng,Mg2+2.5mmol/L,引物0.8μmol/L,dNTPs 0.15mmol/L,Taq酶1.0U。通过统计数据分析,对艾ISSR-PCR反应的影响程度依次为Mg2+浓度>引物>模板DNA>dNTPs浓度>Taq酶。
- 王惠君王文泉卢诚王海燕陈新
- 关键词:分子标记ISSR传统中药
- 一种简单高效的聚丙烯酰胺凝胶DNA回收方法被引量:5
- 2011年
- 笔者介绍了一种简单的聚丙烯酰胺凝胶DNA回收方法(直取法),通过与传统煮沸法比较以证明直取法回收聚丙烯酰胺凝胶DNA的高效性。以木薯cDNA为材料,将直取法与常规煮沸法从实验方法、杂带污染率以及回收扩增率3个方面进行比较。实验结果表明:直取法较煮沸法简单、快速;煮沸法的杂带污染率为59.09%,直取法为43.08%;煮沸法的平均产物量约为40ng/μL,直取法约为60ng/μL。研究结果表明,直取法相对煮沸法简单,快速,扩增效率高,杂带污染几率小。
- 漆雪琳李博宋顺陈新彭明
- 关键词:聚丙烯酰胺凝胶电泳DNA回收木薯
- 传统中药艾种质资源的ISSR遗传多样性分析被引量:4
- 2015年
- 为了开拓传统中药艾的种质资源创新利用新途径和为艾品种形态学上的鉴定提供技术支持,采用ISSR分子标记技术,对22份南方的艾种质资源材料进行ISSR-PCR分析。结果表明:对22份艾品种材料进行ISSR-PCR扩增,共获得326个位点,其中303个是多态性位点。按照22份中药艾品种种质资源的遗传相似性系数构建UPGMA树状聚类图,在遗传相似性系数为0.615时分为5个大类群,遗传多样性较为丰富。
- 王惠君卢诚黎明陈友
- 关键词:分子标记ISSR种质资源
- 利用改良型cDNA-AFLP技术筛选木薯干旱胁迫相关基因被引量:3
- 2013年
- cDNA-AFLP是一种经济且高通量的筛选和识别非生物胁迫下基因差异表达的实验技术。本研究对传统cDNA-AFLP技术进行改良,并利用改良型技术对木薯KU50和SC124不同程度干旱胁迫RNA样品进行基因差异表达分析。共获得68条差异表达的转录获得片段(transcript derived fragment,TDF),其中带有引入酶切位点的TDF为64条,预示cDNA-AFLP技术的改良初步获得成功。通过对TDF序列进行功能注释,其中31条TDF可找到已知功能的同源基因;20条为功能不明确的预测基因或蛋白;17条无同源序列,可能为新基因。按功能将31条已知功能的TDFs分类,分别为:能量代谢、糖类代谢、脂类代谢、细胞生长与凋亡、信号转导、转移运输、转录调节、遗传信息处理、多肽类合成与代谢。选择8个差异表达的TDF进行荧光定量PCR验证,发现这些TDF的确在干旱胁迫条件下显著上调或下调表达,证明改良型cDNA-AFLP技术体系为筛选差异表达基因的有效方法。
- 王宇阳陈新夏志强陈青王文泉
- 关键词:CDNA-AFLP抗旱