上海市科学技术委员会资助项目(045407017)
- 作品数:6 被引量:108H指数:5
- 相关作者:牟伯中李辉杨世忠刘洪来刘晔更多>>
- 相关机构:华东理工大学俄罗斯科学院长江大学更多>>
- 发文基金:上海市科学技术委员会资助项目国家自然科学基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程更多>>
- 油藏水样细菌群落16S rRNA基因的RFLP分析被引量:8
- 2005年
- 通过16S rRNA基因的限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)方法,考察了油藏水样中细菌群落及多样性。从水样中分离纯化微生物总DNA,选择性扩增细菌16S rRNA基因,并构建16S rDNA克隆文库。337个16S rDNA克隆片段分别用限制性内切酶HinfⅠ和HaeⅢ酶切分析,得到74个操作分类单元(OTUs),其中数量最多的4个OTUs共占克隆子总数的73.6%,另外70个OTUs的丰度均处于较低水平,有57个OTUs仅含有1个克隆子。结果表明,运用RFLP方法分析16S rDNA克隆片段能够有效评估油藏水样中的细菌群落和多样性。
- 陈平李辉牟伯中
- 关键词:油藏RRNA基因细菌群落克隆文库
- 长链烷烃降解菌alkB片段的分离和鉴定被引量:3
- 2006年
- 分离并鉴定了长链烷烃降解菌Pseudomonasaeruginosa1785和P.marginata766烃羟化酶基因alkB片段.根据烃羟化酶的保守氨基酸序列,设计兼并引物,扩增P.aeruginosa1785和P.marginata766的alkB片段,获得了目标产物.经DNA测序和氨基酸序列分析,证实目标片段编码的肽段含有烃羟化酶的特征基序.由此确认采用该方法分离到了长链烷烃降解基因的alkB同源体片段.DNA序列比对结果表明,P.aeruginosa1785和P.marginata766的alkB片段与P.aeruginosaPAO1的alkB1和alkB2的相似性分别达到95.7%和94.8%.这些alkB片段可用于分析烃降解微生物群落结构.
- 刘晔李辉牟伯中刘洪来
- 关键词:PCR扩增
- 铜绿假单胞菌对长链烷烃的摄取模式被引量:10
- 2005年
- 研究了一株铜绿假单胞菌(CGMCC 1.1785)摄取长链烷烃的模式。铜绿假单胞菌1.1785能够以固态的长链烷烃为唯一碳源生长,在培养过程中产生表面活性代谢物。烃与水相的界面面积是细菌生长重要的影响因素,说明传质限制的存在。由于该菌不能够利用鼠李糖脂增溶的烃作为碳源,因此添加鼠李糖脂能够强化烃摄取的主要原因是烃界面的扩大。细胞表面疏水性从开始的急剧升高到后来的不断下降,说明在不同生长阶段细胞对烃的摄取模式是不同的。由此认为,铜绿假单胞菌1.1785既没有通过表面活性剂介导模式获取烃,也并非完全通过直接接触模式获取烃。据此提出该菌采用了一种运动接触的烃摄取模式,其趋化运动能力在这种摄取过程中起到重要作用。
- 刘晔傅涛牟伯中刘洪来
- 微生物脂肽的结构被引量:43
- 2005年
- 根据结构特征,将脂肽分为环状脂肽和线形脂肽;按脂肪酸链和肽链的连接方式不同,进一步将环状脂肽分为3类。在此基础上,对脂肽的产生菌和脂肽结构进行了综述,并对脂肽的活性、作用机理及其应用进行了展望。
- 刘向阳杨世忠牟伯中
- 关键词:微生物脂肽生物结构生物学活性生物分类
- 油藏微生物多样性的分子生态学研究进展被引量:22
- 2008年
- 油藏微生物是一类宝贵的资源,在油层生态系统的物质循环和能量流动中发挥着主导作用。传统上,主要依赖纯培养技术,使得大部分油藏微生物都没能得到充分认识。分子方法克服了纯培养方法中遇到的问题,能更好地了解环境微生物群落多样性。近年来,在油藏微生物群落多样性研究中的应用进展迅速,对油藏微生物学和生态学的发展产生了重要影响。文中评述了近年来国内外在油藏微生物分子生态方面的研究进展,并对进一步的研究提出了展望。
- 李辉牟伯中
- 关键词:油藏分子生态微生物群落
- Geobacillus研究进展被引量:23
- 2005年
- Geobacillus是国际上2001年新命名的一类细菌。由于其具有嗜热、兼性厌氧,降解烃和产生表面活性剂的特性,在微生物采油、环境治理等领域中有潜在应用价值;同时,这类细菌可能具有特殊的功能基因和特种酶,对构建工程菌亦具有重要的研究价值。对Geobacillus的研究历史、分类组成和生物学特性、生态分布及其分子生物学研究和应用进行了综述。
- 周卫民杨世忠T.N.Nazina牟伯中
- 关键词:GEOBACILLUS生物学特性分子生物学