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中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(ITBBZD0731)

作品数:1 被引量:2H指数:1
相关作者:董凤英金志强徐碧玉王家保更多>>
相关机构:中国热带农业科学院海南大学更多>>
发文基金:海南省教育厅高等学校科学研究项目国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇亚细胞
  • 1篇亚细胞定位
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇细胞定位
  • 1篇荔枝

机构

  • 1篇海南大学
  • 1篇中国热带农业...

作者

  • 1篇王家保
  • 1篇徐碧玉
  • 1篇金志强
  • 1篇董凤英

传媒

  • 1篇热带作物学报

年份

  • 1篇2009
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
荔枝LcAsr基因的生物信息学分析与载体构建被引量:2
2009年
根据荔枝果皮cDNA微阵列信号分析结果,对荔枝cDNA文库的BAO5-H4克隆测序。NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)ORF分析发现其含有1个完整的开放读码框,编码152个氨基酸残基的多肽,为一全长cDNA序列。Blastx比对分析表明该基因编码的蛋白与其它植物来源的ASR(abscisic acid,stress and ripening inducible)蛋白高度同源,该基因被命名为LcAsr,通过PCR的方法获得其DNA全长序列。生物信息学分析结果表明,LcAsr基因的DNA序列全长为1177bp,读码框中间包含1个488bp的内含子。Protparam预测分析结果表明LcAsr基因编码蛋白的分子式为C756H1130N228O238S1,相对分子质量为17252.7,等电点pI6.10,富含Glu、His、Lys、Ala。Predictprotein预测该蛋白的二级结构主要是α螺旋,有1个酪氨酸激酶磷酸化位点、2个酪蛋白激酶II磷酸盐化位点、3个豆蔻酰化位点等,并具有很高的亲水性,预测该蛋白位于细胞核。构建了植物荧光表达载体pCAMBIA-LcAsr,并通过基因枪转化法转化洋葱表皮细胞进行瞬时表达,对LcASR蛋白进行亚细胞定位,结果表明LcASR蛋白定位于细胞核。
董凤英王家保徐碧玉金志强
关键词:荔枝生物信息学分析亚细胞定位
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