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水稻广亲和基因S5-n的功能标记开发及其应用被引量：36: 2009年; 广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因,利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1,根据F1的育性判断和选择S5-n,选育周期长,方法繁琐。因此,在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检测方法。本研究根据水稻广亲和基因和籼粳S-5等位基因序列存在136bp缺失的特征,设计了InDel标记S5136。前人研究已经明确02428、Dualr、CPSLO17具有S5-n,分子标记S5136 PCR扩增这3个材料的带型为缺失带型,而不携带广亲和基因S5-n的材料的带型为非缺失带型。利用该标记对3037与02428的F2群体分析表明,该标记能准确区分S5-n、S5-i纯合及杂合基因型,标记基因型符合1∶2∶1比例,没有发生偏分离现象。利用该标记从554份水稻品种资源(O.sativa L.)和27份普通野生稻(O.rufipogen Griff.)以及24份江淮流域杂草稻资源中筛选出具有缺失带型的资源材料13份,并对其PCR产物测序证实为S5-n,对Kasalath的广亲和性进行了初步验证;从20份02428的高世代育种材料中,筛选到携带广亲和基因S5-n的恢复系2份。该标记可以用于S5-n基因资源筛选、分子标记辅助选择育种和培矮64S为母本的杂交种种子纯度鉴定。; 杨杰王军曹卿陈志德仲维功; 关键词：亚洲栽培稻普通野生稻杂草稻

直立穗基因qPE9-1基因标记的开发及利用: 水稻理想株型是高产形成的基础，直立穗品种表现出耐肥抗倒，较好的群体通风透光条件，较高的光合效率和增产潜力.为了给直立穗型品种的分子鉴定提供依据，本研究根据已克隆的水稻直立穗基因qPE9-1和弯曲穗基因qpe9-1第5个外...; 朱金燕王军杨杰范方军杨金欢仲维功

直接利用PCR产物构建RNA干扰表达载体被引量：2: 2010年; 利用RNA干扰原理可以对作物进行遗传改良。构建RNA干扰的发夹结构一般采用在引物两端加酶切位点方法,该方法涉及酶切位点多,步骤繁琐。本试验介绍一种直接利用PCR产物进行RNAi组成型表达载体构建的方法,该载体以潮霉素为筛选标记基因,适合水稻的遗传转化。; 杨杰仲维功王才林柳青王明波Narayana M.Upadhyaya; 关键词：RNA干扰双元载体 PCR产物

灰飞虱共生菌groEL基因的克隆、生物信息学分析及其植物双元表达载体构建: 2010年; 本研究克隆了江苏南京地区灰飞虱(Laodelphax striatellus Fallén)体内共生菌Wolbachia的groEL基因全长序列。序列分析表明,其开放阅读框为1659bp,编码552个氨基酸残基,分子量为58.884kD,等电点为5.01。序列比对发现克隆的groEL基因与已登录的groEL基因(登录号:EF468716)起始密码子下游424bp处存在一个核苷酸的差异,与另一groEL基因(登录号:DQ356890)完全一致。利用PROTEIN DATA BANK在线软件对灰飞虱的groEL蛋白立体结构进行预测,结果表明灰飞虱的groEL蛋白为同型寡聚复合物,具有分子伴侣功能。本研究进一步构建了含该groEL基因和潮霉素基因的双元表达载体,为下一步转化水稻奠定了基础。; 曹卿杨杰王军范方军仲维功张玉琼张云华; 关键词：灰飞虱共生菌 WOLBACHIA GROEL 生物信息学分析分子伴侣

分子标记ST10对水稻条纹叶枯病抗性基因Stv-b^i的检测被引量：8: 2009年; 近年来,利用与抗病基因紧密连锁的分子标记进行辅助选择已经成为抗病育种的重要手段。本研究利用显性标记ST10对24个水稻品种以及24个水稻品种中的镇稻88/武育粳3号和武运粳7号/徐稻3号的2个F2群体进行检测。PCR结果显示,17个抗病品种有8个能扩增出约727bp的目标片段;在镇稻88/武育粳3号杂交组合中,感病亲本武育粳3号和F2群体中的8个感病单株均不能扩增出目标片段,抗病亲本镇稻88、F1和13个不感病单株中的11株都能够扩增出目标片段;用于检测的武运粳7号/徐稻3号的F2群体中,8株感病单株没有检测出目标片段,而13株不感病的单株有9株扩增出目标片段。结果表明,ST10与条纹叶枯病抗性基因Stv-bi紧密连锁,表现为共分离。; 王军杨杰曹卿陈志德范方军仲维功; 关键词：水稻条纹叶枯病

水稻白化转绿突变体v13(t)的生理特性和基因定位被引量：19: 2011年; 【目的】在温敏型白化转绿突变体v13(t)的表型特征鉴定的基础上,对其控制基因V13(t)进行精细定位。【方法】在籼稻品种9311中获得一个白化转绿自然突变体,并对其进行表型特征、温度敏感临界值的确定,同时对不同温度下叶片中叶绿体的超微结构进行观察,并以v13(t)与武运粳7号的正反交F2群体对其进行遗传分析和基因的精细定位。【结果】在低温(<26℃)条件下,v13(t)前3张叶片均表现为白色,只有叶尖和叶鞘表现出少许绿色,以后逐渐死亡;在28℃条件下,1—3张叶片抽出时叶尖和边缘表现为白色,以后逐渐转绿;在30℃条件下,叶片表现正常。遗传分析表明,该突变体叶色性状受1对隐性核基因控制,利用SSR分子标记将V13(t)初步定位在水稻第5染色体上的RM3638与RM459标记之间,其遗传距离分别为3.2和0.5 cM。进一步利用已公布的SSR标记和新发展的InDel标记将V13(t)定位在InDel5-11与InDel5-8之间的98.9 kb范围内,同时获得一个与V13(t)共分离的标记InDel5-2。【结论】白化转绿突变体v13(t)受1对隐性核基因V13(t)控制,V13(t)被定位在AC130729上约98.9 kb的物理距离区间内。; 王军杨杰陈志德范方军朱金燕杨金欢仲维功; 关键词：水稻超微结构

利用分子标记辅助选择聚合水稻抗病基因Pi-ta、Pi-b和Stv-b^i被引量：52: 2011年; 水稻稻瘟病和条纹叶枯病是长江中下游粳稻稻区两大主要病害,选育抗病品种是防治这两大病害最有效的方法。以同时含有稻瘟病抗病基因Pi-ta和Pi-b的武运粳8号,含有条纹叶枯病抗病基因Stv-bi的镇稻42为基因供体配置杂交组合。利用Pi-ta和Pi-b的基因标记和Stv-bi紧密连锁的分子标记对分离世代进行基因位点的检测,结合田间多代选育、抗性鉴定将3个抗病基因同时转育到高产品种中,选育出高产、优质、多抗水稻新品系74121。利用分子标记辅助选择,为选育多抗水稻新品种提供了一种简单、快捷的选择方法,同时也为水稻抗病育种提供了新的遗传资源。; 王军杨杰陈志德范方军朱金燕杨金欢仲维功; 关键词：稻瘟病条纹叶枯病分子标记辅助选择

水稻条纹叶枯病的抗性与籼粳分化的相关性被引量：4: 2013年; 利用国内外的119份地方水稻品种资源材料通过InDel分子指数法分析水稻条纹叶枯病的抗性与籼粳分化的关系。在119份水稻品种中48份典型籼稻,其中47份抗水稻条纹叶枯病;7份籼稻和1份偏籼的水稻品种,也都抗条纹叶枯病;2份中间型的水稻品种,不抗条纹叶枯病;2份粳型的水稻品种,抗条纹叶枯病;59份典型粳稻品种,都不抗水稻条纹叶枯病。相关性分析表明籼型基因频率与水稻条纹叶枯病发病率呈极显著负相关。这些结果表明携带籼型基因频率越高的水稻材料,对水稻条纹叶枯病的抗性越强,而典型粳稻都表现为感病,推测水稻条纹枯病抗病基因可能起源于籼稻。; 范方军杨杰王军朱金燕李文奇仲维功; 关键词：水稻条纹叶枯病籼粳分化

超高产杂交粳稻的遗传特征的初步分析: 2014年; 2012年江苏省杂交晚粳区试11份材料的平均亩产为683.24kg,仅甬优杂交组合E240(Z06)在6个试点的平均亩产达到796.1kg的超高产水平,较对照甬优8号增产15.13%.为探索该杂交组合的超高产遗传结构,利用在籼粳有多态性的分布于12条染色体的36对InDel标记检测,发现该组合的籼型基因频率为0.47,属于中间型,其他组合的籼型基因频率都低于0.4,属于粳型或偏粳型.分子标记检测杂交组合Z06在第5和第12染色体的基因型为纯合籼型和杂合型,与其他组合明显不同.广亲和基因的功能标记检测仅发现Z03、Z05和Z06这3个杂交粳稻携带广亲和基因S5n,其中Z05为纯合基因型,Z03和Z06为杂合基因型.该研究表明杂交粳稻超高产组合应该接近一半籼型一半粳型,第5和12染色体片段为籼型基因型,并携带广亲和基因.; 范方军王芳权黄胜东许明王军朱金燕李文奇沈文飚仲维功杨杰; 关键词：杂交晚粳

利用等位基因特异PCR开发水稻暗胚乳基因Wx-mq的功能标记: Wx-mq基因是低直链淀粉性状控制基因，与食味品质密切相关。直链淀粉含量高低必须通过化学方法测定，因此在低直链淀粉品种选育中需要寻找一种快速、简便的Wx-mq基因型分子标记检测方法。本研究通过等位基因特异扩增(AS-PC...; 杨杰王军范方军陈涛曹卿王才林仲维功; 关键词：水稻

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江苏省自然科学基金(BK2009321)

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