国家自然科学基金(31060356)
- 作品数：9 被引量：69H指数：6
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- 相关机构：新疆维吾尔自治区水产科学研究所中国海洋大学新疆大学更多>>
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- 塔里木裂腹鱼群体遗传多样性的AFLP分析被引量：3
- 2012年
- 采用AFLP技术对喀拉喀什河、塔什库尔干河、阿克苏河多浪渠首、木扎提河4个群体共80尾塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi Günther)个体进行了遗传多样性分析。6对选择性扩增引物共扩增得到212个位点,其中多态性位点141个,多态位点比例为66.51%。4个群体的Shannon多样性指数(I)为0.316 9-0.544 3,Nei’s遗传多样性指数(H)为0.213 9-0.376 2,群体间的遗传距离为0.078 1-0.250 2。塔什库尔干河群体的多态位点比例、Shannon多样性指数和Nei’s遗传多样性指数均高于其它三个群体。AMOVA分析结果显示,群体总遗传变异85.17%来自群体内差异,而14.83%来自群体间差异,表明塔里木裂腹鱼遗传变异主要来源于群体内个体间,但群体间已存在一定程度的遗传分化。用UPGMA方法构建的群体系统进化树显示,多浪渠首群体和木扎提河群体首先聚类,然后依次与塔什库尔干河群体、喀拉喀什河群体聚类,这一方面与地理位置有关,另一方面与河流的自然环境有关。
- 杨天燕郭焱孟玮马燕武陈朋
- 关键词：AFLP分析
- 新疆几种裂腹鱼类系统发育关系探讨被引量：15
- 2011年
- 通过PCR扩增获得了分布于新疆的裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)4属7种鱼类的线粒体细胞色素b基因712 bp序列。结果表明:Cyt b基因片段的T,C,A和G碱基组成平均为30.1%,27.4%,25.6%和16.9%,共出现201个变异位点,其中简约信息位点162个,序列变异度为22.8%,转换/颠换为15.03,且碱基替代主要发生在密码子第3位点。基于Kimura双参数模型构建NJ和MP系统树以及基于最佳核苷酸替代模型,构建ML系统树结果均显示,同为原始等级裂腹鱼类的扁吻鱼和裂腹鱼属鱼类亲缘关系较近,而特化等级裂腹鱼类的斑重唇鱼和新疆裸重唇鱼亲缘关系较近。依据分子进化速率推测两个类群间发生分歧的时间约在上新世晚期到中新世间,伴随青藏高原隆起这一地质事件。
- 杨天燕孟玮海萨张人铭郭焱
- 关键词：裂腹鱼类线粒体细胞色素B基因系统发育
- 新疆开都河鱼类区系组成与分布被引量：9
- 2013年
- 2004～2013年间对新疆开都河鱼类的种类和分布进行了10次野外调查，根据不同的海拔和生境，设置鱼类采集点22个，共采集鱼类标本1990号，分属3目7科19种。其中土著鱼类3种，由裂腹鱼类和高原鳅类构成；外来鱼类16种，隶属2目5科16属，鲤科鱼类占绝对优势。与历史资料相比，土著鱼类中扁吻鱼（Aspiorhynchus laticeps）、塔里木裂腹鱼（Sehiorhorax biddulphi）、扁嘴裂腹鱼（Schiorhorax esocinu）和高原裸裂尻鱼（Schiorhorax stoliczkae Steindachner）未见，而外来鱼类则增加了12种，形成了土著鱼类与外来鱼类共存的生态格局；开都河鱼类区系及分布有较明显的多样性和地域性，受人为干扰、水温及大坝阻隔的影响，出山口后河段以外来鱼类占主导，而出山口以上河段则仍以土著鱼类为主，二者在空间分布上有较明显的界限。开都河鱼类区系的演变过程可分为两个阶段：稳定和发展阶段；人工引种后剧烈变化阶段。土著鱼类的保护管理应由政府牵头，进行保护、监测、科研等规划的顶层设计，突出栖息地生境的保护。
- 马燕武郭焱陈朋谢春刚祁峰牛建功
- 关键词：鱼类区系开都河
- 塔里木裂腹鱼群体遗传结构及遗传多样性分析被引量：22
- 2012年
- 塔里木裂腹鱼为塔里木河水系特有濒危裂腹鱼类。研究采集5个群体(多浪渠首、喀拉喀什河、木扎提河、塔什库尔干、玉龙喀什河)塔里木裂腹鱼,扩增线粒体控制区第一高变区,共获得长度456 bp序列95条。塔里木裂腹鱼单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.7118、0.0024。AMOVA分析显示,群体间遗传分化显著。FST值统计检验表明,除喀拉喀什河群体与玉龙喀什河群体之间差异不显著外,其他两两群体之间都是显著的。分子系统树和单倍型网络图分析表明,塔里木裂腹鱼单倍型间关系较近。中性检验和mismatch分析显示,塔里木裂腹鱼群体经历过近期群体扩张事件。根据核苷酸不配对分布τ值计算其群体扩张时间为20万年前。天山、昆仑山的运动以及第四纪冰期-间冰期的变化可能影响了塔里木裂腹鱼的群体历史动态。
- 孟玮郭焱海萨杨天燕马燕武谢春刚
- 新疆两种裂腹鱼形态学和COI基因的比较分析被引量：9
- 2013年
- 运用多变量形态度量学方法结合线粒体COI基因序列,比较分析了新疆和田河两支流(喀拉喀什河、玉龙喀什河)塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi)和厚唇裂腹鱼(S.irregularis)的遗传差异。对这两种鱼67尾的31个测量指标进行分析,其中5个性状表现出极显著差异(P<0.01),6个性状表现出显著差异(P<0.05)。在主成分散点图中,这两种裂腹鱼个体间存在交叉现象,没有明显界限,二者外部形态差异较小,难以有效区分。分析了627bp的COI基因序列碱基组成,均表现为G碱基含量最低而C碱基含量最高,A+T含量大于C+G含量。26尾塔里木裂腹鱼和厚唇裂腹鱼共检测到6种单倍型和5个核苷酸多态位点,其单倍型多样度分别为0.733和0.556,核苷酸多样度分别为0.00158和0.00089,其中417bp处的C/T转换为二者特有。
- 杨天燕孟玮郭焱马燕武
- 关键词：COI基因
- 塔里木盆地鱼类生物地理学初步解析被引量：8
- 2015年
- 塔里木盆地与青藏高原地理位置邻近,但地形地貌、气候水文差别显著,而两地的鱼类区系组成却均以裂腹鱼和高原鳅为主。本文依据现代生物地理学研究方法,以裂腹鱼和高原鳅的起源与演化为线索,结合塔里木盆地的地质、气候变迁,探究塔里木盆地鱼类空间分布格局形成原因及过程,研究塔里木盆地与青藏高原两地间鱼类的关系。结果显示:中新世晚期至上新世末塔里木盆地出现的从外围山地向沙漠腹地流向的水文网雏形,使不同进化水平的裂腹鱼和高原鳅在以后不同的地质时期陆续随地表径流从青藏高原(昆仑山)、天山等塔里木盆地周边山地进入该盆地成为可能。扁吻鱼Aspiorhynchus laticeps(Day)、塔里木裂腹鱼Schizothorax(Racoma)biddulphi Günrher、叶尔羌高原鳅Triplophysa(Hedinichthys)yarkandensis yarkandensis(Day)、隆额高原鳅T.(T.)bombifrons(Herzenstein)和长身高原鳅T(Triplophysa)tenuis(Day)5种鱼类可能是裂腹鱼类和高原鳅类某些较为原始的类群在晚中新世-早更新世进入塔里木盆地,在地理隔离下,趋异进化适应辐射形成的物种。宽口裂腹鱼S.(Schizothorax)eurystomus(Kessler)、扁嘴裂腹鱼S.(R.)esocinus Heckel、厚唇裂腹鱼S.(R.)irregularis Day、重唇裂腹鱼S.(R.)barbatus Mcclelland、斑重唇鱼Diptychus maculatus steindachner、新疆裸重唇鱼Gymnodiptychus dybowskii(Kessler)、斯氏高原鳅T.(T.)stoliczkae(Steindachuner)7种鱼类可能发生在塔里木盆地周边的山地及青藏高原,第四纪陆续进入塔里木盆地。进入塔里木盆地的鱼类在环境的选择压力下、种间和种内的竞争中,受多重因子的共同作用,逐步形成近现代的区系及空间分布格局。塔里木盆地和青藏高原两地主要的鱼类起源的种类和时间基本一致,演化发生的地区地形、气候显著不同,形成了区系结构相似、种类组成各具地域性的特点。近50年来,受灌溉引水、筑坝发电等
- 谢春刚马燕武郭焱
- 关键词：塔里木盆地塔里木河生物地理学扁吻鱼
- 塔里木裂腹鱼群体的微卫星多态性分析被引量：3
- 2014年
- 摘要：采用7对微卫星引物对塔什库尔干、多浪渠首、木扎提河、玉龙喀什河和喀拉喀什河5个群体共计114尾塔里木裂腹鱼遗传多样性进行比较分析。7对引物在5个群体中共扩增出34个条带，扩增片段在105～370bp。计算群体间遗传距离发现，玉龙喀什河群体（Y）与塔什库尔干群体（T）间的遗传距离最大、与喀拉喀什河群体（K）间的遗传距离最小。基于遗传距离构建的UPGMA聚类树明显分为2支。塔里木裂腹鱼群体遗传多样性的AMO-VA分析结果显示，群体内遗传变异为87．84％，群体间遗传变异为12．16％。整个种群F统计数Фst为0．12161（P〈0．01），群体间遗传分化显著，且塔什库尔干群体遗传多样度最高。
- 杨天燕孟玮高天翔郭焱马燕武张富春
- 关键词：微卫星标记多态性塔里木河
- 扁吻鱼和塔里木裂腹鱼线粒体COI基因片段的比较研究被引量：12
- 2011年
- 对扁吻鱼(Aspiorhynchus laticeps)和塔里木裂腹鱼(Schizothoraxbiddulphi)细胞色素c氧化酶亚基(COI)基因片段进行扩增。通过序列测定得到624bp的基因片段,无碱基的插入和缺失,A、T、G、C碱基中G含量最低,A+T含量高于G+C含量,与其它鱼类COI基因片段研究结果相一致。2个种间共检测到38处核苷酸替换,其中35处碱基转换,3处碱基颠换,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是密码子第3位点上的同义替换。在编码的208个氨基酸中,仅发生2处氨基酸替代,替代率为0.96%。采用Kimura-2法计算种间平均遗传距离为0.06,以鲤作外群构建NJ系统树,扁吻鱼和塔里木裂腹鱼亲缘关系较近,而与新疆裸重唇鱼、斑重唇鱼亲缘关系较远。
- 杨天燕张人铭郭焱孟玮海萨马燕武
- 关键词：扁吻鱼线粒体COI基因
- 2种珍稀裂腹鱼类线粒体DNA部分序列片段的比较分析被引量：6
- 2011年
- 对扁吻鱼(Aspiorhynchus laticeps)及塔里木裂腹鱼(Schizothorax biddulphi)线粒体COⅠ(624 bp)、Cyt b(712 bp)和D-loop(457 bp)基因片段进行了PCR扩增和序列测定。通过分析比较发现,3个片段A+T含量与其他鱼类相比均较高,G含量偏低这一现象在2个蛋白质编码基因第3位点上显得尤为突出。2种裂腹鱼种内个体间序列变异较小。3个基因片段的核苷酸替代速率依次为D-loop>Cyt b>COⅠ。基于核苷酸最佳替换模型计算2种裂腹鱼在3个基因片段的遗传距离,COⅠ为0.055,Cyt b为0.060,D-loop为0.074。基于Cyt b基因片段序列分析结果表明,扁吻鱼和塔里木裂腹鱼发生遗传分化时间大约在距今3.57百万年左右的上新世,分化时间早于特化等级和高度特化等级裂腹鱼类。塔里木河水系处于青藏高原北部边缘地带,在地理发育上属于青藏高原的一部分,新疆裂腹鱼类的进化一定程度上受到青藏高原隆起这一地质事件的影响。
- 杨天燕孟玮张人铭郭焱海萨谢春刚
- 关键词：扁吻鱼线粒体DNA
