辽宁省教育厅攻关计划项目(05L200)
- 作品数：2 被引量：10H指数：1
- 相关作者：侯林王明昌张筠董长永隋娜更多>>
- 相关机构：辽宁师范大学更多>>
- 发文基金：辽宁省教育厅攻关计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 五种群体遗传学软件的比较被引量：1
- 2009年
- 本文对五种群体遗传学数据分析软件POPGEN32、ARLEQUIN、PHYLIP、MEGA、TREECON从功能、可处理数据类型、数据输入难度、支持的操作平台、操作简易性、处理结果的直观性以及是否需要辅助软件等进行了比较。得出ARLEQUIN和MEGA使用简单、功能强大,适合群体遗传研究人员使用。
- 王海山侯林陈文博
- 关键词：群体遗传学数据类型
- 中国沿海蛾螺科5属10种28S rRNA基因的系统学分析被引量：9
- 2008年
- 目前已报道在我国分布的蛾螺科种类有13个属,约31个种,系统学和分类地位仍存在较大的争议。本研究利用核糖体大亚基28S rRNA的部分序列对我国辽宁、山东、福建沿海蛾螺科5属10个种的系统发生进行了分析。通过PCR获得了大约1400bp的片段,测序之后,通过遗传分析软件对序列进行了比对分析,以骨螺科的脉红螺作为外群,利用Neighbor-Joining(NJ)法和Minimum Evolution(ME)法建立了系统树。结果显示,所研究的蛾螺科5属10个种可以被分为5个亚群:第一大分支为香螺亚群,包括Neptunea属的香螺、新英格兰蛾螺、Neptunea eulimata Dall、和一个未知种以及Siphonalia属的略胀管蛾螺;第二个分支为侧平肩螺亚群;第三个分支为水泡蛾螺和黄海蛾螺亚群;第四个分支为褐管蛾螺亚群;第五个分支为方斑东风螺亚群。由系统学分析可知,香螺是较为进化的种;未知种为香螺属内的种;略胀管蛾螺与Neptunea属的种类亲缘关系较近,序列相似系数为0.9%-1.4%,已经达到了属内水平,建议将略胀管蛾螺归为Neptunea属。
- 董长永侯林隋娜张筠王明昌李研
- 关键词：系统学RRNA
