国家科技重大专项(2012ZX10004-211)
- 作品数：9 被引量：65H指数：5
- 相关作者：俞慧菊胡芸文钱方兴张万菊张晓玲更多>>
- 相关机构：复旦大学上海交通大学医学院附属新华医院上海市公共卫生临床中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 多重PCR检测方法和液态芯片技术在呼吸道病毒检测中的应用研究被引量：2
- 2014年
- 目的 评估澳大利亚维多利亚感染性疾病参比实验室（The Victorian Infectious Diseases Reference Laboratory,VIDRL）的呼吸道病毒多重PCR检测方法和Luminex公司多指标同步分析液态芯片技术-呼吸道病毒检测试剂盒（xTAG RVP）,应用于多种常见呼吸道病毒检测的优势和缺点,为更好地、有针对性地选择合适技术进行临床实验诊断或公共卫生应急检测提供依据.方法 使用VIDRL的呼吸道病毒多重PCR检测方法和Luminex公司xTAG RVP试剂盒对198份临床流感样症状患者的咽拭子标本进行常见呼吸道病毒的核酸检测.结果 198份临床标本经VIDRL多重PCR方法和xTAG RVP方法检测,阳性率分别为38.89％和45.45％,符合率为72.22％.单一病毒的符合率为87.88％～100％.结论 xTAG RVP方法与VIDRL多重PCR方法相比,两者在常见呼吸道病毒检测中的特异性和敏感性相近,xTAG RVP方法具有明显的快速和高通量的优势.
- 张万菊管文采田棣何静刘祎徐磊钱方兴俞慧菊李扬揭志军胡芸文
- 关键词：聚合酶链反应
- 柯萨奇病毒A6致手足口病研究进展被引量：16
- 2016年
- 近年来由柯萨奇病毒A6(CVA6)导致的手足口病在欧洲、北美和亚洲多个国家暴发流行,已快速上升为手足口病的主要致病原。临床症状显示,CVA6导致的手足口病患者表现为多部位的出疹甚至脱甲,成人感染和重症病例也有较多报道。分子流行病学显示,近年来流行的CVA6为新型变异株与其他型别的肠道病毒存在重组,可能是导致临床症状改变的潜在原因。
- 张晓玲胡芸文
- 关键词：手足口病
- 2009-2011年上海ARTI人群中小RNA病毒感染的分子流行病学研究被引量：3
- 2015年
- 目的 探讨上海地区急性呼吸道感染（ARTI）人群中小RNA病毒感染的流行规律及临床特征.方法 采用套式多重RT-PCR方法,同时检测鼻咽拭子标本小RNA病毒和其他8种常见呼吸道病毒.对其中小RNA病毒阳性标本进行基因分型,并进一步分析其流行病学和临床特征.结果 2282份鼻咽拭子标本中检出小RNA病毒阳性185例（8.1％）,其中鼻病毒（HRV）为151（81.6％）例,肠道病毒（EV）为34（18.4％）例.HRV-A（61.6％）是HRV的主要亚型.HRV在0-4岁组及65岁以上组中检出率高于FluA、RSV等常见呼吸道病毒.HRV和EV在不同季节均有检出,其中HRV在秋冬季达到高峰.HRV引起的URTI和LRTI的比例分别为62.3％ （94/151）、37.8％ （57/151）,而EV感染病例均为URTI.HRV感染阳性的LRTI病例中亚型与LRTI的发生无显著相关性（P＞0.05）.结论 本研究表明,2009-2011年小RNA病毒成为上海地区急性呼吸道感染谱的重要组成部分,其中HRV（HRV-A）为主要病原.HRV是0-4岁组及65岁以上组中最常见的呼吸道病毒,并以秋冬两季为高发季节.HRV亚型与临床重症并无相关性.
- 何静徐磊王蔚管文彩田棣张万菊刘祎钱方兴揭志军俞慧菊李杨袁正宏胡芸文
- 关键词：呼吸道感染RNA病毒
- 上海地区2011—2014年手足口病的病原谱变化及流行规律分析被引量：21
- 2018年
- 【目的】了解2011—2014年间上海地区手足口病病原谱的构成变化,掌握手足口病主要致病原的流行规律,为做好上海地区手足口病的防控工作提供参考。【方法】采集2011年1月至2014年12月期间两家哨点医院临床诊断为手足口病患儿的咽拭子、粪便、疱疹液和脑脊液,进行肠道病毒通用和分型PCR检测。绘制上海地区2011至2014年的手足口病病原谱,分析手足口病主要致病原阳性检出的分布规律。【结果】共采集上海地区2 764例手足口病患儿的4 088份标本。肠道病毒通用检测阳性率为76.88%,主要致病原为肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16)、柯萨奇病毒A组6型(CA6)和柯萨奇病毒A组10型(CA10),其阳性检出率分别为35.78%,16.53%,17.55%和2.28%。2011年上海地区手足口病主要以EV71和CA16流行为主;2012年EV71的构成比下降,CA6的构成比上升;2012年10月至2013年9月期间CA6出现高位流行,2013和2014年主要以EV71和CA6流行为主。2014—2015年上海地区流行的CA6属于D7亚型。【结论】上海地区手足口病病原谱的构成逐年发生变化,不同型别的肠道病毒呈现交替流行,其中CA6的构成比增加较快,已成为上海地区手足口病的主要致病原。对引起手足口病的肠道病毒进行持续分型监测,对上海地区手足口病的防控工作具有重要意义。
- 张晓玲俞慧菊宋志刚王蔚
- 关键词：手足口病肠道病毒71型
- 腹水透析量对腹水浓缩回输治疗顽固性腹水的疗效影响被引量：6
- 2016年
- 目的探讨腹水透析量对腹水浓缩回输治疗顽固性腹水的疗效影响。方法应用腹水超滤浓缩回输系统对49例顽固性腹水患者进行123次腹水浓缩回输治疗，通过腹水透析量4～5L或8～1OL了解不同的透析量回输后的疗效。结果对于不同的腹水透析量，4～5L治疗组和8～10L治疗组总有效率均为78％左右（P〉0．05）；两组治疗后体重、腹围和24h尿量，8～10L治疗组有较明显缓解（P〈0．01），但是两组治疗后血钾、钠、氯、钙未见明显变化（P〉0．05），虽然血浆中白蛋白水平有所提高，但是可能与术后透析量较大而输注白蛋白有关。结论提高腹水透析液后浓缩回输腹腔可能也是治疗肝硬化顽固性腹水的一种有效方法，值得推广。
- 刘岩红史慧晶沈思兰张琴钱方兴李颖张万菊胡芸文
- 关键词：顽固性腹水腹水浓缩回输
- 2014年上海地区肠道病毒71型全长基因序列和毒力基因位点分析被引量：1
- 2018年
- 目的分析2014年上海地区手足口病患者中肠道病毒71型（enterovirus71，EV71）的全长基因组序列，了解上海地区EV71流行株的序列特征，推测与致病力相关的毒力基因位点。方法收集上海交通大学附属新华医院2014年1月至12月临床诊断为手足口病的436例患者的临床资料和咽拭子标本。采用实时荧光PCR方法检测通用肠道病毒和EV71型，选取部分核酸阳性标本进行全基因片段扩增和测序，构建全长和3’非编码区（untranslated region，UTR）基因序列进化树，并与EV71的BrCr原型株、柯萨奇病毒A组4型（coxsackievirus A4，CA4）、CA14、CA16原型株和其他肠道病毒A组原型株进行各编码区核苷酸同源性比较。另外，结合GenBank数据库中代表株，比较轻症、重症和死亡组的氨基端序列，寻找差异位点。结果436例手足口病患者中，EV71核酸检测阳性123例（28．21％）。对13个EV71检测阳性标本病毒的全长基因序列和3’UTR序列进行系统进化树分析，发现2014年上海地区EV71流行株为C4a亚型，3’UTR序列与CA4、CA14和CA16原型株序列相近。结合GenBank数据库中代表株，比较EV71轻症、重症和死亡患者的氨基端序列，发现159个蛋白氨基酸序列差异位点，其中Q230L（VP2）、11054V（2B）、V1508I（3A）、V1662I（3C）等4个位点差异有统计学意义（r值分别为8．82、6．09、6．09、6．09，P值分别为0．012、0．048、0．048、0．048）。结论2014年上海地区的EV71C4a亚型流行株3’UTR区与CA4、CAl4和CAl6型存在重组，位于VP2结构区的230位可能是与致病力相关的毒力基因位点。
- 张晓玲张晓玲俞慧菊宋志刚
- 关键词：肠道病毒属
- 上海西区哨点医院16岁以上人群FluA病例临床特征分析
- 2018年
- 目的流感样病例(influenza-like illness,ILI)是指发热,伴咳嗽或咽痛之一者,同时缺乏其他实验室诊断依据。本研究探讨上海市西区哨点医院≥16岁ILI中甲型流感病毒(influenza A virus,FluA)病例的临床流行特征,以指导临床医生降低对ILI抗生素的使用。方法选择2014-05-03-2016-04-30上海市西区哨点医院收治的2 028例ILI患者作为研究对象,采集其鼻咽拭子,应用实时荧光定量RT-PCR方法和套式多重反转录聚合酶链反应,检测FluA、乙型流感病毒(influenza B virus,FluB)、副流感病毒(parainfluenza virus,PIV)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)、腺病毒(adenovirus,ADV)、微小核糖核酸病毒(picornaviruses,PicoRNA)、人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)、冠状病毒(coronavirus,CoV)和人博卡病毒(human bocavirus,HBoV),分析ILI病例中FluA病例的临床特点。结果 9种呼吸道病毒检测阳性率达28.30%(574/2 028),其中FluA阳性249例(12.30%),FluB阳性87例(4.30%),Para Flu阳性20例(1.00%),PicoRNA阳性34例(1.70%),ADV阳性62例(3.10%),RSV阳性83例(4.10%),CoV阳性5例(0.20%),hMPV阳性7例(0.30%),HBoV阳性3例(0.15%);24份标本(1.18%)为2种病毒重叠感染,RSV的重叠感染率最高,有19例(0.94%),未见3种病毒重叠感染;FluA阳性检出率构成比最高,为43.38%;体温(t=2.738,P=0.006)、乏力(χ~2=23.730,P<0.001)、白细胞计数(t=3.457,P=0.001)和中性粒细胞分类(χ~2=23.950,P<0.001)等临床特征对FluA病例有影响。结论 FluA在ILI哨点医院中检出率占比最高,且体温、乏力、白细胞计数和中性粒细胞分类等临床特征在FluA病例中比较明显。
- 肖颖沈思兰刘岩红陈怡钱方兴
- 关键词：流感样病例甲型流感病毒
- 2011-2016年上海地区手足口病病原谱及柯萨奇病毒A组6型不同基因型感染细胞的差异研究被引量：9
- 2018年
- 本文旨在分析2011—2016年上海地区手足口病病原谱的构成和主要病原体流行规律,为手足口病的疫情防控和重症预警提供参考。采集2011—2016年哨点医院临床诊断为手足口病的患儿标本,首先进行肠道病毒通用型核酸和分型检测,其次对2012—2016年核酸检测为柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CA6)阳性样本进行基因型重组检测,分离重组型和非重组型CA6株,比较两者生物学特性。结果显示,2011—2012年秋季上海地区手足口病主要致病原为肠道病毒71型(enterovirus type 71,EV71)和CA16;2012年秋季起CA6成为主要病原体;2013—2014年重组型CA6(recombinant CA6,R CA6)占一定比例;2015—2016年非重组型CA6(non-recombinant CA6,NR CA6)成为优势流行株。R CA6和NR CA6代表株在RD细胞中增殖良好,在KB、MRC-5和HEp-2细胞中未见明显增殖。比较R CA6与NR CA6代表株接种于RD细胞后细胞活性下降的动态变化,未见显著差异。本研究证实,CA6为近年来上海地区手足口病的主要病原体,R CA6和NR CA6的构成比逐年变化,提示持续监测手足口病主要病原体并了解其生物学特性,对上海地区手足口病的防控预警及疫苗研发具有重要意义。
- 张晓玲张晓玲俞慧菊刘祎宋志刚宋志刚
- 关键词：手足口病肠道病毒71型
- 2010-2013年上海长宁地区成人轮状病毒急性胃肠炎的分子特征被引量：8
- 2016年
- 为研究上海长宁地区成人轮状病毒急性胃肠炎的分子特征,收集2010年6月—2013年12月长宁区定点医院成人急性胃肠炎患者的粪便标本1 554份,采用酶联免疫吸附试验（enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）进行A组轮状病毒检测,多重聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR）进行B组和C组轮状病毒检测。结果显示,1 554例患者的平均年龄为（46.19±15.59）岁,其中男性691例、女性863例。共检出轮状病毒200株,检出率为12.87%。18~39岁组的轮状病毒检出率为9.15%,40~59岁组为15.58%,60~79岁组为15.16%,≥80岁组为18.57%。A组轮状病毒基因型检测结果显示,G型以G9亚型最多（29.82%）,P型以P[8]亚型最多（77.19%）,GP组合以G9P[8]最多（25.73%）。结果提示,2010—2013年上海长宁地区成人轮状病毒急性胃肠炎在就诊患者中以中老年多见,基因型以G9P[8]最多。
- 徐仲卿沈思兰朱绍琴张万菊胡芸文钱方兴
- 关键词：腹泻基因型轮状病毒急性胃肠炎
