吉林省重大科技成果转化项目(10ZDZH010)
- 作品数:6 被引量:25H指数:3
- 相关作者:程世鹏易立王建科程悦宁许红丽更多>>
- 相关机构:中国农业科学院特产研究所吉林农业大学更多>>
- 发文基金:吉林省重大科技成果转化项目吉林省科技发展计划基金国家科技部农业科技成果转化资金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 水貂肠炎病毒LN-10分离株的分离鉴定被引量:4
- 2012年
- 为了解我国水貂肠炎病毒(MEV)的流行情况,本研究采用F81细胞从疑似患有肠炎的水貂粪便样品中分离出一株病毒,经形态学、血清学、动物回归试验和分子生物学鉴定,分离的病毒为MEV,命名为LN-10。对该病毒主要结构蛋白VP2基因进行克隆测序和基因进化分析表明,LN-10分离株VP2基因与GenBank中的其他18株MEV株核苷酸和氨基酸均有较高的同源性,分别为99.3%~100%和99%~100%,其中核苷酸同源性与ZYL-1株为100%,而氨基酸同源性与ZYL-1株和Manzhouli株均为100%。本研究为MEV分子流行病学调查和疫苗的研究奠定了基础。
- 王建科易立许红丽杨莘程悦宁程世鹏武华闫喜军
- 关键词:水貂肠炎病毒
- 犬瘟热病毒感染小鼠脾淋巴细胞所引起的主要基因表达情况的变化
- 2014年
- 采用基因芯片技术对正常小鼠淋巴细胞和犬瘟热病毒(CDV)感染后第7天的小鼠淋巴细胞基因表达的差异性进行了比较,从分子水平上探究了CDV感染机体后的免疫应答情况。结果显示,检测到364个差异表达基因,其中280个基因的表达水平升高,84个基因的表达水平下降。进一步以基因芯片中CDV感染后上调基因C-C型趋化因子受体2(CCR2)和下调基因CD14为研究对象,应用实时荧光定量方法验证基因芯片的结果,两者完全相符,说明芯片的筛查结果可靠。根据基因芯片的结果,采用Go注释系统和数据库查询,对364个差异表达基因进行功能注释,结果显示,差异表达基因主要与水解、结合、转运调控、信号传递、代谢、结构组成等有关,其中CCR2基因、CD14基因、丝裂原活化蛋白激酶1(MAP3K1)基因、CD69基因等被鉴定为差异表达基因。上述结果为进一步阐明CDV感染后机体的免疫应答机制奠定了基础。
- 仝明薇易立程悦宁王建科赵航林鹏程世鹏
- 关键词:基因芯片犬瘟热病毒差异表达基因
- 犬瘟热病毒感染小鼠脾淋巴细胞所引起的主要基因表达变化
- 本研究采用基因芯片技术首次对正常小鼠淋巴细胞和犬瘟热病毒(CDV)感染后(感染后7天)淋巴细胞的基因表达差异性进行了研究比较,探究CDV感染后机体免疫应答的分子表达情况。结果监测到364个差异表达基因,其中280个基因的...
- 仝明薇易立程悦宁王建科赵航程世鹏孙长英王文宪
- 关键词:基因芯片差异表达基因
- 文献传递
- 犬瘟热病毒PS株的全基因组序列测定与遗传进化分析被引量:3
- 2012年
- 对犬瘟热病毒(CDV)PS株基因组进行全基因组序列测定与分析,以阐明该毒株的基因特征与遗传进化情况。利用RT-PCR方法分段扩增PS株全基因组序列,分别将产物克隆入pMD18-T载体中并进行测序,将所测序列拼接获得CDV PS株的全基因组cDNA。用DNAStar软件比较PS株全基因组序列与国内外犬瘟热病毒疫苗株和野毒株全基因组序列的同源性,然后用Mega4.0软件进行系统进化分析。测序结果显示,PS株全基因组序列的长度为15 690nt,该基因组推导的某些氨基酸位点发生了突变。与GenBank中登录的国内外参考毒株的同源性比较结果显示,PS株基因组与MKY-KM08分离株的基因序列同源性高达97.9%,与其他毒株的同源性为93.0%~97.0%;与CDV3疫苗株和Onderstepoort疫苗株的同源性最低,分别为93.2%和93.0%。基于全基因组序列绘制的系统进化树表明,所有CDV分离株分为疫苗株和野毒株2支,PS株和MKY-KM08株位于同一支,属于亚洲1型。结果表明PS株为野毒株,其全基因组序列与MKY-KM08株的全基因组序列亲缘关系最近。
- 许红丽易立王建科杨莘程世鹏
- 关键词:全基因组序列进化分析
- 我国毛皮动物主要传染病防控现状及防控建议被引量:11
- 2013年
- 文中对我国毛皮动物主要传染病流行特点和防控现状进行了概述,总结了毛皮动物传染病防控制剂研究现状,并提出了毛皮动物传染病防控建议。
- 程悦宁易立司方方王建科程世鹏钱爱东
- 关键词:毛皮动物传染病
- 犬细小病毒JL-M13株分离鉴定及全基因组序列分析
- 本研究将检测为阳性的病料经处理后接种F81细胞盲传3代并获得一株细小病毒,命名为JL-M13。运用重叠PCR技术从JL-M13中扩增出5条核苷酸序列,拼接后进行序列分析,结果表明所获病毒核酸基因组大小为4 621 bp,...
- 仝明薇易立程世鹏孙长英王文宪
- 关键词:犬细小病毒全基因组
- 文献传递
- 犬细小病毒JL-M13株的分离鉴定及全基因组序列分析被引量:6
- 2015年
- 将检测为犬细小病毒(CPV)阳性的病料经处理后接种F81细胞盲传3代并获得一株细小病毒,命名为JL-M13。应用重叠PCR技术从JL-M13中扩增出5条核苷酸序列,拼接后进行序列分析。结果表明,所获病毒核酸基因组大小为4 621bp,与其他犬细小病毒的基因相似性为98.2%-99.4%。系统发育树分析表明,JL-M13与CPV-2毒株(EF011664.1)相似率最高,与Type-2型犬细小病毒疫苗株相距较远。
- 仝明薇易立程世鹏
- 关键词:犬细小病毒全基因组
- 水貂肠炎病毒疫苗株和野毒株PCR-RFLP鉴别方法的建立被引量:1
- 2012年
- 为了建立水貂肠炎病毒(MEV)疫苗株与野毒株的鉴别检测方法,根据GenBank中的水貂肠炎病毒序列设计了1对引物,用来扩增包含水貂肠炎病毒NS1基因在内的2 013bp大小的片段。通过对国内疫苗毒MEVB株及其他细小病毒参考株的NS1基因序列比较发现,疫苗毒MEVB株NS1基因核苷酸1401位的碱基由T变为C,致使1399位~1404位的核苷酸构成由ATTGAT变异为ATCGAT,多了1个限制性内切酶ClaⅠ酶切位点,其他MEV分离毒株中均未出现此酶切位点。用特异性引物扩增出2 013bp的目的片段后,再用限制性内切酶ClaⅠ进行酶切分析,疫苗毒MEVB株被切割成1 404bp和609bp的2个片段,国内其他分离株均未出现上述片段。结果表明,所建立的PCR-RFLP方法可以区分疫苗毒MEVB株和野毒株。
- 王建科程世鹏杨莘易立许红丽程悦宁师新川武华闫喜军
- 关键词:水貂肠炎病毒疫苗株野毒株