安徽省高校省级自然科学研究项目(KJ2010A142)
- 作品数：2 被引量：21H指数：2
- 相关作者：郝家胜朱朝东夏靖胡静朱国萍更多>>
- 相关机构：安徽师范大学中国科学院更多>>
- 发文基金：安徽省优秀青年科技基金安徽省高校省级自然科学研究项目北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析被引量：15
- 2011年
- 目前有关蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道还不多见。本文利用long PCR和引物步移法得到大卫绢蛱蝶Calinaga davidis的线粒体基因组全序列,同时就其基因组成和结构特点作了初步分析。结果显示：其基因组全长为15 267 bp（GenBank登录号为HQ658143）,包括13个蛋白质编码基因（ATP6,ATP8,COI-III,ND1-6,ND4L,Cytb）、22个tRNA基因、2个rRNA基因（16S和12S）以及非编码的控制区。与其他鳞翅目昆虫相一致,其基因组未出现基因重排现象。基因组共包含11个基因间隔区,总长度为130 bp,间隔长度1~46 bp,最大间隔在tRNAGln与ND2基因之间;基因间共存在13处重叠,总长度为66 bp,重叠碱基数1~35 bp,最长的重叠区位于COII与tRNALys基因。lrRNA和srRNA基因长度分别为1 337 bp和773 bp;除tRNASer（AGN）缺少二氢尿嘧啶臂（DHUstem）,在相应的位置上只形成一个简单环外,其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。13个蛋白编码基因总长度为11 247 bp,共有3 737个密码子,它们的碱基组成和密码子的使用具有明显的偏倚性;除COI外（起始密码子TTG）,其余的12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子;COI基因终止密码子为不完全T,ND4基因终止密码子为不完全TA,其余基因都以TAA为终止密码子。A＋T丰富区全长为389 bp,A＋T含量高达92.0%,其中存在2段类似微卫星的重复序列（TA）6和（AAT）4。本文的研究结果为探讨绢蛱蝶亚科在蛱蝶科中的系统学地位及其与其他亚科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据。
- 夏靖胡静朱国萍朱朝东郝家胜
- 关键词：鳞翅目线粒体基因组串联重复序列
- 丝带凤蝶线粒体基因组全序列及其系统学意义(英文)被引量：8
- 2012年
- 锯凤蝶类与凤蝶科其他类群的系统发生关系及其分类学地位一直存在争议。本研究采用PCR和long PCR技术测定了属于锯凤蝶类的丝带凤蝶Sericinus montelus线粒体基因组全序列;结合已有的其他凤蝶科物种的相应序列数据,基于13个蛋白质编码基因重建了凤蝶科主要类群的系统发生树,探讨了它们之间的系统发生关系。基因组分析结果表明:丝带凤蝶线粒体基因组全长15242bp,包括13个编码蛋白基因(ATP6,ATP8,COⅠ-Ⅲ,ND1-6,ND4L和Cytb)、22个tRNA基因、16S和12SrRNA基因以及非编码的控制区;基因组A,T,G和C含量分别为40.1%,40.8%,7.4%和11.7%,表现出明显的AT偏倚。所有的蛋白质编码基因都使用标准的起始密码子(ATN);除ND4和ND4L基因使用单个的T作为终止密码子外,其余蛋白编码基因都使用了标准的终止密码子(TAA)。除丝氨酸tRNA的二氢尿苷突环缺失外,所有tRNA基因都形成典型的三叶草型结构。基因组中共存在12个大小介于2～65bp之间的基因间隔区以及15个大小介于1～8bp之间的基因重叠区,其中,存在于COⅡ和tRNALys之间的24bp的间隔区在其他鳞翅目昆虫中未曾见到。以邻接法和最大简约法并基于13个蛋白质编码基因序列对凤蝶科进行了系统发生分析。结果显示,丝带凤蝶和中华虎凤蝶Luehdorfia chinensis先构成一个支系,再和冰清绢蝶Parnassius bremeri构成姊妹群;表明锯凤蝶类应作为族级分类单元归于凤蝶科下的绢蝶亚科。
- 季刘伟郝家胜王莹黄敦元赵金良朱朝东
- 关键词：凤蝶科丝带凤蝶线粒体基因组系统发育分析
