浙江省自然科学基金(Y3110537)
- 作品数：8 被引量：29H指数：4
- 相关作者：王艳丽姜华孙国昌邱海萍张震更多>>
- 相关机构：浙江省农业科学院南京农业大学杭州师范大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- PWL基因家族在稻瘟病菌中的分布及变异初探被引量：4
- 2013年
- PWL寄主特异性无毒基因家族是稻瘟病菌无毒基因中一个重要的类群,了解PWL家族成员在稻瘟病菌中的分布和变异对稻瘟病菌群体遗传多样性的研究具有重要价值。研究通过设计23对引物对PWL家族成员进行分布和变异分析,结果筛选到12对引物有特异性扩增结果。扩增结果表明PWL家族基因的主要变异为缺失,试验结果表明,PWL1基因仅存在于牛筋草来源的稻瘟菌菌株中存在,而在分离于水稻的稻瘟病菌中表现为完全缺失;与此相反,PWL2基因则仅在水稻来源的菌株中存在。而插入变异仅存在于部分菌株PWL4基因的上游区域。结果还表明PWL家族成员在稻瘟病菌中具有丰富的的扩增多态性,对稻瘟病菌群体遗传多样性的研究具有重要价值。
- 穆慧敏姜华毛雪琴柴荣耀王艳丽张震王教瑜邱海萍杜新法孙国昌
- 关键词：稻瘟病菌
- 利用抑制差减杂交筛选稻瘟菌继代接种菌株差异表达基因被引量：2
- 2012年
- 稻瘟菌是重要的水稻病原微生物,通过各种变异机制提高自身对水稻的致病力。通过继代接种可使稻瘟菌发生适应性变异,从而增强致病力。为了解相关适应性变异的分子机制,利用稻瘟菌原始菌株与在水稻上继代接种的第四代菌株构建了抑制消减杂交文库。经过PCR验证及测序分析,共计获得168条EST非冗余序列。拼接后,Unigene的数量为110个。利用不同数据库,进行BLASTX分析,获得了与这些序列推测蛋白相似的功能蛋白,分析蛋白功能注释表明这些蛋白主要与合成和信号传导相关。GO分析表明相关蛋白涉及生命活动的多个方面,但主要集中于细胞生长发育、核酸结合及外界刺激的感知及传导。
- 姜华苏志杰张震王艳丽王教瑜柴荣耀邱海萍毛雪琴杜新法孙国昌
- 关键词：稻瘟菌抑制消减杂交表达序列标签
- 稻瘟病菌无毒基因序列变异研究进展被引量：10
- 2015年
- 稻瘟病是水稻生产上的重要病害,稻瘟病菌无毒基因与水稻抗病基因间符合基因对基因学说,当寄主的抗病基因产物直接或间接识别稻瘟病菌的无毒基因产物时,可激发寄主产生过敏性坏死反应。在病原菌的致病系统中,无毒基因不稳定,经常发生变异,无毒基因的变异导致其逃脱寄主抗病基因的识别,抗病品种丧失抗病性。因此,了解无毒基因的变异机制对于培育抗病品种是至关重要的。无毒基因的变异机制主要包括点突变、缺失、插入、复制、移码突变等。目前,无毒基因AVR1-CO39,PWL,AVR-Pita的变异机制报道较多,ACE1,Avr Piz-t,AVR-Pia,AVR-Pii,AVR-Pik/km/kp的变异机制报道较少。
- 姜华余欢王艳丽孙国昌
- 关键词：稻瘟病菌无毒基因
- 稻瘟病菌不同拼接版本基因组序列差异性比较
- 2013年
- 为了明确稻瘟病菌不同拼接版本基因组序列的差异,促进合理利用不同拼接版本基因组序列,比较了不同版本稻瘟病菌基因组数据库微卫星序列的分布情况,功能基因的位置及长度差异,SSR引物的位置差异等。结果表明,不同基因组数据库在序列长度上差异明显,功能基因的位置、SSR引物位置和SSR核苷酸重复类型数量也差异明显。无毒基因Avr-Pizt连锁标记比较分析表明Avr-Pizt基因定位在不同数据库中差别明显。不同稻瘟病菌数据库中,第7染色体的序列与其上的BAC序列之间差异显著,虽然这不影响功能基因的分析,但影响无毒基因图位克隆的定位区间的判断。因此,稻瘟病菌研究者应根据实际情况选择相应的数据库。
- 毛雪琴姜华王艳丽张震柴荣耀王教瑜邱海萍杜新法孙国昌
- 关键词：稻瘟病稻瘟病菌基因组图位克隆无毒基因
- 杂草和水稻梨孢菌亲缘关系研究被引量：2
- 2012年
- 利用12个引物的随机扩增多态性DNA标记(RAPD)对来自18种寄主的49个梨孢菌株进行了亲缘关系分析,从DNA电泳谱带中可以直观地看出,来自同一种或同一属或亲缘关系相近寄主上的梨孢菌带型较相似,相反,亲缘关系较远的寄主上的梨孢菌带型差异较大,茭白、碎米莎草和马唐寄主上的梨孢菌的谱带均非常特异,与牛筋草和狗尾草等其他15种寄主的梨孢菌有较大差异,牛筋草和狗尾草等15种寄主的梨孢菌存在比较多的共有谱带。对引物S380扩增的RAPD谱带进行聚类分析表明,18种寄主上的49个梨孢菌株可分为5个类群。种与种之间的DNA(RAPD谱带)电泳谱带差异非常明显,而种内品种间的带型差异比较小。
- 毛雪琴邱海萍张震姜华柴荣耀王教瑜王艳丽孙国昌杜新法
- 关键词：梨孢菌聚类分析
- 利用SSR技术研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性被引量：4
- 2015年
- 为研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性,利用分布于稻瘟病菌7条染色体上的28对SSR引物,对浙江省11个城市1978至2011年11个城市的稻瘟病菌的遗传结构多样性进行了分析。结果表明,28对SSR引物共扩增出171个等位基因,每对引物可扩出2～24个等位基因,平均多样性指数0.534,平均多态性信息含量为0.494。分离于不同地理位置的稻瘟病菌株的多样性较高,其中丽水和杭州的遗传多样性最高,舟山的遗传多样性最低。分离于不同年份的稻瘟病菌的遗传结构差异较大,1990年的遗传多样最高,1978年的遗传多样性最低。分离于不同水稻类型的稻瘟病菌的遗传多样性较高,部分分离于籼稻和粳稻的稻瘟病菌的遗传结构相似甚至相同,分离于籼稻的稻瘟病菌的遗传多样性高于分离于粳稻的稻瘟病菌。
- 谢晶晶姜华毛雪琴柴荣耀邱海萍张震王艳丽王教瑜杜新法孙国昌
- 关键词：稻瘟病菌SSR多样性
- 研究稻瘟病菌群体遗传多态性的分子标记方法被引量：10
- 2013年
- 稻瘟病菌的遗传结构经常发生改变,导致田间稻瘟病菌群体具有多态性,严重阻碍了抗病品种在稻瘟病防治上的应用。实时监测和研究稻瘟病菌的遗传变异,了解田间稻瘟病菌群体遗传结构的多样性及其动态对于防治该病具有重大意义。目前,研究稻瘟病菌遗传多样性的常用方法为分子标记技术,主要包括限制性片段长度多态性(RFLP)方法、随机扩增多态性DNA(RAPD)技术、特异性扩增片段(SCAR)标记、简单重复序列(SSR)标记、rep-PCR技术、扩增片段长度多态性(AFLP)、反转录转座子-微卫星扩增多态性(REMAP)。本文就以上这些分子标记方法的实现、优缺点及差异进行了综述,同时也对这些方法在稻瘟病菌遗传多样性方面的研究进行了回顾。
- 穆慧敏姜华王艳丽孙国昌
- 关键词：稻瘟菌多态性分子标记
- 利用微波-热效应进行限制性内切核酸酶反应的可行性验证
- 2012年
- 限制性内切酶催化的酶解反应是分子生物学实验中的常用技术.鉴于酶切反应时间长,有人提出采用微波释放的热效应催化限制性内切酶解反应,以期缩短酶解时间.但微波是否能代替传统酶切反应还需验证.本研究设计了一系列的酶切试验,验证微波酶切是否有效.结果表明:短时间(2 min)微波炉高火处理未导致DNA降解及内切酶失活.对于质粒的单酶切和部分双酶切,短时间(2 min)微波炉处理可替代水浴加热完成酶解反应.对于部分双酶切体系,微波炉处理酶切不完全,不能替代温水浴.使用微波酶解需严格控制时间,切勿时间过长.
- 穆慧敏姜华王艳丽孙国昌
- 关键词：酶切微波炉微波
