国家科技重大专项(2009ZX10602-12)
- 作品数：8 被引量：49H指数：4
- 相关作者：田克诚庄丽付琳王定明阎岩更多>>
- 相关机构：贵州省疾病预防控制中心贵阳市疾病预防控制中心贵州省人民医院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项青年科技基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 贵阳地区GⅡ．4型诺如病毒变异株的初步研究被引量：3
- 2012年
- 目的了解贵阳地区GⅡ．4型诺如病毒变异株的组成及其点突变。方法监测2010年6-11月于贵阳地区哨点医院就诊的急性胃肠炎病例，收集粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（real-timeRT—PCR）初步鉴定，随机选取部分GⅡ型诺如病毒阳性标本，采用一步法RT—PCR对其VP1基因区克隆及测序，基因序列与国内外流行的GH．4型诺如病毒进行系统进化及氨基酸位点的突变分析。结果检测标本426份，有267份（62．68％）GⅡ型诺如病毒阳性，测序获得了9份GⅡ．4型诺如病毒VP1基因组序列，贵州省2010年流行的GH．4型诺如病毒包括2个变异株（GH．42008a和GⅡ．42008b新型变异株），亚型组间的VP1基因的同源性为95．90％～96．72％，亚型组内同源性为99．45％～100％，有2个氨基酸位点易发生突变。结论贵阳地区2010年夏秋季急性胃肠炎以诺如病毒GH型为主，并且变异株具有多样性。
- 阎岩郭军蒋维佳田克诚李世军胡静唐光鹏王定明
- 关键词：诺如病毒VP1基因变异株
- 贵州省2012年度禽流感病毒H5N1亚型HA-1基因分析被引量：2
- 2013年
- 目的建立并完善贵州省禽流感病毒基因分析检测技术平台,了解贵州省禽流感病毒H5N1亚型HA1片断与WHO公布的流行株比对有否发生变异。方法收集禽流感H5N1亚型病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,进行差异性分析,构建系统发育树。结果贵州省禽流感病毒H5N1亚型中鸭来源的禽流感病毒组成一个分支,组内差异性在0.00～5.00之间;鸡来源的禽流感病毒组成另外一个分支,组内高度同源,差异性为零。结论贵州省禽流感病毒在物种之间存在一定的种属特异性。并且与湖南省的禽流感病毒亲缘关系较近,这与两省之间地理交界有关。
- 庄丽蒙黎明赵文荣宋倩
- 关键词：禽流感病毒HA1基因
- 贵州省2011年急性胃肠炎诺如病毒的哨点监测及其基因特征分析被引量：1
- 2013年
- 为了解贵州省2011年诺如病毒的基因型,监测了2011年5月至12月于贵州省人民医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)初步鉴定,并对阳性株的VP1基因区克隆及测序。检测标本70份,GⅠ型诺如病毒阳性1株,阳性率1.43%,GⅡ型诺如病毒阳性34株,阳性率48.57%,获得7份GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,3株为GⅡ.4亚型,为新型变异株(GⅡ4 2011),与GⅡ4 2006b变异株的亲缘关系最近,有1个氨基酸位发生了回复突变;4株为GⅡ.3亚型,分为2个基因簇,1簇与2008～2009年韩国株(HM635118)及上海株(GU991355)的亲缘关系最近,1簇与2010年日本株(AB629943)及2007年印度株(EU921389)等的亲缘关系最近,有4个氨基酸位点易发生回复突变。
- 阎岩吴悦郭军田克诚王定明
- 关键词：诺如病毒VP1基因
