国家自然科学基金(31372292)
- 作品数：10 被引量：31H指数：4
- 相关作者：刘文忠乔利英景炅婕潘洋洋张方更多>>
- 相关机构：山西农业大学天津农学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金年山西省研究生优秀创新项目国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
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- 绵羊及相关物种去乙酰化酶1的理化性质和蛋白结构预测被引量：2
- 2015年
- 为深入研究SIRT1基因及其编码蛋白的结构和功能,特别是在各信号通路中的作用,本文基于NCBI发布的包括绵羊在内的9个物种的SIRT1基因的核苷酸和蛋白质序列,采用生物信息学方法分析SIRT1蛋白的理化性质和蛋白结构,预测了绵羊SIRT1蛋白的结构和翻译后修饰位点。结果表明,不同物种SIRT1蛋白的理化性质基本一致。绵羊SIRT1是一种接近于中性的亲水性脂溶蛋白,预测其有40个潜在的O-糖基化位点、2个N-糖基化位点、33个磷酸化位点、18个乙酰化修饰位点、11个泛素化修饰位点和3个类泛素化修饰位点。这些结果为进一步研究SIRT1的功能和表达调控奠定了科学依据。
- 景炅婕张静贾夏丽梁琛刘建华潘洋洋张方胡子乔任端阳刘文忠
- 关键词：绵羊生物信息学分析蛋白结构
- 绵羊Lpin2基因多态性及其与尾型和屠宰性状的关联分析被引量：4
- 2017年
- 试验旨在研究Lpin2基因遗传变异对绵羊尾型和屠宰性状的影响。以两品种脂尾型绵羊广灵大尾羊和小尾寒羊为研究对象,采用DNA直接测序法检测Lpin2基因5′非编码区部分序列的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与尾型及屠宰性状的关联性。结果发现,Lpin2基因5′非编码区起始密码子上游约1 200bp的DNA序列中存在3个SNPs,即NC_019480.2:g.-663dup ATT(SNP1)、g.-388T>C(SNP2)和g.-330T>G(SNP3),其中SNP1为三核苷酸ATT重复扩展短串联重复序列(STR)的拷贝数变异(CNV),在广灵大尾羊中的突变频率显著高于小尾寒羊(P<0.05),显著降低了广灵大尾羊的胴体重与屠宰率(P<0.05),对小尾寒羊的屠宰性状无显著影响(P>0.05)。SNP2和SNP3构成单倍型块,形成的单倍型对各性状无显著影响(P>0.05)。试验结果可为绵羊肉质性状的标记辅助选择提供参考依据。
- 焦小丽景炅婕乔利英洪中山李留安田川尧康翠翠陈明明刘文忠
- 关键词：绵羊单核苷酸多态性
- 绵羊miR-191靶基因预测、功能分析及在脂肪组织中的表达
- miR-191是一种具有脂肪代谢调控功能的microRNA(miRNA).本研究利用多种生物信息学在线软件，预测绵羊miR-191(oar-miR-191)的靶基因，并对靶基因进行GO注释；利用实时荧光定量PCR技术，对...
- 潘洋洋景炅婕乔利英刘建华刘文忠
- 关键词：荧光定量PCR
- miR-132-3p靶向UCP2调节绵羊前体脂肪细胞分化的研究被引量：6
- 2017年
- 旨在研究miR-132-3p对绵羊前体脂肪细胞中UCP2基因的表达调控机制。本研究以绵羊皮下脂肪细胞为研究对象,检测miR-132-3p与UCP2在绵羊前体脂肪细胞中的作用机制;利用生物信息学软件预测miR-132-3p与UCP2的结合位点,并通过双荧光素酶报告试验验证miR-132-3p与UCP2的靶标关系;在绵羊前体脂肪细胞中过表达miR-132-3p,用RT-qPCR、Western blotting技术检测过表达后UCP2mRNA和蛋白的表达水平;最后,采用RT-qPCR检测绵羊前体脂肪细胞分化过程中UCP2和miR-132-3p的表达。结果表明,miR-132-3p在UCP2 3′-UTR上存在结合位点,并显著下调UCP2 3′-UTR重组双荧光质粒的相对荧光活性(P<0.05);过表达miR-132-3p显著下调UCP2mRNA的表达(P<0.05),且明显降低UCP2蛋白的表达量;绵羊前体脂肪细胞分化中期miR-132-3p与UCP2的表达存在负相关关系。综上表明,miR-132-3p通过特异性结合UCP2 3′-UTR抑制UCP2在mRNA和蛋白水平的表达,在一定程度上促进绵羊前体脂肪细胞的分化。
- 师涛闫晓茹潘洋洋景炅婕乔利英郭云利申彩云张富权刘文忠
- 关键词：绵羊前体脂肪细胞细胞分化UCP2
- 脂肪分化相关信号通路及microRNA调节研究进展被引量：5
- 2015年
- 畜禽体内脂肪含量的多少决定了其肉质的好坏,而脂肪分化则是一个由许多因子调控的复杂生物学过程。了解脂肪分化相关的信号通路及其miRNAs的调节作用,可以在一定程度上揭示脂肪分化的分子调控机制。本文在对6个重要的调控脂肪细胞分化的信号通路进行介绍的基础上,分别对8个促进脂肪细胞分化和8个抑制脂肪细胞分化的miRNAs的生物学功能和作用机制进行了探讨,总结了其靶基因在脂肪形成中的作用。有关miRNAs及其靶基因的研究为畜禽肉质性状的遗传改良提供了理论依据。
- 贾夏丽潘洋洋乔利英郭云雁胡子乔张方李宝钧刘文忠
- 关键词：脂肪细胞成脂分化信号通路MICRORNA靶基因
- miR-194-5p靶向调控BCKDHA基因的表达被引量：3
- 2017年
- 旨在预测并验证调控支链氨基酸分解代谢的限速酶支链α-酮酸脱氢酶复合体(Branched-chainα-ketoacid dehydrogenase complex,BCKDH)中α亚基即BCKDHA基因表达的关键miRNA。本研究利用3个在线软件预测与该基因具有靶标关系的miRNAs。利用荧光定量PCR检测小鼠3T3-L1前脂肪细胞分化过程中和超表达后关键miRNA与BCKDHA的表达量。结果表明,miR-194-5p是调控BCKDHA表达的一个关键miRNA,其种子序列与BCKDHA3′UTR第190~196位碱基完全互补。MiR-194-5p的表达随分化时间呈下降趋势,而BCKDHA mRNA则呈上升趋势。双荧光素酶报告结果也显示二者具有靶标关系,miR-194-5p下调BCKDHA的表达。超表达miR-194-5p后,BCKDHA的表达显著下调(P<0.05)。由此证明,miR-194-5p通过与BCKDHA基因3′UTR结合抑制其表达。
- 张莹姣乔利英景炅婕潘洋洋马元郭云利魏琼刘文忠
- 关键词：3T3-L1
- 绵羊不同部位脂肪组织microRNA高通量测序及生物信息学分析被引量：8
- 2016年
- 本研究旨在挖掘绵羊不同脂肪组织中特异表达的miRNAs。构建肾周(PEF)、皮下(SUF)和尾部(TAF)脂肪组织的3个小RNA文库,利用Solexa测序技术进行测序,用Stem-loop qRT-PCR技术和生物信息学方法对测序结果进行验证和分析。结果表明,8个随机选择的miRNAs中有7个miRNAs的表达与测序结果一致。在肾周和皮下脂肪组织的sRNA文库中分别检测到128和112个保守miRNAs,分别发现198和196个新miRNAs。结合前期在尾脂中检测到miRNAs的分析结果,肾周脂肪中特异表达的有12个保守的和66个新miRNAs;皮下脂肪中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和30个;尾脂中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和34个。上述结果将为进一步研究miRNA调控绵羊的脂肪代谢提供科学依据。
- 张方胡子乔景炅婕潘洋洋乔利英李宝钧刘建华刘文忠
- 关键词：绵羊脂肪组织MICRORNA生物信息学方法
- 绵羊miR-376e-3p的靶基因预测与GO功能分析
- 2017年
- [目的]研究miRNA对脂肪代谢的调节作用,在一定程度上揭示脂肪代谢的分子机制。[方法]本研究选取实验室前期高通量测序结果中的miR-376e-3p进行研究,其在不同脂尾型绵羊尾部脂肪组织中差异表达显著,是脂肪代谢的关键miRNA。用3种软件对miR-376e-3p进行靶基因预测,并对预测结果进行GO通路富集分析。[结果]MiR-376e-3p有25个潜在的靶基因,其中21个基因富集到3种分子功能,23个基因富集到14个生物学过程中,其中Vldlr具有脂蛋白粒子受体活性。[结论]推测miR-376e-3p可能通过调节其潜在靶基因Vldlr参与脂肪代谢。为进一步研究miR-376e-3p和Vldlr在绵羊脂肪代谢中的作用奠定了基础。
- 马元胡子乔张莹姣张雁申彩云张富权刘文忠
- 关键词：绵羊
- 绵羊Lpin2基因CDS区克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2017年
- 本研究应用RT-PCR、5'-RACE、TA克隆技术获得绵羊Lpin2基因CDS区,并进行相关生物信息学分析,为其遗传特性及编码蛋白功能机制的研究提供基础数据。结果获得绵羊Lpin2基因2 754 bp,包括84 bp的5'UTR和2 670 bp的CDS区,编码889个氨基酸。生物信息学分析编码蛋白lipin2属不稳定的中性亲水脂溶性蛋白,存在跨膜域、2个O-糖基化位点和89个磷酸化位点,没有信号肽,定位于细胞质或细胞器中。存在由细胞质活性氧(ROS)主导的氧化还原机制形成的二硫键。二级结构包含高比例的环(80.54%)。蛋白N-末端和C-末端分别含有保守结构域Lipin_N和LSN2。绵羊与山羊、家牛、羊驼、猪、家犬、灵长类与啮齿类动物以及原鸡lipin2氨基酸序列同源,系统进化与其亲缘关系远近一致,Lpin2基因编码区进化保守。绵羊lipin2与lipin1氨基酸序列相似性相对较低(66%),可能与其有差异的功能活性有关。
- 焦小丽景炅婕乔利英李留安李宝钧刘文忠
- 关键词：绵羊克隆生物信息学
- 绵羊lipin2与lipin3蛋白表达研究
- 2018年
- 为了研究lipin2与lipin3蛋白在绵羊脂肪等不同组织中的表达差异性,试验应用Western-blot技术检测绵羊肝脏、肾脏、小肠、股二头肌、肾周脂肪、尾脂、睾丸组织中lipin2和lipin3蛋白表达量。结果表明：lipin2在睾丸、尾脂和肾周脂肪中的表达量较高,显著高于小肠（P〈0.05）,与肝脏、股二头肌、肾脏中的表达量差异不显著（P〉0.05）;lipin3在7种组织中均有较高的表达量,其中睾丸和尾脂中表达量较高,小肠中最低,各组织间表达量差异不显著（P〉0.05）。说明lipin2与lipin3在绵羊睾丸组织、肾周脂肪、肝脏中的高表达可能与其调控绵羊繁殖机能及脂肪沉积有关。
- 焦小丽乔利英乔利英郭亮刘文忠
- 关键词：绵羊蛋白表达
