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111份大薯种质资源遗传多样性AFLP分析被引量：9: 2014年; 采用AFLP分子标记方法对收集于6省不同地区的111份大薯种质资源进行遗传多样性分析。筛选到的8个AFLP引物组合扩增到1291个位点，其中1286个是多态性位点。利用多态性信息含量（PIC）、标记指数（MI）和解析强度（RP）分析不同引物组合的标记效率，获得引物的 PIC平均值为 0.22，MI平均值为35.67，RP平均值为50.50，表明引物扩增位点的高多态性和对大薯种质资源具有强辨别能力，其中引物E-AAC/CAG-M（PIC 0.24、MI 38.56、 RP 56.32）具有较高的标记效率。111份大薯种质的遗传相似系数（GS）在0.30～0.82之间，平均为0.58，表明大薯种质资源的遗传相似性较低。采用UPGMA对大薯种质进行聚类分析，遗传相似系数在0.54时，111份材料被划分为4个类群和3个单独的分支（序号分别为20、42、47），不同地区来源的大薯材料在聚类图中没有明显界限。; 许云吴文嫱谢俊黄东益; 关键词：AFLP

自然环境中甲醛降解菌的分离筛选与鉴定被引量：2: 2014年; [目的]筛选出具有甲醛降解能力的微生物,为甲醛降解菌的产业化利用提供技术支撑.[方法]采用PDA固体培养基分离甲醛耐受菌,在PDA培养基上培养观察耐受菌的形态特征,显微观察其孢子结构;采用rDNA-ITS基因序列同源性分析对目标菌株进行分子鉴定;通过测菌丝湿重来绘制其生长曲线,采用蛋白显色法测定甲醛浓度的变化.[结果]分离纯化出1株甲醛耐受真菌J-5,其培养特征、显微特征与曲霉属（Aspergillus）相似;18S rDNA核酸序列同源性分析发现,菌株J-5与曲霉属的6个株系为同一类群,所处类群中18S rDNA基因序列两两之间的相似值均在76％以上.J-5菌株最大可耐受甲醛浓度为2000 mg/L,可在192 h内将浓度为1560 mg/L的甲醛降解到100 mg/L以下.J-5菌株在培养0～96h内生长缓慢,但甲醛浓度下降迅速,当甲醛浓度下降到400 mg/L后,菌株生长迅速,甲醛浓度下降缓慢.[结论]分离筛选出1株甲醛降解菌J-5,经形态特征和分子生物学鉴定为曲霉属真菌,其在生长调整期对甲醛的降解速度最快.; 李萍王东阳许云; 关键词：甲醛降解降解特性

参薯ADP-ribosylation factor(ARF)基因的生物信息学分析: 2013年; 【目的】对参薯等11种植物的ARF基因进行生物信息学分析,为深入研究植物ARF基因的结构与功能分析奠定基础。【方法】对参薯ARF同源序列进行克隆和序列测定,利用生物信息学相关软件对参薯等11种植物的ARF的核苷酸序列、氨基酸序列、组成成分、疏水性/亲水性、蛋白质二级和三级结构、信号肽、跨膜结构、导肽进行分析。【结果】参薯ARF基因同源片段大小为1200bp。系统进化分析结果表明,参薯等11种植物的ARF氨基酸序列可分为Ⅰ和Ⅱ两大类,细分A、B、C、D、E5个亚族,其中参薯ARF1和蒺藜苜蓿组成一个亚族,参薯ARF2和风信子组成一个亚族。参薯ARF的氨基酸序列中存在GTP/Mg2+结合位点和G2、G3保守区域,具有两个相同的效应结构域Switch1和Switch2。参薯ARF蛋白结构以无规则卷曲为主,三级空间结构不稳定。ARF蛋白为疏水性、脂溶性蛋白,无信号肽,存在明显跨膜结构域;ARF导肽无明确定位,预测等级为3级。【结论】参薯ARF蛋白结构的特殊性为其执行物质转运和参与信号转导功能奠定基础。; 高洪昌黄小龙陈银华许云吴文嫱谢俊黄东益; 关键词：生物信息学聚类分析蛋白结构

一株产纤维素酶细菌的分离鉴定及产酶条件初探被引量：1: 2014年; 对从海南大学薯蓣种质资源圃的不同大薯根部土壤中分离的产纤维素酶细菌X-6进行鉴定及产酶条件研究。采用细胞学染色、生理生化指标、16S rRNA基因序列同源性分析测定等方法对菌株进行鉴定,并采用正交试验研究培养时间、温度、pH值和碳氮比等因素对菌株产纤维素酶活力的影响,初步确定其产纤维素酶的最优条件组合。菌株X-6鉴定为蜡状芽孢杆菌、革兰氏阳性菌,菌株芽孢着生在细菌中部位置,淀粉酶、明胶水解酶阳性。GenBank中X-6菌株的16S rRNA基因序列与HQ844479 Bacillus cereus strain JSYM28相似性最高(99%)。菌株的最优培养条件为:培养基碳氮比为2∶4,pH 7.0,42℃培养72 h,在此条件下CMC酶活力和滤纸酶活力分别为137.10、171.07 U/mL。; 许云汪倩易太鲜赵同建; 关键词：纤维素酶产酶条件

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海南省自然科学基金(310024)