国家重点基础研究发展计划(2003CB514108)
- 作品数：5 被引量：12H指数：2
- 相关作者：吴玉章王晴黎万玲姜曼周芙蓉更多>>
- 相关机构：第三军医大学空军总医院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- SARS冠状病毒N蛋白HLA-A^＊0201限制性CTL表位的预测被引量：5
- 2004年
- 目的 预测SARS冠状病毒N蛋白的HLA A 0 2 0 1限制性CTL表位。方法 用人工神经网络和量化矩阵相结合的方法预测出HLA A 0 2 0 1结合肽 ,再用蛋白酶体矩阵法从中筛选出CTL表位。结果 预测出了 6个九肽CTL表位。结论 通过对SARS冠状病毒N蛋白抗原CTL表位进行预测 ,从而为SARS冠状病毒N蛋白之CTL表位的实验探测和鉴定提供了线索 。
- 王晴周芙蓉吴玉章
- 关键词：N蛋白HLACTL表位人工神经网络
- SARS冠状病毒M蛋白HLA-A*0201限制性CTL表位的预测被引量：6
- 2004年
- 目的 预测SARS冠状病毒M蛋白的HLA A 0 2 0 1限制性CTL表位。方法 联合应用简单基序法和延展基序法。结果 预测出 4个九肽CTL表位。结论 通过对SARS冠状病毒M蛋白抗原CTL表位进行预测 ,从而为SARS冠状病毒M蛋白CTL表位的实验探测和鉴定提供了线索 。
- 王晴吴玉章
- 关键词：M蛋白HLACTL表位
- SARS冠状病毒E蛋白HLA-A^＊0201限制性CTL表位的预测
- 2004年
- 目的 预测SARS冠状病毒E蛋白的HLA A 0 2 0 1限制性细胞毒性T淋巴细胞 (CTL)表位。方法 联合应用超基序法和量化矩阵法。结果 预测出 13个九肽CTL表位。结论 通过对SARS冠状病毒E蛋白抗原CTL表位进行预测 ,从而为SARS冠状病毒E蛋白CTL表位的实验探测和鉴定提供了线索 。
- 王晴吴玉章
- 关键词：E蛋白HLACTL表位
- 体外转录制备的siRNAs对SARS-CoV复制的抑制作用
- 2005年
- 目的体外研究针对SARSCoVRNA依赖性RNA聚合酶(RNAdependentRNApolymerase,RdRp)的小干扰RNA(SmallinterferenceRNA,siRNA)对SARSCoV感染的抑制效应。方法利用Ambion公司在线设计工具,设计出4条针对RdRp基因的siRNAs,并在体外利用试剂盒进行转录合成。在SARSCoV感染前1d,将这4条体外转录的siRNAs用Lipofectamine2000试剂转染入VeroE6细胞中。感染后,每天观察感染细胞的细胞病变效应(Cytopathiceffect,CPE)。第5天,用空斑形成实验(Plaqueformationunit,PFU)检测感染细胞培养上清液中SARSCoV滴度。结果CPE结果显示,在感染后的前4d,各siRNAs均能有效地保护细胞免受感染;在第5天,4条siRNAs中有3条仍能有效保护细胞不被感染。PFU实验结果显示,在第5天,所有siRNAs转染的细胞培养上清液中,SARSCoV的滴度均显著低于阳性对照(P<0.001)。结论实验结果表明针对SARSCoV的RdRp基因的siRNAs能有效而特异地抑制该病毒在哺乳动物细胞中的复制和繁殖,提示如果应用合适的给药途径,RNAi策略可以用于体内抑制SARSCoV的感染。
- 石孝民周高标毛丽伟姜曼黎万玲何仰东吴玉章倪兵
- 关键词：RNA干扰小干扰RNA
- CT抗原KM-HN-1 HLA-A*0201限制性表位预测及其与HLA-A*0201结合强度分析被引量：2
- 2006年
- 目的通过对CT抗原（cancer-testis antigen）KM-HN-1进行HLA-A＊0201限制性表位预测，并对候选表位肽与HLA-A＊0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析，为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础。方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法PAProc及基于肽MHC-I结合的算法BIMAS和SYFPEITHI对KM-HN-1进行HLA-A＊0201限制性表位预测．合成KM-HN-1相关候选表位肽KM-HN-I321-329（KLLPFRETV），KM-HN-I303-211，（FLPTAPPNV），KM-HN-I629-637。（TLLQIIETV），KM-HN-I87-95（ILNKSIIEV），KM-HN-I538-596。（QMMEALDQL）及阳性对照肽HBVcAg18-27（FLPSDFFPSV）；对这些合成肽与HIA-A＊0201分子结合亲和力及其复合物稳定性根据文献报道的方法进行分析。结果KM-HN-I321-329（KLLPERETV）结合亲和力最低，KM-HN—I203-211（FLPTAPPNV）结合亲和力最高，其余3条肽结合亲和力介于2者之间；稳定性实验（DC50）结果显示：KM-HN-I538—546（QMMEALDQL）DC50小于2h，KM—HN-I321-329（KLLPERETV）的DC50介于2～4h之间，KM-HN-I87-95。（ILNKSIIEV）的DC50介于6～8h之间，KM-HN-I233-211（HLPTAPPNV）及KM-HN-I629—633（TLLQIIETV）的DC50均大于8h。结论基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法及基于肽MHC-I结合的算法对KM-HN-1进行HLA-A＊0201限制性表位预测，结合候选表位肽与HLA-A＊0201分子结合的亲和力与复合物稳定性实验分析，为该抗原HLA-A＊0201限制性表位的鉴定奠定了基础。
- 王昊亮付晓岚姜曼黎万玲唐艳吴玉章
- 关键词：CT抗原表位预测
